ان اليابان مثل البلدان الاخرى قد واجهت نزاعات تتعلق بالاختصاصات بين الوكالات المختصة بالسياسة الخارجية والدفاع والشرطة والتي اعاقت تجميع المعلومات الاستخبارية وتحليلها ولكن مع انشاء مجلس الأمن الوطني فإن كل وزارة ووكالة سوف ترسل معلومات الامن الوطني المهمة الى الامانة العامة الجديدة والتي ستقوم بدورها باجراء تحليل متكامل واصدار تقارير لرئيس الوزراء واخرين .
Japan heeft, net zoals andere landen, rechterlijke disputen meegemaakt tussen buitenlands beleids-, defensie- en politie instanties die het verzamelen en de analyse van inlichtingen informatie hebben gehinderd. Maar met de creatie van de NSC zal elk ministerie en instelling belangrijke informatie over de nationale veiligheid rapporteren aan het nieuwe secretariaat, wat dan vervolgens een geïntegreerde analyse zal uitvoeren en rapport uit zal brengen aan de premier en anderen.