ونتيجة لهذا، فعندما بدأت حرب الشيشان الثانية في عام 1999، لم تعد المعركة تدور حول استقلال الشيشان عن روسيا فحسب؛ بل تحولت إلى قِتال في سبيل الإسلام ضد المسيحيين في كل مكان. ومرة أخرى نجحت روسيا، في عهد فلاديمير بوتن، خليفة يلتسين، في إلحاق الهزيمة بالانفصاليين، واستعادة السيطرة الفيدرالية على الإقليم. وبعد خمسة عشر عاما، يقاتل المتطرفون الشيشان الآن جنباً إلى جنب مع تنظيم الدولة الإسلامية.
Als gevolg daarvan ging de strijd, toen de tweede Tsjetsjeense oorlog in 1999 begon, niet langer uitsluitend over de Tsjetsjeense onafhankelijkheid van Rusland; het was een strijd voor de Islam, die tegen christenen overal ter wereld werd gevoerd. Onder de opvolger van Jeltsin, Vladimir Poetin, versloeg Rusland de separatisten opnieuw en wist het de federale controle over het grondgebied te herstellen.