الإرث الاستعماري أيضاً من بين العوامل التي تساعدنا في فهم الطبيعة السلبية نسبياً للمسلمين في جنوب الصحراء الكبرى في أفريقيا. فقد كان ترسيم الحدود على نحو اعتباطي استبدادي من قِـبَل القوى الاستعمارية سبباً في الجمع من غير تمييز بين مجموعات عرقية مختلفة، ربما اشتهرت تاريخياً بالعداوة فيما بينها، في دولة واحدة. كما عمل الاقتصاد السياسي الاستعماري على تركيز عمليات "التنمية" في المناطق الغنية بالموارد الطبيعية، بينما أهمل المناطق التي تفتقر إلى الموارد وأهل تلك المناطق، الذين كانوا من المسلمين في كثير من الأحوال.
Die willkürliche Grenzziehung durch die Kolonialmächte führte dazu, dass innerhalb von ein und denselben Staaten unterschiedliche – möglicherweise historisch verfeindete – ethnische Gruppen zusammengeworfen wurden. Die politische Ökonomie der Kolonialzeit führte außerdem zu einer Konzentration wirtschaftlichen Fortschritts in ressourcenreichen Gebieten, während die ressourcenarmen Regionen und ihre Bevölkerungen – in vielen Fällen Muslime – vernachlässigt wurden.