ولكن ظلت هناك مشاكل خطيرة مشتركة بين الجانبين. فقد كانت الحكومة التركية ساخطة بسبب إهمال قوات الاحتلال الأميركية للقواعد العسكرية التابعة للمتمردين الانفصاليين الأكراد في شمال العراق، والذين دخلوا ضد تركيا في حرب دامت 15 عاماً. وعلى نحو أكثر اتساعاً، فإن الحكومة التركية تتهم الولايات المتحدة بأنها لينة الجانب أكثر مما ينبغي فيما يتصل بالتطورات السياسية الكردية، وأنها لا تلقي بالاً إلى قلق تركيا بشأن استقلال الأكراد. ومن جانب الولايات المتحدة فهي غير راضية عن اعتراضات الحكومة التركية على استخدام أميركا لقاعدة إنكيرليك الجوية في جنوب تركيا بلا قيد أو شرط، علاوة على التوترات الأخيرة بين الحكومة التركية وإسرائيل.
Allgemein betrachtet die türkische Regierung die USA als zu untätig gegenüber den politischen Entwicklungen bei den Kurden und als zu unbeeindruckt von den türkischen Bedenken gegen die Unabhängigkeit der Kurden. Die USA ihrerseits sind unglücklich über die Einwände der türkischen Regierung gegen eine uneingeschränkte Nutzung des Luftwaffenstützpunktes Incirlik in der Südosttürkei sowie über die jüngsten Spannungen mit Israel.