فبادئ ذي بدء، كان السجناء الذي يخرقون القواعد أو يمارسون العنف في الكاتراز يعاقبون بوضعهم في زنازين انفرادية بلا نوافذ؛ أما في جوانتانامو فإن كل الزنازين التي سُمِح للصحفيين بمشاهدتها تفتقر إلى النوافذ أو أي إضاءة طبيعية. وكان الحبس الانفرادي في مثل هذه الزنازين بسجن الكاتراز هو أقسى أشكال العقاب، ولم تستخدم لأكثر من 48 ساعة في المرة. أما في جوانتانامو ــ وفي مرافق أميركية أخرى ــ يتم وضع السجناء في الحبس الانفرادي لأيام أو أسابيع متصلة، وهو ما قد يؤدي إلى إصابتهم بالذهان.
Zunächst einmal wurden Gefangene, die sich in Alcatraz nicht an die Regeln hielten oder gewalttätig waren, bestraft, indem sie in „Block D“ untergebracht wurden, wo die Zellen keine Fenster hatten; in Gitmo sind in sämtlichen Zellen, die Journalisten gezeigt werden, weder Fenster noch natürliches Licht vorhanden. Die Isolationshaft in Block D wurde als schwerste Bestrafung angesehen und niemals länger als 48 Stunden am Stück angewandt.