أما التحدي الثاني فيكمن في فهم الكيفية التي تتفاعل بها الجينات فيما بينها أو مع عوامل أخرى لإنتاج حالة معينة، وهو ما ينبغي أن يمكننا من التوصل إلى تدابير وقائية جديدة أو علاجات تستند إلى التفاصيل الخاصة بكيفية بداية نشوء الحالة وتطورها. وهذا بطبيعة الحال أكثر إثارة للاهتمام ـ وتنفيذه أشد صعوبة. فهذا يشكل بمعنى من المعاني الفارق بين مطابقة الكلمات المتماثلة في نَصٍ ما وبين فهم النص بالكامل.
Die zweite Herausforderung besteht darin zu verstehen, wie die Gene untereinander oder mit anderen Faktoren interagieren, um die Erkrankung hervorzurufen. Dieses Verständnis sollte basierend auf den Details, wie die Erkrankung beginnt und wie sie fortschreitet, die Entwicklung neuer präventiver Maßnahmen oder Behandlungsmethoden ermöglichen.