بيد أن افتراضات أخرى أصبحت مهددة. على سبيل المثال، في تمثيل "شجرة الحياة" التقليدي للتطور، تتباعد الفروع دوما، ولا تندمج أبدا، وهو ما يعني ضمناً أن أصل الأنواع يتبع مساراً خطيا، وأن كل التغيرات النشوئية على طول هذا المسار تحدث ضمن النسب الذي يجري تتبعه. ولكن دراسة الجينوم ــ وبخاصة لدى الميكروبات ــ أظهرت أن الجينات المنتقلة بين كائنات حية بعيدة الصلة تشكل محفزاً مهماً للتغير النشوئي.
In der traditionellen Darstellung der Evolution als “Lebensbaum” beispielsweise bewegen sich die Zweige immer voneinander weg, ohne sich wieder zu vereinigen, was nahelegt, dass die Abstammung der Arten einem linearen Pfad folgt, und dass alle evolutionären Änderungen auf diesem Pfad innerhalb der jeweiligen Abstammungslinie stattfinden. Aber Untersuchungen an Genomen – insbesondere denen von Mikroben – haben ergeben, dass Gene, die zwischen entfernt verwandten Organismen ausgetauscht werden, wichtige Katalysatoren des evolutionären Wandels sind.