تتميز منظمتا حماس والجهاد الإسلامي بالتنظيم الدقيق والانضباط، وتفرض كل منهما سيطرة صارمة على أجنحتها السياسية والعسكرية. وعلى الرغم من الضعف الذي لحق بمنظمة حماس من جرّاء الاغتيالات الإسرائيلية التي استهدفت من بين من استهدفت الشيخ أحمد ياسين و عبد العزيز الرنتيسي ، إلا أنها ما زالت تحتفظ بقدرات عسكرية قوية وتأييد شعبي يتراوح ما بين 25 إلى 30%، مما يجعل منها ثاني أكبر طائفة من حيث الريادة في الضفة الغربية وغزة.
Jak Hamás, tak Islámský džihád jsou silně disciplinované organizace, jež mají svá politická a vojenská křídla pevně pod kontrolou. Přestože je Hamás oslaben izraelskými cílenými atentáty na šejka Ahmeda Jasína a Abdala Azíze Rantisího, uchovává si značnou vojenskou sílu a lidovou podporu mezi 25 až 30%, takže jde o druhou nejsilnější frakci na Západním břehu a v Gaze.