ويعكس تورط إيران في الأمر صراعاً مختلفاً وأقدم عهدا ــ بين السُنّة والشيعة للسيطرة على الشرق الأوسط. فمع حرص إيران التي يهيمن عليها الشيعة على توفير الأسلحة والمال والقوات والتدريب لقوات الأسد، اكتسب البعد الطائفي للصراع قدراً أعظم من الأهمية. والواقع أن القوات الحكومية تحولت إلى جيش طائفي، بدافع من الخوف من إقدام المتمردين السُنّة في حال انتصارهم على إبادة الأقلية العلوية التابعة للشيعة التي حكمت سوريا عقوداً من الزمان.
Vzhledem k tomu, že šíity ovládaný Írán poskytuje Asadovým jednotkám zbraně, peníze, vojáky a výcvik, získává sektářský rozměr konfliktu větší význam. Vládní síly se skutečně proměnily v sektářskou armádu motivovanou strachem, že pokud zvítězí převážně sunnitští vzbouřenci, vyhladí alavitskou menšinu blízkou šíitům, která v Sýrii už několik desítek let vládne.