ولكن ظلت هناك مشاكل خطيرة مشتركة بين الجانبين. فقد كانت الحكومة التركية ساخطة بسبب إهمال قوات الاحتلال الأميركية للقواعد العسكرية التابعة للمتمردين الانفصاليين الأكراد في شمال العراق، والذين دخلوا ضد تركيا في حرب دامت 15 عاماً. وعلى نحو أكثر اتساعاً، فإن الحكومة التركية تتهم الولايات المتحدة بأنها لينة الجانب أكثر مما ينبغي فيما يتصل بالتطورات السياسية الكردية، وأنها لا تلقي بالاً إلى قلق تركيا بشأن استقلال الأكراد. ومن جانب الولايات المتحدة فهي غير راضية عن اعتراضات الحكومة التركية على استخدام أميركا لقاعدة إنكيرليك الجوية في جنوب تركيا بلا قيد أو شرط، علاوة على التوترات الأخيرة بين الحكومة التركية وإسرائيل.
Tureckou vládu popouzí, že americké okupační síly přehlížejí severoirácké základny PKK, kurdských separatistických povstalců, kteří už 15 let vedou válku proti Turecku. Obecněji platí, že turecká vláda považuje USA za příliš spokojené s kurdským politickým děním a za netečné vůči obavám Turecka z kurdské nezávislosti.