وحتى إذا أصبحت بعض المحاصيل ملوثة، فإن احتمالات وجود مواد دوائية فعّالة في المنتج الغذائي النهائي بمستويات كافية لإحداث تأثير سلبي على صحة الإنسان سوف ��ظل ضئيلة للغاية. إن النباتات المنتجة بطريقة الزراعة الصيدلانية البيولوجية سوف يتم تجميعها في حصاد كبير، حيث تكون المستحضرات الصيدلانية مخففة بشكل كبير. وسوف يحتاج العامل النشط بعد الحصاد إلى تحمل عمليات الطحن وغير ذلك من عمليات المعالجة، ثم الطهي، ولابد أيضاً أن يكون نشطاً عندما يتم تناوله بالفم، وهذه ليست حال أغلب العقاقير البروتينية، لأنها تهضم في المعدة.
I kdyby se však některé plodiny měly kontaminovat, pravděpodobnost, že určité aktivní léčivé látky budou obsažené v konečném potravinářském produktu v takovém množství, aby mohly mít nepříznivý dopad na lidské zdraví, zůstane velmi malá. Rostlina použitá k biopharmingu by se v takovém případě stala součástí velké sklizně, v níž by se farmaceutika silně zředila.