ومرة أخرى، رفض مبارك الرضوخ لخطط الولايات المتحدة الرامية إلى عزل ليبيا في التسعينيات بسبب تورطها في إسقاط طائرة بان آم 103 فوق لوكيربي باسكتلندا. وبدلاً من نبذ الزعيم الليبي معمر القذافي، رحب به مبارك في القاهرة. وبعد القرار الذي اتخذته الولايات المتحدة بفرض حظر دولي للطيران ضد ليبيا في عام 1992، أثبتت معابرها البرية مع مصر أهميتها الحاسمة بالنسبة للاقتصاد الليبي (بل وربما بالنسبة لبقاء القذافي سياسيا). والواقع أن ليبيا صمدت في وجه العقوبات جزئياً باستيراد المواد الغذائية ولوازم البنية الأساسية النفطية عن طريق مصر، وتصدير البترول والفولاذ بمساعدة مبارك.
A když Organizace spojených národů vyhlásila v roce 1992 zákaz mezinárodních letů do Libye, staly se pozemní pohraniční přechody mezi Libyí a Egyptem klíčovým pilířem libyjské ekonomiky (a dost možná také Kaddáfího politického přežití). Libye odolala sankcím zčásti i díky dovozu potravin a ropné infrastruktury přes Egypt a díky vývozu ropy a oceli s Mubarakovou pomocí.