إلا أن الجيش على الأرجح هو الذي سيقرر في النهاية مصير رئاسته. لقد منحت رئاسة مشرف القيادات العسكرية دوراً قوياً في صنع القرار، إلا أن سنواته الثماني في المنصب ألحقت ضرراً شديداً بالدعم الشعبي للنفوذ الذي يتمتع به الجيش داخل الحكومة. فقد أصبح افتقاره إلى الشعبية سبباً في افتقار قيادات الجيش إلى الشعبية.
Je to však armáda, kdo nakonec s největší pravděpodobností rozhodne o osudu jeho pobytu v úřadu prezidenta. Mušarafova vláda dala armádnímu velení významnou úlohu v tvorbě politik, ale jeho osm let v úřadu zle poškodilo domácí podporu vlivu armády na správu státu.