لقد اكتسبت رغبة الجنوب في الاستقلال زخماً كبيراً بسبب فشل الشمال في جعل الوحدة أمراً جذاباً من خلال الإصلاح وعقد الانتخابات الحرة، وفقاً لما نصت عليه اتفاقية السلام الشامل. ويرجع العامل الثاني وراء دفع عملية الانفصال إلى افتقار جيش التحرير الشعبي في السودان إلى الالتزام بإيديولوجية السودان الجديد التي أقرها مؤسس الجيش جون قرنق ، الذي دخل في مفاوضات اتفاقية السلام الشامل، ثم توفي في حادث سقوط طائرة في عام 2005.
Směřování jihu k nezávislosti nabralo na obrátkách kvůli neschopnosti severu zajistit reformou a volbami, aby byla jednota přitažlivá, jak stanovuje CPA. Druhým faktorem, který rozdělení země žene vpřed je, že SLOA nezachovává dostatečnou věrnost ideologii Nového Súdánu svého zakladatele Johna Garanga, který CPA dojednal a v roce 2005 zemřel při letecké havárii.