ثم جاءت أحداث الحادي عشر من سبتمبر/أيلول 2001 حين اضطر إلى التبرؤ من الجهاديين ـ تحت ضغوط مكثفة من جانب الولايات المتحدة لحمله على دعم الانتقام الأميركي في أفغانستان أو مواجهة العواقب. ومن المعروف أن حركة طالبان، التي وجد أسامة بن لادن في حكمها لأفغانستان ملاذاً آمناً، تأسست على يد عناصر من جهاز الاستخبارات الداخلية الباكستاني. ولكي يحافظ على تحالف بلاده مع القوة العظمى المنفردة في العالم (وأكبر جهة مانحة لبلاده)، اضطر مُـشَرَّف إلى خيانة أنصاره.
Pak přišlo 11. září a pod intenzivním tlakem ze Spojených států, aby podpořil americkou odvetu v Afghánistánu, anebo čelil důsledkům, byl přinucen se svých chráněnců zříct. Tálibán, pod jehož vládou našel Usáma bin Ládin bezpečné útočiště, vytvořila (a v rozhodujících bojích vedla) pákistánská vojenská tajná služba ISI.