Сред причините за това положение са: първо, късното приемане на регламента за ЕФР; второ, забавеното приемане на оперативните програми, някои от които бяха одобрени през втората половина на 2008 г.; трето, проблемите със създаването на системите за управление и контрол, чието одобрение е предварително условие за отчитане на плащанията пред Комисията и, четвърто, последиците от финансовата и икономическа криза за сектора на рибарството.
Pirmkārt, tas ir tāpēc, ka EZF regulējums tika pieņemts vēlu, otrkārt, tāpēc, ka novēloti tika pieņemtas darbības programmas, un dažas no tām tika pieņemtas 2008. gada otrajā pusē; treškārt, ir jāpiemin problēmas saistībā ar pārvaldības un kontroles sistēmu izveidi, turklāt šīs sistēmas ir jāapstiprina, jo tas ir priekšnosacījums tam, lai veiktu maksājumus Komisijai, un, ceturtkārt, ir jāpiemin finanšu un ekonomikas krīzes ietekme uz zivsaimniecības nozari.