Програмата от Стокхолм също ясно определя, че във връзка със създаването на обща европейска система за предоставяне на убежище по-голямото хармонизиране следва да остане една от основните политически цели на ЕС.
Arī Stokholmas programmā tika skaidri norādīts, ka attiecībā uz kopējas Eiropas patvēruma sistēmas izveidi lielākai saskaņotībai joprojām ir jābūt vienam no ES politikas pamatmērķiem.