Отношенията между Парламента и Комисията бяха силно променени след приемането на Договора от Лисабон, като Парламентът придоби по-големи правомощия по различни въпроси, особено тези, свързани с обикновената законодателна процедура и бюджетните въпроси, както и по-силна роля по отношение на външната политика на Европейския съюз.
Pēc Lisabonas līguma stāšanās spēkā Parlamenta un Komisijas attiecības ir krietni mainījušās, un Parlamentam ir lielākas pilnvaras dažādos jautājumos, jo īpaši tajos, kas ir saistīti ar parastu likumdošanas procesu, un budžeta jautājumos, un lielāka loma ES ārpolitikā.