На практика обаче пред държавите-членки и нечленки от региона стоят множество предизвикателства, свързани с реалното изпълнение и координиране не само по приоритетите, но и по механизмите за финансиране, за възлагането, отчитането и контрола на изпълнението.
Taču praksē Eiropas Savienības dalībvalstis un trešās valstis šajā reģionā sastopas ar daudzām faktiskās īstenošanas un koordinācijas problēmām ne tikai saistībā ar prioritātēm, bet arī finansēšanas mehānismiem, finansējuma piešķiršanu, pārskatatbildību un īstenošanas uzraudzību.