Наличието на клаузи за минимална хармонизация води до фрагментарност на регулаторната рамка, препятстваща процеса на доизграждане на единния пазар.
Minimālās saskaņošanas noteikumu dēļ reglamentējošo noteikumu sistēma ir sadrumstalota, traucējot pabeigt vienotā tirgus izveidi.