Стратегията ще бъде разработена въз основа на шест подцели, насочени към разглеждането на някои от основните движещи сили на законите за биоразнообразието и на различните видове натиск, на които е подложено биоразнообразието: опазването на природата, възстановяването и "зелената" инфраструктура, селското стопанство и лесовъдството, рибарството, инвазивните видове и приноса на Европейския съюз към глобалното биоразнообразие.
A stratégiát hat alcél körül alakították ki, amelyek a biológiai sokféleséggel kapcsolatos szabályok fő mozgatórugói némelyikének, valamint a biológiai sokféleségre nehezedő nyomások kezelésére összpontosítanak: természetvédelem, helyreállítás és környezetbarát infrastruktúra, mezőgazdaság és erdészet, halászat, invazív idegen fajok és az Európai Unió hozzájárulása a globális biológiai sokféleséghez.