За да се запази това много крехко равновесие, директивата трябваше да бъде транспонирана с най-голямо внимание. Това предизвика проблеми за много държави-членки, като например трудности при прилагането на пунктовете за единен контакт и процеса на взаимно оценяване.
E felettébb törékeny egyensúly megőrzése érdekében igen lényeges volt, hogy az átültetés a lehető legpontosabban menjen végbe, ami némi problémát okozott számos tagállamnak; ilyen nehézség volt az egyablakos ügyintézési pontok létrehozása vagy a kölcsönös értékelési folyamat bevezetése.