Сред причините за това положение са: първо, късното приемане на регламента за ЕФР; второ, забавеното приемане на оперативните програми, някои от които бяха одобрени през втората половина на 2008 г.; трето, проблемите със създаването на системите за управление и контрол, чието одобрение е предварително условие за отчитане на плащанията пред Комисията и, четвърто, последиците от финансовата и икономическа криза за сектора на рибарството.
For det andet blev vedtagelsen af de operationelle programmer forsinket, idet nogle af dem blev vedtaget i anden halvdel af 2008. For det tredje var der problemer med at få etableret forvaltnings- og kontrolsystemerne - og det er en forudsætning, at de er godkendt, for at der kan sendes betalinger til Kommissionen.