Всъщност Договорът предоставя ново правно основание, посредством което един нов регламент би могъл да замени съществуващата Конвенция за използване на информационните технологии за митнически цели ("Конвенция CIS") - регламент, който би имал пряко влияние върху държавите-членки и който няма да изисква транспониране в националното законодателство, преди да бъде въведен, какъвто понастоящем е случаят с Регламент (ЕО) № 766 от 2008 г. относно административната част на митническата информационна система.
Lissabontraktaten indfører et nyt retsgrundlag, således at en ny forordning kan erstatte den nuværende CIS-konvention, en forordning, som ville have direkte virkning over for medlemsstaterne og ikke kræve gennemførelse i national lov, før den træder i kraft, som det er tilfældet med forordning (EF) nr. 766/2008 om den administrative del af CIS.