Бяха изказани също и опасения относно институционални въпроси като този дали разрастването на ЕАО ще доведе до намаляване на числеността на армиите на някои държави-членки и дали това ще бъде в противоречие с компетентността и целите на Европейската служба за външна дейност.
Der har også været udtalt frygt i forbindelse med institutionelle forhold, som f.eks. om EDA's vækst vil medføre en reduktion i størrelsen af visse medlemsstaters hære, om der ikke ville være et sammenstød med Tjenesten for EU's Optræden Udadtils ansvarsområde og mål.