В същото време е спорно как понякога противоречащи си цели от дунавската стратегия като качеството на водите, подобряването на състоянието на околната среда, корабоплаването, потреблението на енергия или екотуризма, могат да бъдат хармонизирани.
En même temps, rien ne garantit que les objectifs parfois contradictoires de la stratégie pour le Danube, tels que la qualité de l'eau, l'amélioration de l'état de l'environnement, la navigabilité, l'exploitation des ressources énergétiques ou l'écotourisme, peuvent être harmonisés.