В същото време е спорно как понякога противоречащи си цели от дунавската стратегия като качеството на водите, подобряването на състоянието на околната среда, корабоплаването, потреблението на енергия или екотуризма, могат да бъдат хармонизирани.
No entanto, é duvidoso que se consiga, em certos casos, harmonizar objectivos contraditórios definidos na Estratégia para a Região do Danúbio, nomeadamente a qualidade da água, o estado do ambiente, a navegabilidade, a exploração das energias ou o ecoturismo.