След влизането в сила на регламента беше създадена Европейската агенция за управление на оперативното сътрудничество по външните граници на държавите-членки на Европейския съюз (Frontex), чиито основни задачи са да координира оперативното сътрудничество между държави-членки в областта на управлението на външните граници; да подкрепя държавите-членки за обучението на националните граничари; да извършва анализи на риска; да следи за напредъка в изследванията в областта на контрола и наблюдението на външните граници; да подкрепя държавите-членки при обстоятелства, които изискват засилена техническа и оперативна помощ по външните граници и да им предоставя необходимата подкрепа за организирането на съвместни операции по екстрадиция.
Desde a entrada em vigor do regulamento, foi criada a Agência Frontex, que tem por missão coordenar a cooperação operacional entre os Estados-Membros na área da gestão das fronteiras externas; prestar assistência aos Estados-Membros na formação de guardas fronteiriços nacionais; realizar análises de risco; monitorizar o desenvolvimento do controlo das fronteiras externas e investigação na área da vigilância; prestar assistência aos Estados-Membros em circunstâncias que exijam maior assistência técnica e operacional nas fronteiras externas e proporcionar-lhes o apoio necessário na organização de operações conjuntas de repatriamento.