За разположената временно в Брюксел агенция регламентът предвижда поемането inter alia на следващите задължения, които се преразглеждат в момента: управление на договора с оператора, натоварен с управлението на Европейската геостационарна служба за навигационно покритие (EGNOS), наследена от съвместното предприятие "Галилео"; координиране на действията на държавите-членки относно честотата на използване, необходима за функционирането на системата; сътрудничество с Комисията във връзка с изготвяне на предложения за програмата; модернизиране на системата; управление на всички аспекти във връзка със системата за защита и безопасност; дейности като одобряване на безопасност от Европейския надзорен орган на глобалната навигационна спътникова система и управление на научноизследователската дейност за развитие и насърчаване на европейските програми ГНСС.
Organ ma tymczasową siedzibę w Brukseli; zgodnie z rozporządzeniem wykonuje on między innymi następujące obowiązki (podlegające obecnie rewizji): zarządzanie kontraktem z operatorem, któremu powierzono zarządzanie europejskim systemem wspomagania satelitarnego (EGNOS) odziedziczonym po wspólnym przedsiębiorstwie Galileo; koordynację działań państw członkowskich związanych z częstotliwościami niezbędnymi do działania systemu; współpracę z Komisją w zakresie opracowywania wniosków związanych z programem; modernizację systemu; zarządzanie wszystkimi aspektami związanymi z ochroną i bezpieczeństwem systemu; spełnianie roli europejskiego organu zatwierdzającego bezpieczeństwo GNSS; oraz zarządzanie działalnością badawczą niezbędną w celu rozwoju i promowania europejskich programów GNSS.