Разходите за изграждането и поддръжката на системите за управление и контрол, както и на разходите за администрирането на тези системи, поставят значителна тежест върху бюджетите на държавите-членки.
Juhtimis- ja järelevalvesüsteemide loomise ja ülalpidamise kulud ning nende süsteemide haldamise kulud tekitavad suure koormuse liikmesriikide eelarvele.