Проблемите с адаптирането на съществуващото законодателство към разпоредбите на Договора от Лисабон са от изключителна важност, особено за политиките, които не са били приети съгласно процедурата за съвместно вземане на решения, като например, в областта на селското стопанство и рибарството.
Kõige olulisemad on probleemid, mis kaasnevad, eksisteerivad seadusandluse kohandamisega Lissaboni lepingu sätetega ning seda just selliste poliitiliste suuniste puhul nagu põllumajanduse ja kalanduse suunised, mida ei ole veel kaasotsustamisemenetlusega vastu võetud.