Недостатъците на новото споразумение са в увеличаването на вноската, която трябва да плащат корабособствениците, в по-ниската рентабилност за ЕС, отколкото при други споразумения в областта на рибарството относно рибата тон и в непроменената финансова подкрепа от ЕС в замяна на по-ниски квоти за улов.
Uue lepingu puudusteks on laevaomanike maksete suurendamine, väiksem tasuvus ELi jaoks võrreldes teiste tuunipüügilepingutega ning väiksemate püügikvootide juures ELi rahalise toetuse suuruse säilimine.