Стратегията ще бъде разработена въз основа на шест подцели, насочени към разглеждането на някои от основните движещи сили на законите за биоразнообразието и на различните видове натиск, на които е подложено биоразнообразието: опазването на природата, възстановяването и "зелената" инфраструктура, селското стопанство и лесовъдството, рибарството, инвазивните видове и приноса на Европейския съюз към глобалното биоразнообразие.
Strateegia raamistiku moodustab kuus alleesmärki, millest igaüks keskendub mõnele peamisele bioloogilise mitmekesisuse edendajale ja bioloogilist mitmekesisust ohustavale probleemile: looduskaitse, taastamine ja keskkonnasõbralik infrastruktuur, põllumajandus ja metsandus, kalandus, invasiivsed liigid ja Euroopa Liidu panus ülemaailmsesse bioloogilisse mitmekesisusse.