По исторически причини законодателството по отношение на фармацевтичната промишленост е под надзора на Генерална дирекция "Предприятия и промишленост" и члена на Комисията, отговарящ за промишлеността.
Ajaloolistel põhjustel on farmaatsiaalaste õigusaktide üle järelevalvet teostanud tööstuse peadirektoraat ja tööstusvolinik.