Въпреки постиженията от последните години - като например, мрежата "Натура 2000" - биоразнообразието на ЕС продължава да се намира под непрестанен натиск от разрушаването на местообитанията, замърсяването, изменението на климата и въздействието на нахлуващите видове.
Vaatamata sellele, et viimastel aastatel on toimunud mõningaid positiivseid muutusi, mille üks näide on Natura 2000 võrgustik, on Euroopa Liidu bioloogiline mitmekesisus ikka veel pideva surve all, mille põhjuseks on elupaikade hävitamine, saastatus, kliimamuutus ja võõrliikide mõju.