В същото време е спорно как понякога противоречащи си цели от дунавската стратегия като качеството на водите, подобряването на състоянието на околната среда, корабоплаването, потреблението на енергия или екотуризма, могат да бъдат хармонизирани.
Al mismo tiempo cabe preguntarse cómo podrán armonizarse algunos objetivos en ocasiones contradictorios que figuran en la estrategia para el Danubio, como la calidad del agua, mejorar el estado del medio ambiente, la navegabilidad, la explotación de la energía o el ecoturismo.