Както и при други предприятия в началния етап от съществуването си, в SESAR все още не са въведени и не работят изцяло системите за вътрешен контрол и финансова информация.
Podobne ako iné podniky v počiatočnej fáze, ani SESAR ešte neuviedol svoj systém vnútornej kontroly ani systém pre finančné informácie celkom do plného prevádzkového stavu.