Всъщност Договорът предоставя ново правно основание, посредством което един нов регламент би могъл да замени съществуващата Конвенция за използване на информационните технологии за митнически цели ("Конвенция CIS") - регламент, който би имал пряко влияние върху държавите-членки и който няма да изисква транспониране в националното законодателство, преди да бъде въведен, какъвто понастоящем е случаят с Регламент (ЕО) № 766 от 2008 г. относно административната част на митническата информационна система.
Lisabonská zmluva v podstate poskytuje nový právny rámec, na základe ktorého by nové nariadenie mohlo nahradiť súčasný dohovor o CIS, pričom toto nariadenie by malo priamy vplyv v členských štátoch a pred vstúpením do platnosti by nevyžadovalo transpozíciu do vnútroštátneho práva, ako je to v prípade Nariadenia (ES) č. 766/2008 o administratívnej časti CIS.