Крайната цел на междуведомствената работна група е постепенно да изработи общо споразумение между трите институции на ЕС по различните предстоящи въпроси.
Konečným cieľom medziinštitucionálnej pracovnej skupiny je, aby tieto tri inštitúcie EÚ prostredníctvom postupného procesu dospeli k všeobecnej zhode v rôznych aktuálnych otázkach.