Сметната палата отново е установила голям брой трансфери на бюджетни кредити (49 през 2009 г., 52 през 2008 г. и 32 през 2007 г.). Ето защо е желателно Агенцията да подобри своите процедури за планиране и мониторинг, за да намали броя на трансферите.
Treba však zdôrazniť, že Dvor audítorov v roku 2009 opätovne zistil vysoký počet rozpočtových presunov (49 v roku 2009, 52 v roku 2008 a 32 v roku 2007), preto je potrebné, aby agentúra EMSA zlepšila plánovanie a monitorovanie a znížila tak počet rozpočtových presunov.