Hlavními cíli agentury je sbírat, analyzovat a zveřejňovat objektivní, spolehlivé a srovnatelné informace o situaci základních práv v Evropské unii, zlepšovat srovnatelnost a spolehlivost údajů s využitím nových metod a pravidel, provádět anebo prosazovat výzkumné činnosti a studie v oblasti základních práv, formulovat a zveřejňovat závěry a stanoviska ke konkrétním tématům, ať už ze své vlastní iniciativy nebo na žádost Evropského parlamentu, Rady nebo Komise, a podporovat dialog s občanskou společností, díky němuž bude široká veřejnost se základními právy lépe obeznámená.
Principalele sarcini ale Agenției sunt de a colecta, analiza și publica informații obiective, fiabile și comparabile privind situația drepturilor fundamentale în UE; de a îmbunătăți comparabilitatea și fiabilitatea informațiilor folosind metode și norme noi; de a efectua și/sau promova munca de cercetare și studiile în domeniul drepturilor fundamentale; de a formula și publica concluzii și avize pe teme specifice, fie din proprie inițiativă, fie la cererea Parlamentului European, a Consiliului sau a Comisiei; și de a promova dialogul cu societatea civilă, în scopul de a sensibiliza publicul larg cu privire la drepturile fundamentale.