Този важен подход обаче в много случаи има вероятност да бъде затруднен от значителната автономия и силната конкуренция, които съществуват между различни органи, отговарящи за управлението на всяка еднофондова програма.
Tačiau šį bendrą metodą daugeliu atvejų gali sužlugdyti didžiulis autonomiškumas ir didžiultarp įvairių valdžios institucijų, kurios atsakingos už visų vieno fondo programų valdymą, konkurencija.