Във връзка със структурните фондове, когато се прави сравнение с анализите на Сметната палата за периода 2000-2006 г., се вижда, че системите за управление и наблюдение и контрол за периода 2007-2013 г. предвиждат по-строги разпоредби и гарантират по-голяма надеждност и прозрачност по отношение на разходите, както и по-добра отчетност от страна на държавите-членки.
Struktūrinių fondų atveju, palyginti su 2000-2006 m. laikotarpio Audito Rūmų atlikta analize, 2007-2013 m. laikotarpio valdymo ir kontrolės sistemose valstybėms narėms keliami griežtesni ir didesni išlaidų patikimumo ir skaidrumo, taip pat atskaitomybės reikalavimai.