Заедно с много положителни елементи либерализацията обаче донесе и известна степен на занижаване на безопасността във вид на фрагментиране на отделни дружества, разделянето на инфраструктурата и дейностите, възлагането на работата по поддръжката на външни подизпълнители и наемане на материали и персонал.
Tačiau nepaisant daugybės teigiamų geležinkelių sektoriaus liberalizavimo aspektų, sauga geležinkeliuose tam tikru mastu suprastėjo ir tai lėmsistemos suskilimas į pavienes įmones, infrastruktūros ir veiklos padalijimas, transporto priemonių priežiūros paslaugų bei medžiagų ir darbo jėgos nuoma.