След влизането в сила на регламента беше създадена Европейската агенция за управление на оперативното сътрудничество по външните граници на държавите-членки на Европейския съюз (Frontex), чиито основни задачи са да координира оперативното сътрудничество между държави-членки в областта на управлението на външните граници; да подкрепя държавите-членки за обучението на националните граничари; да извършва анализи на риска; да следи за напредъка в изследванията в областта на контрола и наблюдението на външните граници; да подкрепя държавите-членки при обстоятелства, които изискват засилена техническа и оперативна помощ по външните граници и да им предоставя необходимата подкрепа за организирането на съвместни операции по екстрадиция.
Priėmus šį reglamentą buvo įsteigta agentūra FRONTEX, kurios paskirtis yra koordinuoti operatyvų valstybių narių bendradarbiavimą išorės sienų valdymo srityje; padėti valstybėms narėms apmokyti valstybės sienos apsaugos darbuotojus; atlikti rizikos analizę; stebėti išorės sienų kontrolės plėtrą ir priežiūros tyrimus; padėti valstybėms narėms aplinkybėmis, kurios reikalauja didesnės techninės ir operatyvinės pagalbos prie išorės sienų, ir teikti joms reikalingą paramą organizuojant bendras grąžinimo operacijas.