Основната задача на агенцията е да събира, анализира и публикува обективна, надеждна и сравнима информация относно състоянието на основните права в ЕС; да подобрява сравнимостта и надеждността на данните, като използва нови методи и правила; да провежда и/или да насърчава научноизследователската работа и проучвания в областта на основните права; да формулира и публикува заключения и становища по конкретни въпроси или по собствена инициатива, или по искане на Европейския парламент, Съвета или Комисията и да стимулира диалога с гражданското общество, за да запознае обществеността по-добре с основните права.
Pagrindiniai Agentūros uždaviniai yra šie: rinkti, analizuoti ir skelbti objektyvią, patikimą ir palyginamą informaciją apie pagrindinių teisių padėtį ES; gerinti duomenų palyginamumą ir patikimumą taikant naujus metodus ir taisykles; vykdyti ir (arba) remti pagrindinių teisių srities mokslinį tiriamąjį darbą ir tyrimus; savo iniciatyva arba Europos Parlamento, Tarybos ar Komisijos prašymu formuluoti ir skelbti išvadas ir nuomones konkrečiais klausimais; skatinti dialogą su pilietine visuomene siekiant padidinti visuomenės sąmoningumą žmogaus teisių klausimais.