Трябва да се отбележи, че изпълнението на програмите за териториално сътрудничество в момента е затруднено от участието на много и различни органи.
Atkreiptinas dėmesys į tai, kad šiuo metu teritorinio bendradarbiavimo programų įgyvendinimas yra apsunkintas, kadangi jas įgyvendinant dalyvauja daugybskirtingų institucijų.