Още по-спорен е фактът, че за 2009 г. Сметната палата констатира трудности в изпълнението на работната програма на органа.
Dar prieštaringesnis yra faktas, kad Audito Rūmai pranešapie sunkumus įgyvendinant agentūros 2009 m. veiklos programą.