От една страна, тя е изправена пред военни и стратегически предизвикателства, активизирането на прояви на насилие сред бивши военни ръководители от движението за отделяне, намеса от страна на някои милиции, приватизация на вътрешната сигурност, гранични инциденти със суданци мюсюлмани, както и проблема за подялбата на приходите от петрола с ислямския Север.
Viena vertus, susiduriama su kariniais ir strateginiais iššūkiais, konfliktų tarp buvusių atsiskyrimo judėjimo karo vadų, kai kurių neformalių karinių grupuočių įsikišimo, interneto saugos privatizavimo, susidūrimų pasienyje su islamiškuoju Sudanu galimybe ir problemomis, susijusiomis su pajamų iš naftos pasidalijimu.