On October 31, 2016, İstanbul Chief Public Prosecutor's Office began investigating Cumhuriyet Foundation executives on charges of "Making publications that justify July 15 coup attempt" and "committing crime for PKK/KCK and FETÖ/PDY as non members".
Tutuklular: Genel Yayın Yönetmeni Murat Sabuncu, köşe yazarı Kadri Gürsel, Cumhuriyet Gazetesi İcra Kurulu Başkanı avukat Akın Atalay, Cumhuriyet muhasebe çalışanı Emre İper, muhabir Ahmet Şık, tweet'leri nedeniyle yargılanan tutuklu sanık Ahmet Kemal Aydoğdu.