 Генералната дирекция по научно-изследователска дейност казва, че ЕСИВ и Хоризонт 2020 трябва да бъдат в хармония, а Генералната дирекция региони критикува това и казва, че трябва да се направи нещо повече, което да е контрациклично. Ако целите на Хоризонт 2020 са далече от регионалните приоритети, тогава това ограничава възможността