השלים את המשפט הבא: הטייסת עברה לאקרוטירי של חיל האוויר המלכותי בקפריסין באוגוסט 1956 כשבריטניה וצרפת הכינו תגובה צבאית ל
הלאמה של תעלת סואץ. ב-31 באוקטובר, הבריטים והצרפתים השיקו את מבצע המוסקטרים, סדרה של תקיפות אוויריות כבדות נגד מטרות מצריות, ואחריו נחיתות ב-6 בנובמבר. התפקיד של טייסת מספר 39 היה להגן על שדות התעופה החיוניים בקפריסין מפני כל תגובה מצרית אפשרית. הלחץ של האו"ם אילץ הפסקת אש במצרים והסרת הכוחות האנגלו-צרפתים עד סוף דצמבר, אך הטייסת נשארה בקפריסין לאחר שהכוחות הבריטיים התפזרו, טסה סיורים כדי להרתיע מטוסים שנחשדו בהשפעת אספקה לכוחות EOKA שנלחמים נגד השלטון הבריטי בקפריסין. הגוף המרכזי של הטייסת חזר למלטה במרץ 1957, אך מפרק נשמר בקפריסין. בעקבות המתחים בלבנון (שהגיעו בסופו של דבר לשיאו במשבר בלבנון ביולי-אוקטובר 1958), כל הטייסת עברה לקפריסין במאי 1958, אך היא חזרה במהרה למלטה ונפרקה ב-30 ביוני 1958.