ב-17 במאי 2017, וורנר הוזכר בקבוצת נבחרת גרמניה לגביע הקונפדרציות של פיפ"א 2017 שנערך ברוסיה. הוא הופיע כתחליף לסנדרו ווגנר במשחק הפתיחה של הטורניר נגד אוסטרליה, לפני שהשיג את שני השערים הבינלאומיים הראשונים שלו כאשר נבחר להתחיל במשחק הקבוצה האחרון של גרמניה נגד קמרון ב -25 ביוני. ארבעה ימים לאחר מכן, וורנר כבש את השער השלישי של גרמניה בניצחון 4-1 במחצית הגמר על מקסיקו. ב-2 ביולי 2017, וורנר עזר לארס סטינדל להשיג את שער הניצחון בגביע הקונפדרציות של פיפ"א 2017.
נגד צ'ילה. עם שלושה שערים ושני אסיסטים, וורנר זכה ב"מגף הזהב" בטורניר.