למרות שלא הופיעה בשחקן כלשהו עבור קרואטיה במהלך אימוץ אירופה 2004, בוטינה הופיעה בכל שלושת משחקי הקבוצות שלהם בגמר.
בפורטוגל אחרי שפלטיקוסה נאלץ לסגת מהטורניר בגלל פציעה שנגרמה באימונים כמה ימים לפני המשחק הראשון. הוא שוב קיבל חולצה עם מספר 12. בשלב הקבוצות, קרואטיה שמרה על תיקו ללא שער מול שווייץ, תיקו 2<unk>2 מול צרפת, והפסד 4<unk>2 בסיבוב האחרון של שלב הקבוצות נגד אנגליה, אשר ראה את הקבוצה נעלמה מהטורניר.