כתוב המשך לפרק זה - הוא מונה למפקד בגיל 21 ב-28 באפריל 1800. אחיו רוברט ליווינגסטון שירת גם הוא בחיל הים של ארצות הברית כמרופא בכריכת פריגטה במהלך מלחמת 1812. אחיו השני, הרמן, היה פקיד על ה-USS Wasp ו-USS Peacock. ג'ונתן ת'ורן שירת בחיל הים במהלך מלחמת טריפול
, והתנדב לקחת חלק במשלחת המסוכנת להשמיד את הספינה "פילדלפיה" שנלכדה, שהייתה עוגנת מתחת לאקדחים של נמל טריפולי המוגנים. ב-16 בפברואר 1804, סגן סטיבן דקאטור הוביל קבוצה של מתנדבים אלה בקצ' "אינטרפיד" לתוך טריפולי ושרף את הספינה האמריקאית כדי שלא תוכל לשמש את האויב.