כתוב המשך לפרק זה - סקוט התחתן עם קתרין נינה גרנט סמית בשנת 1938. הוא שירת במלחמת העולם השנייה, וזכה לתפקיד סגן שני בחטיבה הרביעית של מחוז לונדון בספטמבר 1939. יומנרי נשלח למזרח התיכון בתחילת 1941 ומשם הועבר למדבר המערבי ביוני 1942, שם סקוט ראה פעולה בקווי ההגנה הבריטיים במאבוס אר ריגל ונפצע כאשר הטנק שלו נפגע על ידי אש אויב. לאחר שהגיע לדרגת סגן באמצע 1942, הוענק לו צלב הצבא באוגוסט 1942. הוא הוזכר במברקים בדצמבר 1942 והיה מפקד על טייסת C בחיל הנוער בפברואר 1943, ובנקודה זו הוא החזיק בדרגת קפטן זמנית. באפריל 1943, עכשיו מייג'ור בפועל, סקוט לקח חלק בקרב ואדי אקאריט
, שבו פעולותיו פיקוד טנקים דרך שדה מוקשים ראה אותו מעוטר עם בר לצלב הצבאי שלו. במהלך השלבים האחרונים של קמפיין צפון אפריקה, הכוחות שפיקד עליהם סקוט היו בין הראשונים שנכנסו לטוניס במהלך כיבושה.