אלי נולד בומביי, בהודו הבריטית, בנו של יוסף עלי אללהבוקש (מת ב-1891), הידוע גם בשם חאן בהאדור יוסף עלי, שיאי במסורת הדאוואדי בורה, שהפנה את גבו לתפקיד המסורתי המבוסס על עסקים של קהילתו ובמקום זה הפך למפקח משטרתי של המשטרה. עם פרישתו הוא קיבל את התואר חאן בהאדור לשירות ציבורי. כילד, עבדאללה יוסף עלי למד בבית הספר Anumanjayat Him-ul-Islam ולאחר מכן למד בבית הספר המיסיונרי וילסון קולג ', שניהם בומביי. הוא גם קיבל חינוך דתי ובסופו של דבר היה יכול לדקלם את כל הקוראן מהזיכרון. הוא דיבר ערבית ואנגלית באופן שוטף. הוא התמקד במאמציו על הקוראן ולמד את פרשנויות הקוראן עם אותם כתבים בתחילת ההיסטוריה האיסלאמית. הוא קיבל את תואר ראשון במקצועי הספרות באוניברסיטת סנט בומבריד בומביי (1901, 1906)
ערבית ואנגלית