ב-31 בינואר 2016, סקאלי הודיע כי הוא מתכנן לפרוש מהשידור לאחר סיום עונת 2016; המשחק האחרון שלו היה המשחק הסופי של הקבוצה ב-2 באוקטובר בסן פרנסיסקו. סקאלי השאירה פתוחה את האפשרות של קריאת משחקי פוסטסיזון (אבל לא את סדרת העולם
בספטמבר, סקאלי הצהיר כי הוא יפרוש לאחר סיום העונה הרגילה ולא יתקשר למשחקים שלאחר העונה כי הוא לא רצה "לומר שלום 12 פעמים שונות". סקאלי שיחק בסך הכל שישה משחקים מחוץ לביתו בעונת 2016: המשחק הפותח בסן דייגו, שני משחקים באנהיים, וכל שלושת המשחקים של הסדרה הסופית של העונה הרגילה בסן פרנסיסקו.