השלים את המשפט הבא: בתחילת המשחק הראשון שלו ב-2013 ב-2 באפריל, בומגרנר זרק שמונה אינינגים ללא פסק זמן נגד הדודג'רס והוסיף RBI בניצחון של 2-0. כנגד הברייבס ב-11 במאי, הוא השיג 11 סטרייקאוטים שיא העונה, והשיג את הניצחון בניצחון של 10 ל-1. בומגרנר נבחר לייצג את הליגה הלאומית
משחק הכוכבים של ליגת הבייסבול הבכירה של 2013, הבחירה הראשונה שלו ל-All-Star. למרות שהיה ברשימה, הוא לא היה בשימוש בהפסד של ה-NL ל-AL. ב-27 ביולי, הוא החזיק את הקאובס ללא נקודות במשך שמונה סיבובים, אך קיבל החלטה ללא החלטה בהפסד של 0. הוא השווה את שיא הפסדי החבילה שלו בעונה עם 11 ב-2 באוגוסט בניצחון 4 ל-1 על טמפה ביי רייס.