השלים את המשפט הבא: יחסי יפן מולזיה מתייחסים ליחסי החוץ הדו-צדדיים בין שתי המדינות, יפן ומלזיה. היחסים ההיסטוריים המוקדמים ביותר בין שתי המדינות הם היחסים המסחריים בין סולטנות מלאכה לממלכת ריוקיו במאה ה-15. מספר קטן של מתנחלים יפנים היגרו לחלקים שונים של מלזיה הנוכחית במהלך המאה ה-19. זה נמשך גם במאה ה-20, עד שהיחסים הגיעו לרמה הנמוכה ביותר עם עלייתה של אימפריה יפנית
הפלישה והכיבוש הבריטי של מלאיה ובורנאו במהלך מלחמת העולם השנייה, שבמהלכה האוכלוסייה המקומית סבלה לעתים קרובות שלטון צבאי יפני אכזרי.