השלים את המשפט הבא: במהלך המצור על פטרסבורג, הוא פיקד על החטיבה השנייה, הדיוויזיה הראשונה, חיל החמישי בחווה של צ'אפין והפעולות הבאות לאורך דרכי דארביטאון וניו מרקט. צבא ג'יימס הוקם מחדש והפיקוד שלו הפך לגדוד השני, דיוויזיה שנייה, חיל XXIV, אשר היה מחובר לגדוד המשלחת פורט פישר תחת בריגדנרל אלפרד ה. טרי והשתתף במלחמת העולם השנייה.
הקרב השני של פורט פישר והכיבוש של וילמינגטון. אף על פי שאבוט לא מונה לדרגת גנרל מלאה, ב-25 בינואר 1865, הנשיא אברהם לינקולן מינה את אבוט לדרגת בריגדיר גנרל של המתנדבים, לדרגה החל מ-15 בינואר 1865 עבור שירותי גאלות בהשתלטות על פורט פישר, וסנאט ארצות הברית אישר את הפרס ב-14 בפברואר 1865. במהלך השלבים האחרונים של המלחמה, הוא היה מוצב בווילמינגטון, צפון קרוליינה.