ב-1803, לאחר שלום אמיין, הילייר שירת בים התיכון ב"ניגר", וסירב לקידום הרלובי, שכן זה עלול היה להשאיר אותו במילואים בחצי משכורת, מה שהיה משאיר את משפחתו חסרת אונים. הורשיו נלסון גילה זאת ובמיוחד המליץ על הילייר לשירות לורד סנט וינסנט באדמירליות. כתוצאה מכך, הילייר קיבל קידום והורשה לשמור על "ניגר", עם חימוש מוגבר, בים התיכון. ב-1805 הוא התחתן עם מרי טיילור, בתו של מחסן ימי מלטזי. ב-1807 הצטרף לספינה שהכינה לפעולות בים הבלטי וב-1809 הפיקד על הספינה "סנט ג'ורג'" בת 98 תותחים כקפטן הדגל של אליאב הארווי. באותה שנה הוא קיבל פריגטה נוספת לשירות עצמאי, HMS "פובי". הילייר פיקד על "פובי" באוקיינוס ההודי ובאינדיות המזרחית במהלך 1810 ו-1811, והיה נוכח בפלישה לאי דה פראנס ובפלישה שלאחר מכן לג'אווה
אני לא יודע. ב-20 במאי 1811, הוא היה אחד הקפטנים המעורבים בקרב טמאטבה, כאשר טייסת פריגטות צרפתית הובסה ושתי ספינות נתפסו.