כתוב המשך לקטע זה - תחומי המחקר של טאוקס כוללים מחלות ביתית חיידקיות, אפידמיולוגיה ופטוגנזה של מחלות זיהומיות, השלכות אפידמיולוגיות וקלניות של חילופי גנטיים חיידקיים, שימוש באנטימיקרובים והתנגדות לגורמים אנטימיקרוביאליים, והוראת שיטות אפידמיולוגיות. הוא השתתף או פיקח על מספר רב של חקירות אפידמיולוגיות מקומיות ובינלאומיות בכל רחבי העולם, בעיקר את פיגוע הביו-טרור של רג'נישי בשנת 1984.
, התפרצות סלמונלוזה בארה"ב בשנת 2008, התפרצות כולרה בהאיטי בשנים 2010-2013, הקמת Pulsenet, ומגיפת נגיף האובולה במערב אפריקה.