ב-1994, בשנה הראשונה שלו בתחרות כבוגר, מליסאנידיס נהנה מהצלחה על הבמה העולמית. הוא זכה בתואר האימונים על הרצפה באליפות אירופה 1994 בפראג. באליפות העולם ב-1994
הוא התקושר עם ניל תומאס מבריטניה במדליית הכסף על הרצפה. עם הניצחון הזה, מליסאנידיס הפך למתעמל היווני הראשון, זכר או נקבה, שזכה במדליה באליפות העולם. גורלו של מליסאנידיס השתנה לאחר 1994: באליפות העולם ב-1995 וב-1996 הוא לא הצליח להגיע לאף אירוע סופי.