ב-18 בספטמבר 2020, מילר כבש את השער הראשון שלו בעונה, וסיפק אסיסט אחד, בניצחון 8-0 על שאלק 04. מאוחר יותר הוא הצליח לזכות בגביע הסופר של UEFA.
ו- DFL-Supercup כדי להיות הגביע ה -27 בקריירה המועדון שלו; לפיכך, הוא הפך לשחקן המעוטר ביותר בהיסטוריה הגרמנית, ושבר את השיא הקודם של 26 גביעים שזכה בו שותפו לשעבר בביירן, באסטיאן שוויינשטיין. ב -11 בפברואר 2021 הוא נבדק חיובי ל- COVID-19 ונכנס לבידוד; לכן, לא יכול היה לשחק בגמר גביע העולם למועדונים FIFA 2020.