ישנן כמה מוטציות צבעיות של עוף-צבי אינדיאני. אלה מתרחשים לעתים רחוקות מאוד בטבע, אך הרבייה סלקטיבית הפכה אותם נפוצים בשבי. מוטציית הכתפיים השחורות או היפנית נחשבה בתחילה לזרעיות P. c. nigripennis (או אפילו מין), והייתה נושא של עניין מסוים בתקופת דארווין. עם זאת, זהו רק מקרה של וריאציה גנטית בתוך האוכלוסייה. במוטציה זו, הזכר הבוגר הוא מלניסטי עם כנפיים שחורות. ציפורים צעירות עם מוטציית nigripennis הן לבנות מלאות עם כנפיים קצוות קצוות. הגן מייצר מלניזם אצל הזכר ובצבע העוף הוא מייצר מיזוג של צבע קרימי עם סימנים לבנים וחומים. וריאציות אחרות כוללות את הרגליים הלבנות ושל כולן הן תוצאה של וריאציה אלליטית בין עוף-צביני אינדיאני ספקי (P. c. nigripennis) (או אפילו מין), והייתהווה נושא של
כמה.