ב-10 בפברואר 1899, פלורס קראה לפגישה בין פקידי סבו של הרפובליקה הפיליפינית כדי לדון במלחמה נגד הכוחות האמריקאים. קלימאקו הועמד למשימה של הכנות למלחמה. ב-21 בפברואר 1899, כאשר כוחות אמריקאים נחתו בסבו ודרשו כניעה, קלימאקו תמך במרד האנטי-אמריקאי
הובל על ידי גנרל ארקדיו מקסילום ונסע לסמר כדי לאסוף נשק. פלורס, יחד עם חוליו לורנטה, אשר מאוחר יותר ייבחר כמושל הראשון על ידי האמריקאים, הסכים להיכנע המחוז.