היא הוקמה בשנת 1868 כבית ספר אזרחי גרמני ושוויצרי המבוסס על עקרון שוויון, כדי לשרת את הקהילה דוברת הגרמנית בעיר. ב-1871, בניין ליד מגדל גלאטה נבנה לבית הספר. הבניין נפגע קשות במהלך רעידת האדמה באיסטנבול בשנת 1894, ולכן בשנת 1897 עבר בית הספר לבניין אחר שעדיין משמש את בית הספר. לאחר מספר שנים, בית הספר החל לקבל גם תלמידים דוברי טורקית. בשנת 1918, לאחר מלחמת העולם הראשונה, בית הספר נסגר והבניין שימש על ידי הכיבוש
כוחות. לאחר הכרזת הרפובליקה על טורקיה בשנת 1923, בית הספר נפתח שוב בשנת 1924. ב-1925, הוא עבר בחזרה לבניין הנוכחי שלו. הוא נסגר שוב ב-1945 בגלל העמדה הפוליטית של טורקיה נגד גרמניה במהלך מלחמת העולם השנייה, והבניין שימש על ידי בית הספר התיכון לבנות בייאוגלו. בשנת 1953 הוחזר הבניין לבית הספר הגרמני באיסטנבול, ומאז בית הספר משתמש באותו הבניין.