כתוב המשך לפרק זה - לואי ה-14 השתמש בבסטיליה ככלא לחברי המעמד העליון בחברה הצרפתית שהתנגדו לו או הכעיסו אותו, כולל, לאחר ביטול צו נאנט, פרוטסטנטים צרפתים. החל מ-1659, הבסטיליה פעלה בעיקר כבית סוהר ממשלתי; עד 1789, 5,279 אסירים עברו דרך שעריו. תחת לואיס ה-15 וה-16 שימש הבסטיליה כדי לעצור אסירים מרקעים מגוונים יותר, ולתמוך בפעולות של משטרת פריז, במיוחד לאכוף צנזורה ממשלתית של התקשורת המודפסת. אף על פי שהאסירים הוחזקו בתנאים טובים יחסית, הביקורת על הבסטיליה גדלה במהלך המאה ה-18, על ידי אוטוביוגרפיות שנכתבו על ידי אסירים לשעבר. רפורמות בוצעו ומספר האסירים הצטמצם באופן משמעותי. בשנת 1789, המשבר הפיננסי של הממשלה המלכותית והקמת האסיפה הלאומית הובילו להתנפח של רגשות רפובליקניים בקרב תושבי העיר. ב -14 ביולי, הבסטיליה הותקפה על ידי קהל מהפכני, בעיקר תושבי פרובור סנט אנטואן שניסו לתפוס את אבק השריפה היקר ערך שנמצא בתוך המבצר. שבעת האסירים שנותרו נמצאו ושוחררו, ומנהל הבסטיליה, ברנרד-רנה דה לאוניי, נהרג על ידי ההמון. הבסטיליה נהרסה על פי פקודת הוועדה של הוטל דה ויל. מזכרות מהמצודה הועברו ברחבי צרפת והוצגו כאייקונים של הפלת הדיספטיזם. במהלך המאה הבאה, האתר והמורשת ההיסטורית של הבסטיליה הופיעו בולטות במהפכות הצרפתיות
, מחאות פוליטיות בדיוני פופולרי, והוא נשאר סמל חשוב לתנועה הרפובליקנית הצרפתית.