השלים את המשפט הבא: ליטא איבדה את עצמאותה והפכה בהדרגה לרפובליקה סוציאליסטית סובייטית. במקביל, הצבא הליטאי השתנה בהדרגה ליחידות של הצבא האדום. העבודה באקדמיה הצבאית נפסקה כאשר גברים נקראו בחזרה ליחידותיהם, אך לא הורשו לרסטיקיס להתפטר. הוא מונה לגדוד הרובים ה-29 ונבחר לסגן יו"ר הוועדה האחראית על חיסול הצבא הליטאי. הוא שוחרר מהשירות הפעיל רק ב-20 בדצמבר. ב-13 בפברואר 1941, מחשש מעצר על ידי ה- NKVD כ"אויב העם", עזב ראסטיקיס את אשתו ושלושה בנות צעירות בקאונס והלך לכיוון גרמניה. זו הייתה הפעם האחרונה שהוא ראה את בנותיו שהיו
גורשו לסיביר ביוני. הוא חצה את הגבול בלילה של 19 במרץ וקיבל קבלת פנים טובה על ידי הגרמנים. בעזרת ליטאים שונים, הוא התיישב בברלין. שם הוא הצטרף לקזיס שקירפה בארגון חזית הפעילים הליטאית (LAF). בפרט, הוא ערך את חוקי LAF וכתב תוכניות לשחרור ליטא.