השלים את המשפט הבא: עם כניעתם בעיר יורק באוקטובר 1781, ג'ונסון חזר הביתה ונשאר מובטל עד השלום. לאחר מכן פיקד על חיל הרגליים ה-17 בנובה סקוטיה וניופאונדלנד. בתחילת
במהלך המלחמה עם צרפת הוא מונה למפקח כללי של גיוס עבור הממסד האנגלי באירלנד, והיה בתפקיד עד 1798. במהלך המרד באותה שנה הוא נשלח עם שלושה אלף איש לכבוש את ניו רוס, והביס את המורדים כשהם תקפו את המקום ב-5 ביוני 1798. זה היה הקרב הקשה ביותר במהלך המרד. לורד קורנוואליס היה דעה אדישה לג'ונסון, וכתב עליו כ"ממוקד שגוי".