במפרץ צוגארו יש צווארות מזרחית ומערבית, שתיהן בגודל של כ-20 ק"מ. סקרים ראשוניים שנערכו בשנת 1946 הראו כי צוואר המזרחי היה עד 200 מטר (656 רגל) עמוק עם גיאולוגיה וולקנית. צוואר המערבי היה עמוק ביותר של 140 מטר (459 רגל) וגיאולוגיה המורכבת בעיקר מסלעים משקעיים של התקופה הניאוגנית. צוואר המערבי נבחר, עם התנאים שלו הנחשבים נוחים עבור מנהרות. גיאולוגיה של החלק התת ימי של המנהרה מורכבת מסלעים וולקניים, סלעי פיורוק, סלעי ריכוז, סלעי ריכוז וסלעי משקעיים של התקופה הניאוגנית. אזור המנהרה העיקרי מחולק לשני צווארות יבשתיים, שניהם בגובה כ-20 קמ"מ (12 מייל). סקרים ראשוניים שנערכו בשנת 1946 הראו כי צוואר המזרחי המזרחי העליון מורכב ממרחץ יבש סינמטרי, אשר
הסלע הצעיר ביותר.