בשנת 1993 קיבלה מקלינטוק את מדליית בנג'מין פרנקלין על הישגים מצטיינים במדעים של החברה הפילוסופית האמריקאית. היא זכתה ב-14 תארים של דוקטור כבוד למדעים ודוקטור כבוד למכתבים הומניים. בשנת 1986 היא הוכרזה להיכל התהילה הלאומי לנשים. במהלך שנותיה האחרונות, מקלינטוק הובילה חיים ציבוריים יותר, במיוחד לאחר שביוגרפיה שלה של אוולין פוקס קלר משנת 1983, "רגש לאורגניזם", הביאה את סיפורה של מקלינטוק לציבור. היא נשארה נוכחות קבועה בקהילה קולד ספרינג הרבור, ונתנה הרצאות על אלמנטים גנטיים ניידים והיסטוריה של מחקר גנטיקה לטובת המדענים הצעירים. אנתולוגיה של 43 פרסומים שלה, "הגילוי וההפרדה של אלמנטים הגנטיים הניידים: אוסף האספקטים של דודקלין פרנקלין: דודקולטור של דודקלין: אוסף האספקטורים של דודלין
תחושה לאורגניזם