בונה איירס מושל חואן מנואל דה רוסס ניהל הגמוניה גדלה על שאר המדינה במהלך 1835-1852 הממשלה שלו והתנגד כמה התקוממות יוניטריאנית, אבל בסופו של דבר הובס בשנת 1852
על ידי צבא קואליציה שנאסף על ידי המושל הפדרליסטי של אנטר ריוס ג'וסטו חוזה דה אורקיזה, שהאשים את רוסס שלא עמד בהוראות האמנה הפדרלית לחוקה לאומית. בשנת 1853 חוקק חוקת פדרלית (החוקת הנוכחית של ארגנטינה, באמצעות תיקונים) ואורקיזה נבחר לנשיא הקונפדרציה הארגנטינית. עם זאת, בעקבות קרב קזרוס 1852, מחוז בונוס איירס נפרדה מהקונפדרציה. בשנת 1859, לאחר קרב ספדה, הצטרפה מדינת בונוס איירס מחדש לקונפדרציה, אם כי הוענקה לה הזכות לבצע כמה תיקונים בחוקה שלה. לבסוף, לאחר קרב פבון ב-1861, בונוס איירס השתלטה על הקונפדרציה.