פישר נולד בהוכסט על מיין, כיום מחוז בעיר פרנקפורט. הוריו היו ד"ר יוג'ן פישר, מנהל חברת קאל & Co, וויסבאדן, ופרייבטודצנט בתיכון הטכני, שטוטגרט, ואנה הרדגן. הוא למד בבית ספר יסודי בשטוטגרט, ולאחר מכן ב"גימנזיום הומניסטי" בוויסבאדן, שהשתתף בשנת 1899. הוא למד כימיה ורפואה, תחילה באוניברסיטת לוזאן ולאחר מכן במרבורג. הוא סיים את לימודיו בשנת 1904, ובשנת 1908 הוא קיבל את התואר לרפואה. שאלה: בן יוג'ן פישר למד באילו שתי אוניברסיטאות?
אוניברסיטת לוזאן ואז במרבורג