הפנוטיפ של אורגניזם יחיד נובע הן מגנוטיפ שלו והן מהשפעה של הסביבה שבה הוא חי. חלק ניכר מהשינוי הפנוטיפי באוכלוסייה נגרם על ידי וריאציה גנוטיפית. הסינתזה האבולוציונית המודרנית מגדירה את האבולוציה כשינוי לאורך זמן בגין זה. תדירותו של אלל מסוים תהיה נפוצה פחות או יותר ביחס לצורות אחרות של אותו גן. וריאציה נעלמת כאשר אלל חדש מגיע לנקודת הקביעה<unk>כשהוא נעלם לחלוטין מהאוכלוסייה או מחליף את האלל האבותי באופן מוחלט. בריאציה טבעית תגרום לאבולוציה רק אם יש מספיק וריאציה גנטית באוכלוסייה. עד גילוי גנטיקה מנדליאנית, אחת ההשערות המשותפות הייתה תורשה. אבל עם התערבוב של שינויים פנוטיפיים באוכלוסייה, חלק ניכר מההייה הפנוטיפית ייעלם במהירות, על ידי וריאוריה גנוטיפית.
וריאציה גנוטיפית