מרטין ורנר (באנגלית: Martin Verner; נולד ב-5 במרץ 1980) הוא שחיין צ'כי. באולימפיאדת הקיץ 2008, הוא התחרה ב-100 מטר חופשי, סיים במקום ה-21 ולא הצליח להגיע לחצי הגמר. באולימפיאדת הקיץ 2012, הוא השתתף בתחרות 100 מטר חופשי לגברים.
, סיים במקום ה -23 בסך הכל בחזרות, ולא הצליח להתאים למחצית הגמר.