עד אמצע שנות התשעים התברר כי האיום החמור ביותר על כוחו של מהאתיר היה השאיפות המנהיגותיות של סגנו, אנור. אנור החל להתרחק ממאהתיר, קידם בגלוי את הסמכות הדתית הגבוהה שלו והופיע להציע שהוא מעדיף להרגיע את המגבלות על חירויות האזרח שהפכו לסימן ההיכר של כהונתו של מהאתיר. עם זאת, מהאתיר המשיך לתמוך באנור בתור יורשו עד שהיחסים שלהם התמוטטו באופן דרמטי במהלך המשבר הפיננסי האסיטי. עמדותיהם נפרדו בהדרגה, כאשר מהאתיר נטש את המדיניות המוניטרית והפיסקלית הקפדנית על ידי קרן המטבע הבינלאומית. באסיפה הכללית של UMNO בשנת 1998, תומך מוביל של מהאתיר, אחמד זאהיד חמידי, ביקר את הממשלה על כך שלא עשתה מספיק כדי להילחם בשחיתות ובשחיתות. כאשר מהאתיר התחיל להתרחק ממנהאתיר, הוא הפ
לרוץ לבמה ולשכנע אותו בבכי להישאר