הוא נולד ב-1804 בסיילם, מסצ'וסטס, להוריו נתן'ל האת'ורן ואל אליזבת קלארק מאנינג. אבותיו כוללים את ג'ון האת'ורן, השופט היחיד שהשתתף במשפטי המכשפות בסיילם שמעולם לא התחרט על מעשיו. הוא נכנס לקולג' באודודיין ב-1821, נבחר לפי ביתא קאפה ב-1824, וסיים את לימודיו ב-1825. הוא פרסם את יצירתו הראשונה ב-1828, הרומן פאנשווי; מאוחר יותר הוא ניסה לדכא אותה, והרגיש שהיא לא שווה לסטנדרט של עבודתו המאוחרת יותר. הוא פרסם מספר סיפורים קצרים בעיתונים תקופתיים, שאוספים בשנת 1837 בשם Twice-Told Tales. בשנה שלאחר מכן, הוא התארס עם סופיה פיבודי. הוא עבד בבית המנהגים של בוסטון והצטרף לחברת ברוק, קהילה טרנסצנדנטלית, לפני שהתחתן ב-1842. הזוג עבר לסיילם בסיילם
מספר סיפורים קצרים בעיתונים