יש קשר בין התאבדות לבין בעיות בריאות כמו כאב כרוני, פציעת מוח טראומטית, סרטן, כשל כליה (הצריך דיאליזה), HIV, וזאבת אריתרם סיסטמית. האבחנה של סרטן מכפילה בערך את תדירות ההתאבדות שלאחר מכן. השכיחות של התאבדות מוגברת נמשכה לאחר התאמת מחלות דיכאוניות והתעללות באלכוהול. בקרב אנשים עם יותר ממצב רפואי אחד התדירות הייתה גבוהה במיוחד. ביפן, בעיות בריאותיות מופיעות כצדקה עיקרית להתאבדות. הפרעות שינה כמו אינסומניה ואפניית שינה הן גורמי סיכון לדיכאון והתאבדות. במקרים מסוימים הפרעות השינה עשויות להיות גורם סיכון עצמאי לדיכאון. מספר מצבים רפואיים אחרים עם תסמינים עשויים להציג הפרעות מצב רוח, כולל היפוטרואיד, אלצהיימר, גידול מוחי אריתרם, לופוס אריתרם סיסטמי, סמים דומים למחלות דיכאוניות,
אלכוהול