הוא עבד כמתרגם מאנגלית, צרפתית ופולנית בצ'כוסלובקיה הקומוניסטית. הוא פרסם גם בפרסומים של Samizdat. במהלך מהפכת הקטיפה של 1989
פטר יאנישקה שייך ליבה הפנימי של התנועה הפרו-דמוקרטית פורום האזרחי. הוא היה דמות מפתח בהקמת תקשורת עצמאית בעידן הפוסט-קומוניסטי. הוא היה סגן העורך הראשי של "Respekt" ו"Lidové noviny". מאז 1995 הוא עובד בדיפלומטיה, כשגריר בצרפת, בלובי פעיל להצטרפות צ'כיה לאיחוד האירופי. הוא גם מרצה באוניברסיטת צ'ארלס בפראג. בשנת 2012 הוא הפך לראש המרכז הצ'כי בווארשה.