ליאונל אנדרס מסי נולד ב-24 ביוני 1987 ברוזאריו, השלישי מבין ארבעה ילדים של חורחה מסי, מנהל מפעל פלדה, ואשתו סליה קוצ'יטיני, שעבדו במעבדת ייצור מגנטים. מצד אביו, הוא ממוצא איטלקי וספרדי, נכד של מהגרים מאזור מרצ'ה הצפון-מרכזית של איטליה וקטלוניה, ומצד אמו, הוא בעל מוצא איטלקי בעיקר. גדל במשפחה הדוקה ואוהבת כדורגל, "ליאו" פיתח תשוקה לספורט מגיל צעיר, שיחק ללא הרף עם אחיו הבוגרים, רודריגו ומטיאס, ועם בני דודו, מקסמיליאנו ואמנואל ביאנצ'י, ששניהם הפכו לשחקנים מקצועיים. בגיל ארבע הוא הצטרף למועדון המקומי גרנדו, שם הוא נולד על ידי המאמן שלו, סליליה קוצ'יטיני. הוא נולד עם סבתו, סבתו של אביו, סליליה קוצ'י
24 ביוני 1987