השלים את המשפט הבא: לאחר שחזר לקנדה, מרטין התחתן עם אלן היל, או "קראקווינה" (משמעותה "שמש נעה"). הוא גם נרשם לבית הספר לרפואה בטורונטו בשנת 1863. הוא סיים את לימודיו בבי.אם. ב-1865 ו-מ.ד. ב-1866. ב-1866, הוא שירת גם ברובים של המלכה במהלך קרב רידג'וויי, אחד מהסכסוכים המזוינים של
פשיטות פניאן מארה"ב של אותה שנה.