לאחר מכן הוא התווכח על פעולה חיובית עבור המלאים במכללה הרפואית. בעודו בקולג' הוא תרם ל"סטרייטס טיימס" תחת הכינוי "CHE", וכתב עת סטודנטי, שבו קידם בחריפות את זכויות המלאים, כגון השבת המלאים כשפה רשמית. בעודו מתרגל כרופא באל סתור, נהפך מהאטיר פעיל ב-UMNO; עד לבחירות הכלליות הראשונות למדינת מלאיה העצמאית בשנת 1959, הוא היה יו"ר המפלגה בקדהה. למרות הבולטות שלו ב-UMNO, מהאטיר לא היה מועמד לשלטון בבחירות הפדרליות בשנת 1959, לאחר מחלוקת עם ראש הממשלה המלאי, הוא הוציא את עצמו מהמשפט הרפואי. עם זאת, הוא התפטר מהמשפט הפדרלי של סינגפור לאחר שנבחר לראשונה כראש ממשלת סינגפור בשנת 1964, על אף שהיה בעל קשרים חזקים עם המפלגה האתנטית של המלאיה, לאחר שנבחר לראשונה כראש ממשלת סינגפור, וזכה לאחר שנפגע
מהאתיר