תכתוב המשך לפרק זה - גרגורי התשיעי קבע כינוס כללי לפסחא 1241 ברומא. אוטו, עם אנשי כנסייה רבים אחרים, כולל ג'יימס מפקוררה, עלו על ספינה בגנואה לרומא. הצי הגנואי נתפס על ידי הצי הפרו-אימפריאלי של פיזה והובס בקרב גיליו
ב-3 במאי 1241. אוטו וג'יימס נתפסו והובאו לסלרנו בממלכת סיציליה. אוטו קיבל טיפול טוב יותר מאשר ג'יימס, אולי בגלל שהוא נחשב יותר יקר ערך במשא ומתן.