פילהטרוס שירת את ליסימכוס עד 282 לפנה"ס, כאשר אולי בגלל קונפליקטים שקשורים למזימות של ארסינואה, אשתו השלישית של ליסימכוס, הפילהטרוס נטש את ליסימכוס, והציע את עצמו ואת המבצר החשוב של פרגמון, יחד עם האוצר שלה לסלוקוס, שבאחר מכן הביס והרג את ליסימכוס בקרב קורופדיום בשנת 281 לפנה"ס. סלוקוס עצמו נהרג על ידי פטולמיה קרונוס, אחיו של ארסינואה בליסימכיה כמה חודשים מאוחר יותר. למרות שהיה תחת שליטה סלוקידית, פילהטרוס, במיוחד לאחר מותו של סלוקוס, היה בעל אוטונומיה ניכרת והצליח בעזרת עושרו הרב להגדיל את השפעתו ואת כוחו מעבר לפרגמון. ישנם רשומות רבות של פילהטרוס כקצינור של ערים שכנות וטמונות, כולל המקדשים של פרגמון, יחד עם האוצר שלה, לסלוק
כסף ואוכל.