כתוב המשך לפרק זה - לאחר הכיבוש הסובייטי של בסרביה
בשנת 1940, הכנסייה, שהייתה אז מטרופוליס לא אוטונומית, נאסרה, ורכושה שינה שימוש, או הועבר לכנסייה האורתודוכסית הרוסית, אשר הקימה את "הבישוף בקשינאו ומולדובה". בשנות השמונים הוסיפו שני בישופיות נוספות, והרשות הועלתה למעמד של ארכיבישוף, בשנת 1990, וכמטרופוליס של קישינאו וכל מולדובה, בשנת 1992.