במפרץ צוגארו יש צווארות מזרחית ומערבית, שתיהן בגודל של כ-20 ק"מ. סקרים ראשוניים שנערכו בשנת 1946 הראו כי צוואר המזרחי היה עד 200 מטרים (656 רגל) עמוק עם גיאולוגיה וולקנית. צוואר המערבי היה עמוק ביותר של 140 מטרים (459 רגל) וגיאולוגיה מורכבת בעיקר מסלעים משקעיים של התקופה הניאוגנטית. צוואר המערבי נבחר, עם התנאים שלו הנחשבים נוחים לציפייה. גיאולוגיה של החלק התת ימי של המנהרה מורכבת מסלעים וולקניים, סלעי פירוק, סלעי ריחוב וולקניים של התקופה הניאוגנטית. המנהרה המרכזית מורכבת משלושה צינורות יבשתיים, שנקשרות בקו יבש ישר, אשר מחובלים את הקרקע היבשתית של המנהרה באמצעות טכניקות גיאומנטריות, סולקניות יבשות, סולקניות ישרות ובלומנטריות, אשר
הפלישות והפגמים איגנתיים