הפרידה בין פרוטו-יוקאטקנית (בצפון, כלומר, חצי האי יוקטן) ופרוטו-צ'ולאנית (בדרום, כלומר, הרמות צ'יאפאס ואגן פטאן) התרחשה כבר בתקופה הקלאסית, כאשר נכתבו רוב כתבי המאיה שנותרו. שני הסוגים מאושרים בכתבי הירוגליפים באתרי המאיה של אותה תקופה, ושניהם מכונים בדרך כלל "שפה קלאסית של המאיה". למרות שפה יוקרתית יחידה נרשמה לעיתים קרובות ביותר בטקסטים הירוגליפיים קיימים, הוכחות לפחות לשלושה ענפים שונים של המאיה התגלו בתוך מגוון הירוגליפים הירוגליפיים של טקסטים מדרום-מזרח מאיה שנכתבו באזור הרים המערביים של יוקטן ובמחוז המערבי של פטאן, רוב הטקסטים של שפה הקלאסית של מאיה נמצאו בסגנון יוקאטקני, אך למעשה הם נראו כטקסטריטים גליפטיים של ש
שפת המאיה הקלאסית