לאחר כניסת ארצות הברית למלחמה באירופה באביב 1917, מגנס העביר את כל תשומת ליבו למסע נגד המלחמה. הוא הפך לאחד המנהיגים הבולטים של התנועה. כמו רוב המנהיגים שלו, הוא סימפתיה עם מעמד הפועלים. אנשים כמו יוג'ין דבס שנשפט לעשר שנים בכלא על פעילותו; נורמן תומס; רוג'ר נאש בולדווין; סקוט נירינג; מוריס הילקוויט, שקיבל 22% מהקולות בבחירות לראשות העיר ניו יורק על פלטפורמת אנטי-מלחמה; ואוסוולד גריסון וילארד. רוב הגברים האלה היו מעורבים במה שהפך ל"מועצת העם של אמריקה לדמוקרטיה ושלום" עם מגנס כנשיא הראשון שלה. ב-30 במאי 1917, הוא נשא את הנאום המרכזי בפגישה של 15 אלף איש במדיסון סקוור גארדן.
אני לא יודע. פגישת המשך במיניאפוליס נאסרה ונקבעה מחדש בחיפזון בשיקגו, אך כוח צבאי איים לפרק אותה. מגנס עבר לביתו בקונטיקט בגלל עוינות של שכניו, ונראיין על ידי סוכן ממשרד המשפטים. אחד מעמיתיו ב"מג'ינט", בי.די. בוגן, נחקר על ידי התובע הכללי על פעילותו של מגנס. מגנס עבד עם משרד החירויות האזרחיות שנוסד לאחרונה, שהגן על פציפיסטים ועל סרבי מצפון. באמריקה הוגשו יותר מ -2,000 תביעות נגד מתנגדי מלחמה על פי חוק הגיוס או חוק הריגול; מגנס נמנע מתביעה מכיוון שהוא היה מעל גיל הגיוס.