כתוב המשך לפרק זה - במהלך הכיבוש
, הכוחות הגרמנים המשיכו לבצע מחקר, למרות העובדה שהמוסד סבל מפסדים משמעותיים. בסתיו 1939, הוצאו להורג המונים, והרגו מדענים רבים, טכנאים ואנשי מנהל, ביניהם מנהל המכון, פרופסור ד"ר ולדימיר קולמאטיצקי.