כתוב המשך לפרק זה - מבחינה אידיאולוגית, אל-מוטסים הלך בעקבות אל-מאמון, המשיך את תמיכתו של קודמו למוטזיליזם, דוקטרינה תיאולוגית שניסתה ללכת בדרך האמצעית בין המלוכה החילונית לבין הגישה התיאוקרטית שהומצאה על ידי האלידים והכתות השונות של השיעה. מוטאזיליס אימץ את הדעה שהקוראן נוצר ולכן היה תחת סמכותו של "אימאם" מונחה על ידי אלוהים לפרש בהתאם לנסיבות המשתנות. בעודם מכבדים את עלי, הם נמנעו מלקחת עמדה על צדקנות הצדדים המתנגדים בסכסוך.
בין עלי לבין יריביו. המוטאזיליזם אומץ באופן רשמי על ידי אל-מאמון בשנת 827, ובשנת 833, זמן קצר לפני מותו, הפך אל-מאמון את דוקטרינותיו לחייבות, עם הקמת אינקוויזיציה, ה"מיחנה". במהלך שלטונו של אחיו, אל-מוטסים שיחק תפקיד פעיל בהכפיית ה"מיחנה" במחוזות המערביים; זה נמשך לאחר כניסתו לכס המלכות. התומך הראשי של המוטאזיליזם, ראש "קדי" אחמד אבן אבי דואד, היה אולי ההשפעה הדומיננטית בחצר החליפה במהלך שלטונו של אל-מוטסים.