לאחר מאבק העצמאות, המושל החדש הפרוגרסיבי של בונוס איירס, מרטין רודריגז, מינה את פרגמינו לשופט שלום בשנת 1822 ובית הספר הראשון נפתח בשנת 1828. העיירה הפכה במהרה לבית למספר בית מטבחיים ולאחר עלייתו של המושל חואן מנואל דה רוסס בשנת 1829, התפתחה ברית הדוקה בין המושל לבין המשפחות הבולטות ביותר של פרגמינו, האסבדו ואנקורנה; עם זאת, המשטר הדיכויי של רוסס הוביל לסגירת בית הספר היחיד בשנת 1838. בעקבות הפיכה של המושל רוזס ב-1852
, האצולה המקומית ברית את עצמה עם ברטולומה מיטרה, תומך בולט בשם מחוז בונוס איירס לאוטונומיה גדולה יותר. מיטרה נבחר למושל בשנת 1860 ונשיא ארגנטינה בשנת 1862. הקמתו של הנשיא מיטרה בשנת 1862 של מכון האגרונומיה הראשון בארגנטינה עזרה להוביל לפיתוח של פעילות כלכלית חדשה באזור סביב פרגמינו: חקלאות אינטנסיבית. המשלוח הראשון של דגנים ארגנטיניים שהגיע ללא פגע בבריטניה בשנת 1875 עורר בום חקלאי שבפרגמינו, הוביל לגידול מסיבי של תירס. הצמיחה של העיר התאצה עוד יותר עם הגעת הרכבת המרכזית הארגנטינית בשנת 1882, בדרכה לרוזאריו. פרגמינו, שאוכלוסייתה עברה אז את 10,000 ובית ליותר מ-90 עסקים רשומים, הוכרז רשמית כעיר ב-23 באוקטובר 1895.