במהלך הפלישה המשותפת גרמנית-סובייטית לפולין, שהחלה את מלחמת העולם השנייה, בספטמבר 1939, יאנוב הושבה שלוש פעמים על ידי לופטוואפה, שהרגה 350 אנשים והרסה 85% מהעיר. העיירה כבשה לאחר מכן על ידי גרמניה.
אני לא יודע. לפחות 17 פולנים מחוז נרצחו על ידי הרוסים בטבח קטיין הגדול באפריל-מאי 1940, בעוד ביוני 1940, הגרמנים ביצעו מעצרים המונית של פולנים מקומיים במהלך "הפעולה AB". פולנים שנעצרו נכלאו בלובלין, ולאחר מכן גורשו לעיתים קרובות למחנות הריכוז של זאקסנהאוזן ואושוויץ, בעוד שחלקם נרצחו במהלך טבח גדול של פולנים שבוצע ברורי, לובלין. מחנה עבודה בכפייה נפתח ב-1940, והאוכלוסייה היהודית של העיר נרדפה על ידי הכובשים. היו מספר קבוצות פרטיזנות יהודיות הפועלות ביערות יאנוב במשך כל תקופת המלחמה. למרות זאת, רק כ -20 יהודים מהעיר שרדו את השואה מתוך 3,500 עד 5,000 יהודים שחיו בעיר לפני המלחמה.