צ'אן נכנסה לאוניברסיטת הרווארד בשנת 2003, שם פגשה את מארק צוקרברג והתחילה לצאת איתו. היא סיימה את לימודיה בשנת 2007 עם תואר ראשון בביולוגיה, וגם למדה ספרדית. היא דוברת בקנטונית, אנגלית וספרדית. היא הבוגרת הראשונה במשפחתה. לאחר סיום הלימודים לימדה מדע בבית הספר הפרטי הארקר במשך שנה, לפני שנכנסה לבית הספר לרפואה באוניברסיטת קליפורניה, סן פרנסיסקו בשנת 2008. היא סיימה את לימודיה בשנת 2012, וסיים את ההתמחות שלה בפידיאטריה בקיץ 2015. שאלה: איפה היא למדה בבית הספר לרפואה?
אוניברסיטת קליפורניה, סן פרנסיסקו