השלם את המשפט הבא: ג'פרסון לא רצה להיות מעורב בכל סוג של סכסוך בינלאומי, אבל הוא האמין כי כוח יהיה הטוב ביותר להרתיע את מדינות ברברי מבקשת מחווה נוספת. הוא הורה לחיל הים האמריקאי להיכנס לים התיכון כדי להגן על עצמו מפני פיראטים ברבריים,
מלחמת הברבריות הראשונה. מאמציו הראשונים של הממשל היו ללא תועלת, וב-1803 נלקחה הפרגטה בידי טריפולי. בפברואר 1804, סגן סטיבן דקאטור הוביל פשיטה מוצלחת על הנמל של טריפולי ששרפה את "פילדלפיה", מה שהפך את דקאטור לגיבור לאומי. ג'פרסון והצי האמריקאי הצעיר אילצו את טוניס ואלג'יר לשבור את הברית שלהם עם טריפולי שבסופו של דבר הוציאו אותה מהמלחמה. ג'פרסון הורה גם לחמישה הפצצות ימיות נפרדות על טריפולי, שהחזירו את השלום בים התיכון לזמן מה, אם כי ג'פרסון המשיך לשלם למדינות הברבריות שנותרו עד סוף כהונתו לנשיאות.