ביולי 1793 פרסם בונפרטה חוברת פרו-רפובליקנית בשם Le souper de Beaucaire (ארוחת ערב בבואקייר) שזכתה בתמיכתו של אוגוסטין רובספייר, אחיו הצעיר של המנהיג המהפכני מקסימיליאן רובספייר. בעזרתו של עמיתו הקורסיקי אנטואן כריסטוף סאליצ'טי, בונפרטה מונה למפקד ארטילריה של הכוחות הרפובליקניים במצור על טולון. הוא אימץ תוכנית לכבוש גבעה שבה תותחים רפובליקנים יוכלו לשלוט בנמל העיר ולכפות על הבריטים לפנות. ההתקפה על העמדה הובילה לכבוש העיר, אך במהלך זה בונפרטה נפצע בירתו. הוא הועלה לגנרל חטיבה בגיל 24.
רפובליקני