שישה שנים לאחר הקולוניזציה הרשמית של הודו המזרחית, באירופה הרפובליקה ההולנדית כבשה על ידי הכוחות הצרפתיים של נפוליאון. הממשלה ההולנדית נסעה לגלות באנגליה והוותרה באופן רשמי על רכושיה הקולוניאליים לבריטניה. המושל הכללי הפרו-צרפתי של ג'אווה, יאן וילם יאנסנס, התנגד לכוחות הפלישה הבריטיים בשנת 1811
עד שנאלץ להיכנע. המושל הבריטי רפלס, שהקים מאוחר יותר את העיר סינגפור, שלט במושבה ב-10 השנים הבאות של הביניים הבריטיים (1806-1816).