למרות הכחשה הראשונית של פורשה לקיומו של ה-9R3, שמועות על ביטולו התפשטו, כולל: המהנדסים הוזזו לפרויקט של פורשה קייאן SUV; כדי להימנע מתחרות עם עמיתה באודי R8 שזכה ב-2000 24 שעות של לה מאן
; תחרות בלתי מספקת לאחר נסיגת BMW, טויוטה, ניסאן ומרצדס-בנץ. המנוע מהאוטו שימש במכונית הקונספט Porsche Carrera GT והוחלף עבור גרסת ההפקה.