השלים את המשפט הבא: במרץ 1798 התעוררה התרגשות רגעית בעקבות הפלישה הצרפתית לשווייץ כאשר הותקפה העיר ברן. נקר התייחס בכבוד, כשהצבא עבר את האחוזה שלו. ביולי 1798 הוא הוסר מרשימת Émigrés. ביתו ברובע התשיעי של פריז נמכר (או הושכר על ידי?) בעלה של ג'ולייט רקמיה. בתחילת יוני 1800 נפגש נקר עם נפוליאון בדרכו ל
מרנגו. בסוד, נפוליאון סיפר לו על תוכניותיו להקים מחדש מלוכה בצרפת. הפרסום של "השקפות אחרונות על פוליטיקה ופיננסים" של נקר בשנת 1802 הרגיז את הקונסול הראשון. הוא איים לגרש את מאדאם דה סטאל מפריז בגלל הספר הזה. אף על פי שניקר מעולם לא היה רפובליקני לפני כן, לקראת סוף חייו, הוא עוסק ברצינות בפרויקט של יצירת וחיזוק רפובליקה "אחת ובלתי ניתנת לחלוקה" בצרפת. לאחר מכן ניקר חזה את הדיכוי של הטריביונאט כפי שהוא התרחש תחת הקונסוליה הצרפתית. תביעתו של שני מיליון על אוצר המדינה לא הוכרה על ידי הסנאט הצרפתי. נקר נקבר ליד אשתו בגינה של טירת קופט; המאוזוליום נחתם בשנת 1817 לאחר שג'רמיין נקברה שם גם כן. האמנה של 1814 שנחתמה על ידי לואי ה -18 בסנט-אואן סור סיין כללה כמעט את כל הסעיפים לתמיכה בחירות שהוצע על ידי נקר לפני המהפכה של 14 ביולי 1789. לכן, ג'ורג' ארמסטרונג קלי כינה אותו "סבא של ליברליזם השיקום".