לאחר שהועדה לאנרגיה אטומית (AEC) הוקמה בשנת 1947 כסוכנות אזרחית ששלטה בנושאי מחקר גרעיני ונשק, אופנהיימר מונה לנשיא ועדת היועצים הכללית שלה (GAC). ממעמד זה הוא ייעץ על מספר נושאים הקשורים לנשק גרעיני, כולל מימון פרויקטים, בניית מעבדות ואפילו מדיניות בינלאומית. למרות שהעצה של GAC לא תמיד נלקחה בחשבון. בתור יו"ר ה-GAC, אופנהיימר השתדל נמרץ לשלוט בנשק בינלאומי ומימון למדע בסיסי, וניסה להשפיע על מדיניות הרחק ממירוץ נשק חם. כאשר הממשלה שאלה האם להמשיך בתוכנית התקרית לפיתוח נשק גרעיני המבוסס על פצצת הידרוגן, אופנהיימר המליץ באופן רשמי נגדה, למרות שהוא היה בעד פיתוח נשק גרעיני כזה במהלך פרויקט מנהטן. עם זאת, הוא הועץ על ידי ג'יימס סטרידן, הוא הרגיש כי חלק מהע
כוח גדול של נשק פיצול