כתוב המשך לפרק זה - בשנות השמונים, בן שושאן ויהודה עציון, שניהם חברים במחתרת גוש אמונים, זוממו לפוצץ את מסגד אל-אקצא ואת כיפת הסלע. אציון האמין שהפיצוץ של שני המסגדים יגרום להתעוררות רוחנית בישראל, ויפתור את כל הבעיות של העם היהודי. הם גם קיוו שהמקדש השלישי בירושלים ייבנה במקום שבו היה המסגד. ב-15 בינואר 1988, במהלך האינתיפאדה הראשונה,
, חיילים ישראלים ירו כדורי גומי וגז מדמיע על מפגינים מחוץ למסגד, ופצעו 40 מתפללים. ב-8 באוקטובר 1990, 22 פלסטינים נהרגו ויותר מ-100 נוספים נפצעו על ידי משטרת הגבול הישראלית במהלך הפגנות שנגרמו על ידי ההכרזה של קבוצת יהודים דתיים, "המאמינים בהר הבית", כי הם עומדים להניח את אבן הפינה של בית המקדש השלישי.