כתוב המשך לפרק זה - גמרה הופיע עבור נבחרת פרגוואי 110 פעמים, כבש 12 שערים, מ 1993 עד 2006, מייצג את הקבוצה ב 10 טורנירים גדולים וקפטן את הקבוצה במהלך החלק האחרון של הקריירה שלו. הוא השחקן השני עם הכי הרבה משחקים בקבוצה הלאומית, והרקורד שלו נשבר על ידי פאולו דה סילבה בשנת 2013. גמארה השתתף עם פארגוואי בשלושה טורנירים בגביע העולם של פיפ"א (1998, 2002 ו-2006), חמישה טורנירים בקופה אמריקה (1993, 1995, 1997).
, 1999 ו-2004), ושתי פעמים במשחקי הקיץ האולימפיים (1992 ו-2004, כאשר פרגוואי זכתה במדליות כסף באולימפיאדת הקיץ). גמרה הוכרז ככדורגלן הפרגוואי של השנה ב-1997 ו-1998, והוא גם נכלל בקבוצת הפוטבול של גביע העולם ב-1998.