השלים את המשפט הבא: לאחר שעזב את מינסוטה, קלארק חזר לפילדלפיה כדי לתפוס את תפקיד סגן נשיא בכיר בעונת 1992-1993, ושימש כמדריך לפנום הצעיר אריק לינדרוס בעונה הראשונה שלו. קלארק עבר זמן קצר לאחר מכן ולקח את תפקיד המנהל הכללי עם ה-Florida Panthers, קבוצה שהקימה את שיא הקבוצה ההתרחבת בניצחונות ובנקודות במהלך עונה ב-1993-1994. הוא חזר לתפקיד המנהל הכללי של הפליירס לפני עונת 1994-1995.
ב-1994 נבחר ב-NHL Entry Draft), והוא שינה את הקבוצה להיות מתמודדת בגביע. במהלך כהונתו השנייה כמנהל הכללי של הפליירס, הקבוצה הגיעה לפלייאוף 11 עונות ברציפות, אך הגיעה פעם אחת לגמר (1997). בעקבות התחלה גרועה בעונת 2006/07, קלארק התפטר, וטען כי הוא עלול להיות מותש וחוסר רצון. קלארק חזר לפרנשיזה ב-4 בדצמבר 2006 ונבחר לסגן נשיא בכיר.