קומי נולד ב-14 בדצמבר 1960, ביונקרס, ניו יורק, להוריו ג'ואן מארי קומי (ניי הרלד) וג'יי בריאן קומי. סבו, ויליאם ג'יי קומי, היה קצין ומאוחר יותר נציב מחלקת משטרת יונקרס. המשפחה עברה לאלנדייל, ניו ג'רזי, בתחילת שנות השבעים. אביו עבד במגזר נדל"ן תאגידי ואמו הייתה יועצת מחשבים ועוזרת בית. קומי הוא ממוצא אירי. הוא למד בבית הספר התיכון האזורי של רמת הגבעות הצפוני באלנדייל; ב-1977 הוא ואחיו היו קורבנות לפלישה בבית על ידי פושע בשם "The Ramsey Rapist". קומי סיים את לימודיו במכללת ויליאם ומרי ב-1982, בכימיה ודת. עבודת הדוקטורט שלו ניתחה את הטלונגולוג ריינבורו ניהולד ואת הטלואנגליסט ג'רי פאלוול, תוך הדגשה על אמונם המשות המשות
דוקטור למשפטים (JD)