זה גם מנוגד ל- EBRT, שבו קרניים רנטגן בעלות אנרגיה גבוהה (או לפעמים קרני גמא מראדיואיזוטופ כמו קובלט-60) מכוונות אל הגידול מבחוץ לגוף. ברכיותרפיה במקום זאת כרוכה במיקום מדויק של מקורות קרינה לטווח קצר (רדיואיזוטופים, יודין-125 למשל) באתר הגידול. אלה מכוסים בקפסולה או חוט סגור, המאפשר לרדיואיוזציה המעידה להימלט ולהרוג את הרקמות הסובבות אך מונע מנטל הרדיואיוזוטופ להתפשט באופן כימי לרקמות הסובבות או שמונע את הנזק של כל רקמה מסביב לגוף. מה שמאפשר לרדיואיוזוטופ ברכיותרפיה להפיק תועלת רבה בהשוואה למקורות הקרינה בריאים, אם ניתן להפחית את הזדמנויות לטיפול ב- EBRT, אם ניתן להפחית את הזדמנויות לטיפול או להפחית את הזדמנויות לטיפול ב- EBRT, אם ניתן להפחית את
קרינה