השלים את המשפט הבא: מוריסון היה תומך מוקדם של תנועת הרפורמה בקנדה העליונה והשתתף בפגישות כדי לעודד שינוי פוליטי. הוא דיבר שוב ושוב נגד מרד מזוין ועודד את ויליאם ליון מקנזי להמשיך לבקש תמיכה לרפורמות שלו. הוא לא השתתף ב
קנדה העליונה מרד ונשאר בביתו במקום. למרות זאת, הוא נעצר ונושם בבגידה בגין תכנון והוצאה לפועל של המרד, ומצא לא אשם במשפט שלאחר מכן. מוריסון פחד מאשמות נוספות, נמלט לארצות הברית וחזר לתרגל רפואה. כאשר הוענק חנינה לרוב המשתתפים במרד בשנת 1843, הוא חזר לטורונטו כדי להמשיך את פרקטיקת הרפואה שלו ולשרת במועצות רפואה שונות. הוא נפטר ב-19 במרץ 1856, משותק בטורונטו.