ראשו הקטן של מאסוספונדילוס היה בערך חצי מהאורך של עצם הירך. פתחונים רבים בגולגולת הפחיתו את משקלו וסיפקו מקום לחיבור שרירים ואיברים חושיים. פתחונים אלה היו קיימים בזוגות, אחד בכל צד של הגולגולת. בחזית הגולגולת היו שני נזרים גדולים, אליפטיים, שהיו בערך חצי מהגודל של המעגלים. המעגלים היו גדולים באופן פרופורציונלי במאסוספונדילוס מאשר בגנים קרובים, כגון פלטיזאורוס. הפתחונים האנטורביטליים, קטנים יותר מאלה שנראים בפלטיזאורוס, היו ממוקמים בין העיניים והאף. בחלק האחורי של הגולגולת היו שני זוגות נוספים של פתחונים טמפורליים: הפתחונים הטמפורליים מאחורי העין, שנחשו באופן מיידי כמו פתחונים "טמפורטיזורים" בכל צד של הגולגולגולת. פתחונים אלה היו קיימים בזוגות, אחד
העיניים והאף