כתוב המשך לפרק זה - מלחמת האזרחים בגואטמלה
נמשך מ-1960 עד 1996. לאחר ההפיכה של 1954, האקטיביזם הפוליטי בקרב קהילות ילידיות ועכריות הפך יותר רדיקלי. כוחות הגרילה הראשונים הופיעו בשנות השישים. הכניסה של כוח גרילה הובילה לגידול בדיכוי ממשלתי. החלו להיות "העלמות פוליטיות" של חברי גרילה ותומכיהם. עד סוף שנות ה-70, מלחמת אזרחים פתוחה התנהלה בגואטמלה.