השלים את המשפט הבא: ליונס היה בקולג' בוסטון לזמן קצר בלבד, לפני שנבחר לנשיא קולג' גונזאג'ה. הוא קיבל את התפקיד ב-27 בדצמבר 1908, והחל את יורשו של ג'וזף הימל. זמן קצר לאחר שנכנס לתפקידו,
רעידת אדמה פגעה במסינה, איטליה, ובבית הספר ערכו טקס רקיום נרחב עבור הקורבנות, אשר נחגג על ידי הבישוף דיומד פלקוניו וזמר על ידי בונאוונטורה סרטי. נוכחים היו הבישוף דניס ג'יי. אוקונל, התובע הכללי צ'ארלס יוסף בונפארטה, שגריר איטליה בארצות הברית, יוסף הימל, וכמרים מהסדרים הדומיניקני, הפרנציסקני והפולאיסטי. ב-10 בפברואר נערכה סעודה לכבוד הנשיא החדש, בה השתתף חבר הקונגרס ויליאם בורק קוקראן. תקופת כהונתו של ליונס הסתיימה ב-8 ביולי 1909, כאשר יוג'ין דל החליף אותו. מקדונל.