כמו כל הפילובירוסים, מרבורגוויריונים הם חלקיקים חוטיים שעשויים להופיע בצורת חוט של רועה או בצורת "U" או "6", והם עשויים להיות מעוגלים, טורואידים או מענפים. מרבורגוויריונים הם בדרך כלל 80 ננומטר רוחב, אך משתנים במקצת באורך. באופן כללי, אורך החלקיק המדיאני של מרבורגווירוסים נע בין 795 ל 828 ננומטר (בניגוד לאבובירונים, שאורך החלקיק המדיאני נמדד כ 974<unk>1,086 ננומטר), אבל חלקיקים באורך של עד 14,000 ננומטר זוהו בתרבות רקמות. מרבורגוויריונים מורכבים משבעה חלקיקים. במרכזם נמצא ריבונקליון הרביוני, אשר מורכב מ-RNA הקשור מסובל סביב ספיימר של ספיימר (ספיימר) (ספיימר), בעוד שמרבורגוויריונים הם בדרך כלל 80 ננומטר רוחב, אך משתנים במקם
795 עד 828 nm