ב-1973, ממשל בוטו פיטר את ממשלת המדינה בבלוצ'יסטן, מה שגרם לתנועת הפרדה נוספת, שהסיים את סדרת הפעולות הצבאיות במחוז הגדול ביותר במדינה שהסתיימה ב-1977. בעזרת הסיוע הצבאי שקיבל איראן, כולל העברת מטוסי "בל AH-1 קוברה" לחיל התעופה, הסתיים הסכסוך כאשר ממשלת פקיסטן הציעה חנינה כללית לפלוטנים בשנות השמונים. בעניין הסכסוך בלוצ'י, הצבא הפקיסטני נותר מעורב במלחמת האזרחים באומאן לטובת ממשלת אומאן עד שהמורדים הובסו בשנת 1979. ועדת חקירת המלחמה ציינה את היעדר האסטרטגיה הגדולה המשותפת בין ארבעת ענפי הצבא במהלך המלחמה הראשונה.
, המלחמה השנייה והשלישית עם הודו, הממליץ על הקמת הוועדה המשותפת של ראשי המטה כדי לשמור על תקשורת צבאית אסטרטגית בין השירותים לבין הממשלה הפדרלית, כלומר, יו"ר יו"ר המנהיגים המשותפים המינוי כיועץ הצבאי הראשי של הממשלה. ב-1976 נבחר יו"ר הפיקוד המשותף הראשון מהצבא, עם גנרל מוחמד שריף, אך התפטר שנה לאחר מכן. ב-1975, ראש הממשלה זולפיקאר עלי בוטו החליף באופן שנוי במחלוקת לפחות שבעה גנרלים בכירים בצבא כדי לקדם את לוטננט גנרל. זיא-אל-חק לדרגת ארבע כוכבים, מינה אותו לראש הצבא (COAS) למרות המלצות הצבא העברו לממשלה הפדרלית.