במאי 1864 הוא הועבר לפיקוד על ארטילריה במהלך המצור על פטרבורג. ב-12 בדצמבר 1864 מינה הנשיא אברהם לינקולן את אבוט לתפקיד בריגדיר גנרל מתנדבים, לתפקיד החל מ-1 באוגוסט 1864, והסנאט האמריקני אישר את המינוי ב-20 בפברואר 1865. בדצמבר 1864 הוא קיבל את הפיקוד על כל ארטילריה המצור בצבא הפוטומק ובצבא ג'יימס שהקיפו את פטרסבורג. בינואר 1865 גנרל אלפרד ה. טרי ביקש מגנרל אבוט ללוות את כוח המשלחת שלו לפורט פישר. אבוט פיקד על חטיבה זמנית של ארטילריה המצור במהלך הקרב המוצלח השני של פורט פישר
אני לא יודע.