השלם את המשפט הבא: בדרך כלל היו הנציגים במשימות אלה שדנו את הגנרלים. במקרה זה, הנציגים עם צבא האלפים היו מרוצים מהביצועים של קלרמן, אבל הפוליטיקאים בפריז דרשו את מעצרו. ב-12 באוקטובר, ממשלת צרפת גם הורה על מעצרו של דובואה-קראנסה על כך שלא כבש את ליון מהר מספיק, אבל הפוליטיקאי הצליח לצאת מזה. לאחר הצלחתו נגד הפיאמונט, קיבל קלרמן את צו המעצר שלו ב-16 באוקטובר. הוא היה אמור להיות שמור על ידי יחידת ג'נדרמים, אבל דופט הרשה לו להמשיך עם קצין ג'נדרם אחד. קלרמן יצא לפריס ב-18 באוקטובר והגיע לכלא דה לביי ב-6 בנובמבר 1793. קלרמן שרד את שלטון הטרור, אולי בגלל שהוא היה הגיבור של
קרב וולמי. הוא הועמד למשפט וזכה לשחרור ב-8 בנובמבר 1794. דרגתו של קלרמן הוחזרה ב-15 בינואר 1795 והוא קיבל את הפיקוד על צבא האלפים במרץ אותה שנה. הקיסר נפוליאון מינה את קלרמן למרשל האימפריה ב-19 במאי 1804. נפוליאון השתמש בכישרונו של קלרמן כמארגן במהלך האימפריה הצרפתית הראשונה, אם כי הוא מעולם לא החזיק פיקוד קרב.