השלים את המשפט הבא: במהלך הפלישה הגרמנית לפולין, שהחלה את מלחמת העולם השנייה, ב-13 בספטמבר 1939, Leżajsk נכבש על ידי הוורמאכט. לאחר מכן, ה"אינסאטג'רופ I" הגרמני נכנס לעיר כדי לבצע זוועות שונות נגד האוכלוסייה. ב-3 בנובמבר 1939, המשטרה הביטחונית הגרמנית ביצעה מעצרים המונית של פולנים מקומיים כחלק מ"Intelligenzaktion". הפולנים היו אז או כלואים בכלא המקומי או נרצחו בבית הקברות המקומי. בין הפולנים שנרצחו היו מורים, מנהלי בתי ספר, כמרים וקציני צבא. פולנים מלז'אייסק היו גם בין הקורבנות של הטבח הגדול בקאטין, שביצעו הרוסים באפריל-מאי 1940. במהלך
בזמן הכיבוש הגרמני, צבא המולדת היה פעיל מאוד באזור. מאז מאי 1940, העיתון הפולני המחתרני "Odwet" הופץ בלז'אייסק על ידי תנועת ההתנגדות הפולנית. ב-28 במאי 1943, הגרמנים ירו 43 תושבי העיירה. ליזאייסק נכבשה על ידי צבא המולדת ב-27 ביולי 1944.