ב-5 ביולי 1943 התפתחה המתקפה האסטרטגית האחרונה של גרמניה בחזית המזרחית (מבצע ציטדלה) בהתקפות על הכתפיים הצפונית והדרומית של מפרק קורסק. המטרה הייתה לכסות ולהשמיד את החזית המרכזית ופורונז' הצפונית והדרומית של קורסק. באותה תקופה, הצבא ה-40, שהחזיק בקטע שקט יחסית של קו החזית מול הזרוע השמאלית של צבא הפאנצר הרביעי הגרמני, היה מבוסס על שבע דיוויזיות רובה עם תמיכה משוריינת. במהלך קרב קורסק, שבו נלחם הצבא כחלק מ"חזית וורונז'", הוא העביר מספר תגבורות לצבא המשמר השישי כדי לעזור למשמר השישי להחזיק את חיל הרובים ה-48, כולל חטיבת המשחתת הטנקים ה-29 ואת גדודי המשחתת הטנקים ה-1244 וה-869, בסך הכל מעל 100 תותחים נגד טנקים. הצבא ה-40 העביר גם חטיבת טנקים לצבא ה-38 באותו הזמן. לאחר הקרב, היא השתתפה בחציית הנהר דנפר בספטמבר 1943 בשיתוף עם מבצעים מבויתים. הצבא השתתף מאוחר יותר בקרב על קייב (1943).
בשנת 1944, כחלק מהחזית האוקראינית השנייה, פעולות סביב כיס קורסון-צ'רקאסי, כיס קמנץ-פודולסקי, ואת ההתקפות באומן-בוטושאני, יאסי-קישינוב, ברטיסלבה-ברנו, ופרג. היא גם נלחמה בקרב דברצ'ן, שבו, בשל עדיפות נמוכה, היו לה רק חמש דיוויזיות. הארמייה ה-40 פורקה ביולי 1945.