יותר מ-1,700 מינים של עצים וצמחים כליליים אחרים הם ילידי הפארק. 170 מינים נוספים נחשבים למגוון מינים אקזוטיים והם לא ילידים. מתוך שמונה מינים של עצי קוניפר מתועדים, יערות אורן לודג'פול מכסים 80% משטחי היערות הכוללים. עצי קוניפרים אחרים, כגון עץ סבאלפין, עץ אנגלמן, עץ רוקי מאונטיין דאגלס ועץ וייטברק, נמצאים בגנים מפוזרים ברחבי הפארק. נכון לשנת 2007, עץ האורן הלבן מאוים על ידי פטרייה הידועה בשם חלודה של עץ האורן הלבן; עם זאת, זה מוגבל בעיקר ליערות הצפוניים והמערביים. ב-Yellowstone, כ-7 אחוזים מינים של עץ אורן הלבן הושפעו מהפטריות, בהשוואה לזיהומים כמעט מלאים בצפון מונטנה. עצי הקוויפטן והעצנונים הם המינים הנפוצים ביותר של עצי הקוניפרים הנפלים. השאלה: מה ניתן
עץ דגלס-עץ סבאלפין, עץ אינגלמן-ספרוס, עץ דגלס-עץ הרוקי ומעץ וויטברק פיין