השלים את המשפט הבא: ב-1779, ג'ונסטון הוצע, וקיבל, משרה כקומדור של תחנת ליסבון, למרות ההתקפות הקודמות שלו על המשרד, ותמיכתו בהסכמה על פני התערבות צבאית. הוא הצדיק את עצמו עם הטיעון שמאחר וצרפת נכנסה למלחמה בצד האמריקאי, הוא כבר לא יכול לתמוך בהישארות מחוץ למלחמה. הוא הובטח לו משימה בתחנה הפורטוגזית, לפני שהוא טס לחוף הצרפתי בספינת הדגל שלו, בחיפוש אחר ראיות של הכנות לפלישה. עד מהרה התברר כי הצי הצרפתי והספרדי התכוונו להתאחד ויצרו
צי יחיד גדול לפלוש לאנגליה. ג'ונסטון לקח את "רומני" להצטרף לספינת התעלה של אדמירל סר צ'ארלס הארדי, ודחף אותו לחפש קרב. במקום זאת, הארדי העדיף להימנע מפעולה בהתחלה, לשבש את צי האויב בים בזמן ששלו המשיך לשפץ ולספק מחדש מבסיסי הצי לאורך החוף האנגלי. הטקטיקות של הארדי היו מוצלחות, ובמקום להתעמת עם צי בריטי טרי ומצויד היטב, הארמדה האויבת נטשה את תוכניותיה וחזרה לנמלים הצרפתיים.