השלים את המשפט הבא: ב-1798, ברון קיבל את הפיקוד על... ולקח חלק במלחמת הקוואזי עם צרפת. במהלך
במלחמת הברבריות הראשונה, הוא פיקד על המחתרת והחל את אדוארד פרבל ליד טריפולי. במשך רוב החורף של 1804-1805, בארון היה על הקרקע עם מחלת כבד כואבת, כתוצאה מחום צהוב. עבור קציני הטייסת, בריאותו של בארון הייתה נושא של דאגה ותסכול מתמשך... ובראשית נובמבר 1804, הוא עבר לחוף - אך הוא סירב לוותר על הפיקוד ומעולם לא הפסיק לקוות שהוא יתאושש. ב-1805 הוא העביר את פיקוד הטייסת שלו לג'ון רוג'רס וחזר לארה"ב בשל בריאות לקויה. לאחר מכן הוא קיבל פיקוד על מספנת גוספורט בווירג'יניה. בריאותו מעולם לא התאוששה לחלוטין, וב-29 באוקטובר 1810 המפקד רוברט הנלי, הקצין המבצע שלו, דיווח למזכיר הצי: "יש לי את החובה הכואבת להודיע לך על מותו של קומדור סמואל בארון. בבריאות טובה לכאורה, הוא הותקף בזמן ארוחת הערב אתמול בהמפטון עם התקף אפולקטי ומת בערך בשעה 10 הבוקר". קומודור ברון נקבר בהמפטון, וירג'יניה, בגיל 45.