היא נולדה בפורט וורת', טקסס, לבת של קונסטנס לין (נולדה האס) ודוגלאס ג'יי מיסטר. אביה הוא מתווך נדל"ן, ואמה היא סופרת. יש לה שני אחים; אח מבוגר, דוגלאס לוגן מיסטר (נולד ב-1983), ואח צעיר, אלכסנדר "לקס" מיסטר (נולד ב-1994). בזמן לידה, הוריו של מיסטר ישבו בכלא פדרלי בשל מעורבותם ברשת סמים שהבריחה מריחואנה מג'מייקה לארצות הברית. קונסטנס יכלה ללדת את לייטון בבית חולים ואחותה במשך שלושה חודשים בבית מחצית הדרך, לפני שחזרה לכלא כדי להשלים את עונשיה. הוריו של אביה דאגו למייסטר במהלך תקופה זו. היא טוענת כי הוריו וילחו לה על אף שהוריו הפסיקו להיות פושעים, ואף על אף שדגמו היו מודלים רגילים, היא הבינה כי ברוס לוגן (נולד ב-1983), ואח קטן,
שלושה חודשים.