כתוב המשך לפרק זה - קליין מונה לגנרל דיוויזיה בשנת 1799 וחצה את הריין בקהל בצבא הדנובה של ז'אן-בטיסט ג'ורדן. הוא פיקד על האגף הימני של המשמר הקדמי, תחת פיקודו של פרנסואה ג'וזף לפבר. פיקודו כלל את גדודי החוסרים הרביעי והחמישי, את הדרגונים ה-17, את "הצ'אסרס הסוסים" הראשון, גדוד סוסים קל, שתי מחלקות ארטילריה סוסית, שתי מחלקות ארטילריה רגלית וחברת ספנים. בקרב אוסטרך
ב-1 באוקטובר, חיל הפרשים של קליין סייע לאבטח את הכפר של הוסקירץ', עמדת חלוץ חשובה מבחינה אסטרטגית, לפני ההתערבות הכללית. לאחר ההפסדים הצרפתיים באוסטראך ובקרב סטוקאך שלאחר מכן, Jourdan הורה על נסיגה כללית ליער השחור. חיל הפרשים והרוב מהדיוויזיה של קליין חצו את ההרים והקימו מחנה ליד אופנבורג, שם סוסיהם יכלו למצוא מזון טוב יותר. למרות הנסיגה המאורגנת והמיקומים הבטוחים יחסית בצד המערבי של היער השחור, הצבא היה הרוס. ג'ורדן מינה את ראש המטה שלו ז'אן אוגוסטין ארנוף למפקד זמני והלך לפריז כדי להתלונן על מצב צבאו, ציודיו ואספקה. המשמעת בשורות התפרקה. מרבית הגנרלים של הדיוויזיות עזבו את עמדותיהם, למעט פייר מארי ברתלימי פרינו, ג'וזף סוהאם, דומיניק ונדמה וקליין. בחודש מאי קיבל אנדרה מסנה את הפיקוד הכללי על צבא הדנובה ועל צבא הלווטיה; עמודת קליין הצטרפה למסנה ליד ציריך.