כתוב המשך לפרק זה - האירוע נכנס אז לתקופה של הפרעה גדולה. האליפות לא שיחקה על בסיס קבוע ורבים מהדגמים היו נחשבים לא רשמיים, רק כדי להיחשב תקף מאוחר יותר על ידי CONMEBOL. לדוגמה, ארגנטינה תהיה הקבוצה הראשונה (עד כה היחידה) שזכתה בשלושה תארים ברציפות על ידי זכייה באליפות 1945, 1946
ו-1947. לאחר שלושת הטורנירים השנתיים הללו, התחרות חזרה להתקיים כל שנתיים, אז שלוש, ואחר כך ארבע. היו אפילו שני טורנירים שנערכו ב-1959, אחד בארגנטינה והשני באקוודור. במהלך תקופה זו, חלק מהנבחרות הלאומיות היו אדישות לטורניר. חלקם לא השתתפו בכל שנה, אחרים שלחו קבוצות קטנות יותר; במהדורה של 1959 שהתקיימה באקוודור, ברזיל נכנסה לקבוצה ממדינת פרנמבוקו. בוליביה ניצחה בפעם הראשונה כשהיא אירחה את הטורניר ב-1963, אך הובסה במשחק הראשון של הטורניר ב-1967 על ידי ונצואלה. הקמתה של קופה ליברטדורס בשנת 1959 השפיעה גם על הדרך בה התחרות נראתה על ידי המשתתפים בה.