השלים את המשפט הבא: הצי היה אחד הסניפים היחידים של הצבא הסובייטי שהיו בהכנות מלאה כאשר החלה הפלישה הגרמנית לברית המועצות. היא הונחה לכיבוד מס' 2 ב-19 ביוני, ובחצות ב-21 ביוני המפקד העליון של הצי, אדמירל קוזנצוב, העביר אותה לכיבוד מס' 1. כמפקד המטה של צי הבלטי, פנטלייב היה מעורב מאוד בהכנת הצי לקראת מלחמה. בסוף אוגוסט, במהלך הפלישה, הוא השתתף
בפינוי הסובייטי מטאלין, פיקד על יחידה מכסה של ספינות מלחמה סובייטיות, וב-1 בספטמבר לקח פיקוד על צי של תחבורה, ספינות תותחיות וספינות אחרות כדי לפנות חלק מחיל הרובים ה-50 מקיביסטו. הוא תיאר את הסצנה בטאלין ביומנו: האויב שינה טקטיקות, הסתננות בקבוצות קטנות... כל שדות התעופה נכבשו על ידי האויב. המטוסים שלנו טסו מזרחה. הצי והעיר תחת הפצצות וטילים. "פירטה" חמודה בוערת... גם פרברים אחרים בוערים. שריפות גדולות בעיר. מסגרות נבנו בגישות לנמל. עשן בכל מקום... אש הספינות והסוללות החוף לא פחתה. עמדת הפיקוד שלנו בנמל מינה תחת אש מתמדת.