במהלך מלחמת האזרחים, הגאות של כורים חדשים לתוך הטריטוריה האטה לרדף, ורבים עזבו למזרח כדי להילחם. המיזוריאנים שנשארו הקימו שני גדודי מתנדבים, כמו גם משמר הבית. למרות שנמצאו לכאורה בתחומי הקונפדרציה של תיאטרון המלחמה, גדודי קולורדו מצאו את עצמם בעמדה קריטית בשנת 1862 לאחר הפלישה הקונפדרלית של טריטוריית ניו מקסיקו על ידי הגנרל הנרי סיבלי וכוח של טקסנים. מסע ניו מקסיקו של סיבלי נועד כמקדמה לפלישה של טריטוריית קולורדו צפונה לפורט ליארם, וניתוק קווי האספקה בין קליפורניה לשאר האיחוד. הקולורדים, תחת פיקודם של גנרל צבא האיחוד אדוארד קנבי וג'ון פלוג, סגן גנרל סמואל פפאן וג'ון טפטון, ניצחו את שני גדודי המתנדבים של סיבלי לאורך מסע סנטה פיטה
שניים.