כתוב המשך לפרק זה - בעקבות הפיכה של ניגריה ב-1966
וההפיכה הניגרית של 1966, גל של טינה ועוינות נגד איגבו בגלל מעורבותם בהפיכה הקודמת, הגיע לשיאו בפוגרום האנטי-איגבו של 1966, שבו 30,000 איגבו ומזרחיים נהרגו. בעקבות שחיקה של המשמעת הצבאית והאמון שנגרמו על ידי הרציחות, הוקמה מבנה צבאי אזורי חדש עם מחוזות צבאיים בארבעת האזורים (צפון, מערב, מערב-אמצע ומזרח) של המדינה. עם זאת, זה העלה בעיות כמו המבנה האתני של צבא המערב התיכון היה מאוד לא אחיד כלפי איגבו המערב התיכון, שלא רק מהווה חלק ניכר של כוחות, אבל מעל 75% מ 42 קצינים המערב התיכון היו איגבו. בניסיון למנוע ניצול לרעה של כוחו, איסר על עג'ור לאפשר לקבוצה המורכבת מיון דקולו ומס"מ מייק אוקואצ'ים לייבא נשק, ובמקום זאת בחר לבקש ממשלת הפדרלית נשק ישירות, ממנו הם שלחו כמות קטנה של רובי Mark V עבור 300 החיילים באזור. זה, יחד עם היעדר מאמץ לגייס חיילים חדשים, הותיר את האזור המערבי-התיכון במצב חסר יכולת עד לפלישת ביאפרים בשנת 1967.