ב-1 בדצמבר 1943, "צוגארו" הועברה לחיל המשלחת הדרומי השלישי. ב-24 במרץ 1944 היא הועברה מפלאו לכרות את מיצר בלאבאק בפיליפינים, לאחר מכן היא הוצבה בבליקפאפן בבורניאו. אחד המוקשים ממשימה זו נחשב כמי שהטביעה את ה-, ביולי 1944. ב-31 במאי, "צוגארו" הוקצה למבצע "קון".
(ההקלה של ביאק), העברת תגבורות מזמבונגה במינדנאו במאמץ להילחם בהנחת האמריקאים. ב-21 ביוני, לאחר שעזבה את סורונג, גינאה החדשה לאי האלמההרה, טורפדה צ'וגארו על ידי הצוללת המלכותית ההולנדית "K-XIV", שגרמה לנזק חמור. לאחר תיקונים זמניים, היא ניסתה להגיע למנילה, אך נצפתה ב-29 ביוני ליד ביאק על ידי טורפדו של סן-ג'יימס, אשר ירה שישה טורפדות. שתיים פגעו ב"צוגארו", שטבעה בעמדה פחות מ-25 דקות לאחר מכן עם אובדן רוב אנשי הצוות שלה, כולל מפקדה, קפטן נקאטסו.