עונת 2016 הייתה העונה ה-105 של מאלמו, העונה ה-81 שלהם ב-Allsvenskan והעונה ה-16 ברציפות בליגה. הם התחרו ב-Allsvenskan
שם סיימו במקום הראשון, 2015<unk>16 Svenska Cupen שם סיימו במקום השני, ו 2016<unk>17 Svenska Cupen שם הם הודחו בסיבוב השני. העונה החלה עם שלב הקבוצות של Svenska Cupen ב -20 בפברואר, משחק הליגה החל ב -2 באפריל והעונה הסתיימה עם משחק הליגה האחרון ב -6 בנובמבר.