ב-9 בפברואר 1941, יאצ'ינו הוביל את הצי האיטלקי במרדף חסר הצלחה של הכוח הבריטי ה', לאחר שהאחרון הפציץ את ג'נואה ולאספציה. הוא פיקד שוב על צי הקרב האיטלקי בקרב כף מטאפאן.
(26-29 במרץ 1941), שגרמה לכישלון הגדול ביותר שנגרם אי-פעם לרגיה מרינה; הוא דחה את הדיווחים על ספינות קרב בריטיות סמוכות כבלתי נכונות או מוגזמות, והוא שלח את דיוויזיית המעבורת הראשונה כולה להצלת המעבורת "פולה" שנפגעה, וכתוצאה מכך הושמדה הדיוויזיה כולה על ידי שלושת ספינות הקרב של צי הים התיכון של אדמירל אנדרו בראון קנינגהם. פעולותיו במהלך הקרב היו נושא לביקורת רבה מאז; למרות זאת, יאצ'ינו לא הוחרם מפקודתו.