השלים את המשפט הבא: בעונת 2016, שוג'י התחיל את העונה כאשר הוא עזר לקאשימה אנטלרס לשמור על שני שערים נקיים בשני המשחקים הראשונים של העונה. מאז תחילת העונה, שוג'י המשיך להחזיר את מקומו בקבוצה הראשונה, כששיחק בתפקיד הג'ייף המרכזי. רק ב-6 באפריל 2016 הוא כבש את שערו הראשון בעונה, בניצחון 3-1 נגד נאגויה גרמפוס בגביע ליגה. בסוף שלב ראשון של ליגת ג'יי, תרומתו של שוג'י לקבוצה הראשונה עזרה לצד לסיים בראש הטבלה. לאחר שהושעה למשחק אחד, הוא חזר לקבוצת החלוץ, כאשר קשימה אנטלרס הפסידה 3<unk>1 נגד גמבה אוסקה ב-2 ביולי 2016. שוג'י המשיך לעזור לצד להישאר בראש השולחן באחת עשרה המשחקים הבאים. רק ב-16 בספטמבר 2016 הוא כבש את השער השני שלו בעונה, בניצחון של 3:0 נגד יובילו איוואטה. מתישהו בחודש הזה הוא חתם על חוזה עם המועדון. לאחר שהמועדון הגיע למקום השלישי בסיום שלב השני של ליגת ג'יי, שיוג'י עזר למועדון לזכות בליגה לאחר ששיחק בשני הרגליים כדי לנצח את אורווה רד דיימונדס 2<unk>2 על סך הכול באמצעות שער מחוץ לבית. שוג'י שיחק בכל ארבעת המשחקים.
בגביע העולם למועדונים של פיפ"א, כאשר הוא עזר לקאשימה אנטלרס להגיע לגמר, רק כדי להפסיד 4<unk>2 נגד ריאל מדריד. למרות הפסד בגמר, השותפות של שניהם, שוג'י ונאומיצ'י אודה, זכו לשבחים מצד התקשורת, הן בתוך יפן והן מחוץ לה. שוג'י גם עזר למועדון להגיע לגמר גביע הקיסר על ידי ניצחון על קוואסאקי פרונטאל 2<unk>1. בסוף עונת 2016, הוא הופיע בארבעים וחמישה משחקים וקיבל שני שערים בכל התחרויות. על ביצועיו בעונת 2016, שוג'י הוכרז כ-J.League Best XI.