השלים את המשפט הבא: במהלך קרב ביצה של אלון לבן ביוני 1862, לואיס נפגע ברגלו הימנית על ידי שבר של פגז ארטילריה. מאוחר יותר הוא השתתף בכל הקרבות של הגדוד החמישי, למעט
מיין רון ואנטיטאם עד מאי 1864, כאשר זרועו השמאלית נקטעה בכתף כתוצאה מפציעות שנגרמו לו במהלך היום הראשון של קרב המדבר. לאחר מכן הוא הועבר לפרדריקסבורג, ולאחר מכן לבאפלו, שם אשתו טיפלה בו במהלך החלמתו. בספטמבר 1864, הוא שוחרר בכבוד, והצטרף לחיל הווטריאן הרזרבי (VRC) כקולונל; במרץ 1865, הוא הועלה לגנרל חטיבה.