השלים את המשפט הבא: האוסף החשוב ביותר של המוזיאון קשור למלחמת העולם השנייה. ישנם פאנלים צילומיים שונים המראים את החיים במלטה במהלך המלחמה, במיוחד הקשיים של חיי האזרחים והנזק מהפצצות אוויריות. אחד הדברים הבולטים כולל את גוף המטוס של גלדיאטור "N5520" של גלוסטר סי, הניצול היחיד מטוס הקרב של האל פאר. המוזיאון מכיל גם ג'יפ Willys 'האסקי' בשימוש על ידי דווייט די אייזנהאואר לפני
הפלישה לסיציליה וגם על ידי רוזוולט בעת ביקור במלטה. צלב ג'ורג' שהוענק למלטה על ידי המלך ג'ורג' השישי באפריל 1942 מוצג גם במוזיאון. האוסף מכיל גם שרידי מטוסים התרסקו, רובי מכונת גרמניים שנתפסו, טורפדו, מרגמות תעלה ונשק אחר.