כתוב המשך לפרק זה - כפי שהמדינה התערבבה במשבר פנימי
, הממשלה הראשונה הודחה והורשתה על ידי כמה ממשלות שונות. בוליקנגו שימש כסגן ראש הממשלה באחת מהממשלות החדשות לפני שהושבה מצב של יציבות חלקית בשנת 1961. הוא שימש כמתווך בין הפלגים הלוחמים בקונגו, ושירת זמן קצר שוב כסגן ראש הממשלה בשנת 1962 לפני שחזר לאופוזיציה הפרלמנטרית. לאחר שג'וזף דזירה מובוטו עלה לשלטון בשנת 1965, בוליקנגו הפך לשר בממשלתו. מובוטו מיד פיטר אותו, אך מינה אותו למשרד הפוליטי של המפלגה העממית של המהפכה. בוליקנגו עזב את הלשכה ב-1970. הוא עזב את הפרלמנט ב-1975 ומת שבע שנים לאחר מכן. נכדו יצר את קרן ז'אן בוליקנגו לזכרו כדי לקדם התקדמות חברתית. נשיא קונגו העניק בוליקנגו לאחר מותו מדליה בשנת 2005 על הקריירה הארוכה שלו בשירות הציבורי.