התייחסו לקטע הבא ואז ענו על השאלה שאחריו באותה שפה כמו הקטע:  מעבר: חומצות אמינו משתנות ביכולתן ליצור את האלמנטים המבניים השונים. פרולין וגליצין ידועים לעתים כ"מפרקי הסליל" משום שהם משבשים את הרגילות של תבנית עמוד השדרה הסלילי; עם זאת, לשניהם יש יכולות תבנית יוצאות דופן והם נמצאים בדרך כלל בתורנות. חומצות אמינו המעדיפות לאמץ תצורות סליליות בחלבונים כוללות מטיונין, אלנין, לוצין, גלוטמט וליזין ("MALEK" בקודים של חומצות אמינו באחת האותיות); לעומת זאת, השאריות הארומטיות הגדולות (טריפטופן, טירוסין ופנילאלנין) וחומצות אמינו Cβ-רועשות (אייסולוצין, ואלין וטרונין) מעדיפות לאמץ תצורות β-שריר. עם זאת, העדפות אלה אינן חזקות מספיק כדי לייצר שיטה אמינה לחיזוי מבנה משני מתוך רצף בלבד.  שאלה: איזה סוג של מבנה דנ"א לא ניתן לחזות באופן אמין באמצעות השיטה הזו?
מבנה משני