ב-28 באוגוסט 1941, יותר מחודשיים לאחר תחילת מבצע ברברוסה, הפלישה הגרמנית לברית המועצות, פוחוב קיבל פקודה להחליף את מפקד חטיבת הרובים 304 של הצבא ה-38; זו הייתה פיקודו השדה הראשון מאז גדוד הרובים לפני כ -15 שנים. בתחילת ספטמבר הועברה לאזור קוזלשינה, שם עד 17 בספטמבר היא סבלה מפסדים כבדים בקרב הגנתי כבד, נסוגה מזרחה לאזור סנזרי, רשטיליבקה ופולטאווה. החטיבה ה-304 לחמה במבצע ההגנה בדונבאס בחודש אוקטובר, ואז נסוגה לאחסון באזור סנז'ני קוט. פוחוב החזיק בתפקיד זה עד ל-20 בינואר 1942, כאשר קיבל פיקוד על הצבא ה-13, אותו החזיק עד אמצע 1946. עד אמצע שנת 1942 החזיק הצבא, כחלק מ"חזית בריאנסק", בעמדות הגנה בקו של סקורודנויה וקולפני. הצבא נלחם בקרב וורונז'
באמצע 1942 ומבצע התקיפה של וורונז' - קאסטורנסק בתחילת 1943. ב-14 בפברואר, בעקבות זה האחרון, פוחוב הועלה לדרגת לוטננט גנרל. במהלך קרב קורסק ביולי, הצבא, החזיק עמדות על הפנים הצפוניות של גוש קורסק, דחה שישה ימים של התקפות גרמניות בלחימה חריפה, מונע פריצת דרך גרמנית ומגביל את ההתקדמות הגרמנית ל 10-12 קילומטרים. כאשר הכוחות הסובייטיים עברו לתקפה לאחר שהביסו את הצבא הגרמני, הצבא ה-13 נלחם במבצע קוטוזוב.