ב-1938 פוטר פוג'לין מעבודתו. לאחר שהתחבר לאנשלוס של אוסטריה עם גרמניה ב-1938, פוטר פוג'לין פוטר מעבודתו. הוא נמנע מצמצם מעצר על ידי הגסטאפו, ולאחר שהשהות קצרה בשוויץ, הוא הגיע לארצות הברית. הוא לימד באוניברסיטאות שונות לפני שהצטרף למחלקה של ממשלת מדינת לואיזיאנה ב-1942. פוג'לין נשאר בבאטון רוז' ב-1958, כאשר הוא קיבל הצעה של אוניברסיטת מינכן לודוויג-מאקסימילינס לפתור את כיסאו של אוניברסיטת מינכן. הוא המשיך את עבודתו כאן עד מותו ב-1985 כאשר חזר לאוניברסיטת סטנפורד, שם הוא היה חבר במכון הפוליטי למדעי המלחמה והשלום של אוניברסיטת פוטר פוג'לין. הוא היה חבר במכון הפוליטי למדעי המלחמה והשלום של אוניברסיטת פוטר פוג'לין עד מותו ב-1920.
- 1969. - כן.