עם פרוץ מלחמת האזרחים, כריסט קיבל מינוי ב-21 באפריל 1861, כסגן קולונל של חיל הרגלים החמישי של פנסילבניה. הוא יצא מהגדוד ב-25 ביולי, לאחר שלושה חודשים של שירות. בספטמבר הוא מונה לקולונל בחטיבת חיל הרגלים ה-50 של פנסילבניה, והשתתף בקרב פורט רויאל. במהרה הוא היה מפקד על החטיבה הראשונה, הדיוויזיה הראשונה של חיל ה- IX. בסאנטילי
הוא קיבל פיקוד זמני על הדיוויזיה שלו לאחר מותו של אייזק סטיבנס. הוא חזר לתפקיד המפקד של החטיבה הראשונה ונלחם בקרב סאות' מאונטיין ובקרב אנטיאטם ליד גשר ברנסייד. זמן קצר לאחר אנטיאטם הוא הועבר לפיקוד על החטיבה השנייה בחטיבה הראשונה. הוא הוביל את החטיבה הזו בקרב פרדריקסבורג. כריסט פיקד על החטיבה השלישית, הדיוויזיה השנייה בחטיבה התשיעית במהלך המצור על ויקסבורג, אך חזר לפקוד על החטיבה השנייה במהלך מסע נוקסוויל. באביב 1864 הועבר חיל ה-IX חזרה למגרש המערבי המזרחי וכריסט קיבל פיקוד על החטיבה השניה בחטיבה השלישית ונלחם בקרבות של המדבר, ספוטסילבניה, קולד הארבור. כשצבא האיחוד תקף את מפעלים הקונפדרציה בפיטרסבורג, כריסטוס נפצע. הוא עזב את המגרש לזמן קצר בלבד לפני שחזר להפקד על החטיבה הראשונה, הדיוויזיה השלישית בקורפוס התשיעי. הוא הוצב בצבא ב-30 בספטמבר 1864.