לאחר שחי בשלום בגלות במשך שלוש שנים בבוסטון, נינואי החליט לחזור לפיליפינים באוגוסט 1983 למרות התנגדות משפחתו, שכן הוא רצה להמשיך לרדוף אחר חירות עבור הפיליפינים. לאחר הנחיתה בנמל התעופה הבינלאומי במנילה ב-21 באוגוסט 1983, נינואי נרצח
על ידי חמוש לא ידוע, הרסני קורי והילדים. מותו של נינואי הועג על ידי מיליוני פיליפינים, והוכיח כי הוא מזרז למהפכת כוח העם של 1986 שגורשת את הנשיא מרקוס ומקימה את קורי כמנהיג החדש של המדינה.