לאחר מותו של קרומוול ושרידת המשטר, צ'ארלס השני הוחזר בשנת 1660 וסקוטלנד שוב הפכה לממלכה עצמאית. סקוטלנד קיבלה בחזרה את מערכת המשפט, הפרלמנט והכנסייה, אך גם את הלורדים של המאמרים (על פיו הכתר ניהל את הפרלמנט), הבישופים ומלך שלא ביקר במדינה. הוא שלט במידה רבה ללא התייחסות לפרלמנט, באמצעות סדרה של נציגים. אלה החלו עם ג'ון, הרוזן ממידלטון, והסתיימו עם אחיו של המלך ויורשו, ג'יימס, הדוכס מיורק (המוכר בסקוטלנד כדוכס אולבני). חוקי הניווט האנגליים מנעו מהסקוטים לעסוק במה שהיה יכול להיות מסחר רווחי עם המושבות האנגליות. החזרת האפיסקופיות הייתה מקור לצרות, במיוחד בדרום-מערב המדינה, אזור עם סימפתיה פרסביטרית חזקה. עזבו את הכנסייה הרשמית, רבים מתושבי העיר החלו להשתתף באסיפות שדה לא חוקיות, הידועות כקונבנטיקלים. ניסיונות רשמיים לדכא אותם הובילו להתקוממות ב-1679, שהובסה על ידי ג'יימס, הדוכס ממונמות', בנו הבלתי חוקי של המלך, בקרב גשר בוטוול
אני לא יודע. בתחילת שנות ה - 1680 החל שלב אינטנסיבי יותר של רדיפה, אשר נקרא מאוחר יותר "זמן ההרג". כשצ'ארלס מת ב־1685 ואחיו, קתולי רומי, ירש אותו כג'יימס השביעי של סקוטלנד (והשני של אנגליה), העניינים הגיעו לשיא.