כתוב המשך לקטע זה - סן חוזה נמצאת ליד מספר שברים פעילים, כולל שבר מונטה ויסטה, אזור שבר הייוורד, שבר קלאבראס, שבר סילבר קריק, ושבר סן אנדראס. אירועים משמעותיים התרחשו בשנת 1856, 1858, 1864, 1865, 1868, 1881, 1891, 1897, 1898, 1906
1957, 1989, ו-2007. רעידת האדמה בסן פרנסיסקו בשנת 1906, עם מרכזיה מעט מחוץ לחוף סן פרנסיסקו ליד פארק שער הזהב, הרסה בניינים רבים בסן חוזה. העיר עדיין הייתה בעיקר כפרית והאוכלוסייה הייתה הרבה יותר קטנה מסן פרנסיסקו. בתים ועסקים לא נבנו קרוב כמו שהיו בחצי האי, וזה סיפק פחות הזדמנות עבור שריפות גדולות. בית החולים Agnews Asylum (באחרונה בית החולים Agnews State) הושמד, והרג יותר מ-100 אנשים כאשר קירותיו וגגיו התמוטטו. מבנה אבן ובטון בן שלוש קומות של תיכון סן חוזה בן 8 שנים התמוטט גם כן, ומבנים רבים אחרים נפגעו קשות. היו הרבה רעידות אדמה מתונות אחרות שנחשפו בסן חוזה שגרמו נזק קטן או לא גרמו נזק כלל. רוב הנזקים שנגרמו מהרעידות אדמה מתוקנים במהירות, אבל חלק מההשפעות עדיין נראות בצורת סדקים סדוקים ומגדרות גבוהות.