נלסון נשאר עם צי הים התיכון במשך מספר שנים; הוא נלחם ב"אגממנון" בקרב גנואה
ב-1795, היה מכשיר בתבוסה של הצי הספרדי בקרב כף סנט וינסנט ב-1797, וב-1798 הוביל את הצי הבריטי שהשמיד את צי הים התיכון הצרפתי בקרב על הנילוס. בשנת 1800, במהלך המצור על מלטה, הוא נתקל שוב בפרה בקרב של שיירת מלטה, שבו פרה נהרג בפעולה וספינתו נתפסה על ידי נלסון. נלסון עצמו נהרג בקרב חמש שנים לאחר מכן בקרב טרפלגר, שבו הושמד צי צרפתי וספרדי משולב. הוא נזכר כאחד מפקדי הצי הגדולים והמצליחים ביותר של בריטניה.