השלמת המשפט הבא: הגעתו של המאמן החדש יולן לופטגי באוגוסט 2018 הביאה למודריץ' להחזרה יציבה לקבוצה הראשונה כתחליף בשל חוסר האימונים לפני העונה לאחר גביע העולם 2018. זה כלל הופעה תחליף בהפסד 2-4 של הקבוצה שלו לאחר זמן נוסף נגד אטלטיקו מדריד ב
גביע הסופר של UEFA. ההתחלה הראשונה שלו בעונה הייתה ב-1 בספטמבר בניצחון 4-1 מול Leganés, שבו הוא סיייע בשער השלישי של קבוצתו, שנשבר על ידי קרים בנזמה. הופעתו ה-100 בתחרות המועדונים של UEFA הגיעה ב-19 בספטמבר בניצחון של 3 נגד 0 נגד רומא, שבו הוא סיייע את השער השני, שנשבר על ידי גארת' בייל. ב -22 בדצמבר, מודריץ 'זכה בגביע העולם המועדוני השלישי שלו, כבש את השער הראשון ועזר לשלישי בגמר נגד אל עין. ב-13 וב-19 בינואר 2019, מודריץ' הבקיע לראשונה בשני משחקים ברציפות בליגה עבור ריאל מדריד, בניצחון של 1<unk>2 מחוץ לבית נגד ריאל ביתס ובניצחון של 2<unk>0 בבית נגד סביליה. באותה החודש נכלל בקבוצת השנה של UEFA (2018) בפעם השלישית בקריירה שלו. מ-27 בפברואר עד 5 במרץ, מודריץ' עבר את מה שהוא תיאר כ"השבוע הקשה ביותר בחיי הכדורגל שלו", כאשר ריאל מדריד הפסידה לברצלונה פעמיים ואייאקס ונפלטה מקופה דל ריי, מרוץ לתואר וליגת האלופות, בהתאמה. למרות שהייתה לו עונה לא מרגשת, בפעם החמישית ברציפות הוא נכלל ב-FIFPro World XI של פיפ"א.