במאה הראשונה לפנה"ס, שבט סקוני (הגאלים הגאלים ביותר על פי ההיסטוריון הנרי מרטין), אשר התרכז סביב Besançon, התיישב בסונדגאו. החל מ-70 לפנה"ס, הם נלחמו ללא הרף עם שכניהם, האדואיים, וביקשו משכורות גרמניות, בראשותו של אריוביסטוס. כשהסכסוך הסתיים, הגרמנים התיישבו באזור, והסקואנים, כדי להסיר אותם פנו לרומאים. יוליוס קיסר הביס את אריוביסטוס בשנת 58 לפנה"ס ליד קרניי, ושלטון ארוך של הרומאים החל. זה הסתיים לפתע בשנת 405, כאשר אלמאני חצה את הריין והשתלט על סונדגאו. הם, בתורם, נלכו על ידי הפרנקים בעקבות ניצחונם בקרב טולביאק
ב-496. סונדגאו הצטרף לממלכת אוסטרזיה והנוצרות הוצגה תחת המרובינגים.