כותב המשך לפרק זה - אף על פי שברנדוט סירב לעזור לנפוליאון בונפרטה לבצע את "הפיכה במדינה" שלו בנובמבר 1799, נפוליאון היה נחוש לנצח את "איש המכשול" ושטף אותו בכבוד. נפוליאון הכיר ביכולתו המנהלית והשפעתו של ברנדוט על ידי מינויו למועצת המדינה בפברואר 1800. באפריל 1800, למרות סימפתיותיו הרפובליקניות, הוצע לברנדוט, והוא קיבל בחופשיות, מאפריל 1800 עד 18 באוגוסט 1801, את תפקיד המפקד העליון של צבא המערב בונדה המרדנית, שם הצליח לשקם את שלוותה. זה נחשב כהזמנה של אמון, כאשר נפוליאון יצא למסע הקיץ האיטלקי שלו, שם הוא בסופו של דבר זכה בקרב מרנגו.
הוא השאיר את ברנדוט לא רחוק מפריז עם צבא. במכתב הפרידה שלו לברנדוט בדרכו לאיטליה, נאפוליאן כתב: "אני הולך לזרוק את עצמי פעם נוספת לסכנות המלחמה. אנחנו לא יודעים איך זה יכול להסתדר. אם אני אפול, אתה תמצא את עצמך עם 40,000 אנשים בשערי פריז. בידיך יהיה גורל הרפובליקה". מאחר וברנאדוט היה גיסו של יוסף וחברו הקרוב של אחיו ואחיותיו האחרים, נאפוליאון חשב על רווחת משפחתו במקרה אפשרי של מותו בשדה הקרב, כמו גם על עתיד המדינה, על ידי השארת יריבו לשעבר בעמדה לתפוס את שלטון הממשלה, מאחר ובין יריביו לשעבר, רק לברנאדוט היה מיומנות פוליטית וצבאית ופופולריות כדי לשמור על הרפובליקה.