ביוני או ביולי 1940 גרטרוד איזולני ובתו היו בין אלה שברחו ממחנה גורס. הם הצליחו להתחבר עם בעלה, ונראה כי הם חיו "בתחת-קרקע" בצרפת של וישי. לחיות מתחת לאדמה פירושו לא להיות רשומים עם העירייה במחוז שבו הם היו. במהלך השנתיים 1940 - 1942 האוטונומיה המוגבלת שהורשה על ידי הרשויות הגרמניות לממשלת הבובה תחת מרשל פטן ירדה בהדרגה. בנובמבר 1942 הכוחות הגרמניים כבשו את דרום צרפת בכוח, חלקית כתגובה להגעת הכוחות האמריקאים
בצפון אפריקה הצרפתית. בשלב זה, הג'נדרמים הצרפתים בערים ובמיוחד בערים הגדולות, הצטרפו או הוחלפו יותר ויותר על ידי קציני גסטאפו במדים. 1942 הייתה גם השנה שבה החלה הגירוש בקנה מידה רחב של יהודים גרמנים בצרפת: דיווחים דחופים ציינו כי אלה שנמצאו ונלכדו נשלחו ברכבת למחנות ההשמדה הגרמניים במזרח. הסכנה ליהודים הגרמנים (ולגולים "פוליטיים" גרמנים אחרים) שחיו במסתור בדרום צרפת גדלה בשל הסכנה הגוברת מצד הרשויות לכל אזרח צרפתי שעוזר להם. ב-11 בנובמבר 1942, עם בתה (בשלב זה טראומה קשה), ולאחר שני ניסיונות כושלים לחצות את הגבול, אורסולה איזולני הצליחה לחצות את הגבול לשווייץ. המקורות שותקים במידה רבה על מקום הימצאותה ופעילותה של איזולני בין בריחתה ממחנה ג'ורס והגעתה לשווייץ, ושתיקה זו מתרחבת לאופני בריחתם מצרפת הכבושה. ב-1969 אמרה איזולני למראיין שהישרדותה הייתה תוצאה של "מזל מקרי, ערמומיות, ובעיקר, הודות לעזרתם של אנשים טובים רבים".