אלי לילי (באנגלית: Eli Lilly; נולד ב-8 ביולי 1838 - נפטר ב-6 ביוני 1898) היה חייל, רוקח, כימאי ואיש עסקים אמריקאי, אשר ייסד את התאגיד התרופתי אלי לילי אנד קאמפאני. לילי התגייס לצבא האיחוד במהלך מלחמת האזרחים האמריקאית וגיבש פלוגה של אנשים שישרתו אתו בחיל התותחיות הקלה ה-18 של אינדיאנה. מאוחר יותר הוא הועלה למייג'ור ולאחר מכן לקולונל, וקיבל פיקוד על הגדוד התשיעי של חיל הפרשים של אינדיאנה. לילי נתפס בספטמבר 1864 והוחזק כאסיר מלחמה עד ינואר 1865. לאחר המלחמה, הוא ניסה להפעיל מטע במיסיסיפי, אך זה נכשל והוא חזר למקצועו של רוקח לאחר מותו של אשתו הראשונה. לילי עבד עם מספר שותפים עסקיים באילינוי ונישוא מחדש לפני שפתח את העסק שלו באינדיאנופוליס בשנת 1876.
חייל, רוקח, כימאי ואיש עסקים