הפנוטיפ של אורגניזם יחיד נובע הן מהגנוטיפ שלו והן מההשפעה של הסביבה שבה הוא חי. חלק ניכר מהשינוי הפנוטיפי באוכלוסייה נגרם על ידי וריאציה גנוטיפית. הסינתזה האבולוציונית המודרנית מגדירה את האבולוציה כשינוי לאורך זמן בגין זה. תדירותו של אלל מסוים תהיה נפוצה פחות או יותר ביחס לצורות אחרות של אותו גן. וריאציה נעלמת כאשר אלל חדש מגיע לנקודת הקביעה<unk>כאשר הוא נעלם לחלוטין מאוכלוסייה או מחליף את האלל האבותי באופן מוחלט. בריאציה טבעית תגרום לאבולוציה רק אם יש מספיק וריאציה גנטית באוכלוסייה. עד גילוי גנטיקה מנדליאנית, אחת ההשערות המשותפות הייתה תורשה. אבל עם התערובת פנוטיפית, חלק ניכר מהשינוי הפנוטיבי הפנוטיבי באוכלוסייה יעלם במהירות, על ידי וריאציה גנוטיפית.
השינוי עם הזמן.