כתוב המשך לפרק זה - לאחר שהוציאו לראשונה את ההסכם הלטבי תחת לחץ - סטלין איים באופן אישי על שר החוץ הלטיבי, במוסקבה, במהלך המשא ומתן - להציב כוחות סובייטיים על אדמת לטיביה, ברית המועצות פלשה ללטביה ב-16 ביוני 1940. מנהיגים אזרחיים ופוליטיים יהודיים החלו להיעצר באוגוסט 1940. הראשונים שנעצרו היו המנהיגים הציונים פביד ורפגיט ומחנוד אלפרין. מנהיגות ביתאר גורשו. ב-1941, הסובייטים עצרו את מרדכי נורוק, מר דובין ומנהיגים אזרחיים יהודים אחרים, ציונים, שמרנים וסוציאליסטים ימניים. הוראות המעצר שלהם אושרו על ידי ס. שוסטין. כאשר הסובייטים ביצעו את הסיבוב הראשון של גירוש המוני לבאלטים
, בליל ה-13 ל-14 ביוני 1941, אלפי יהודים לטביים גורשו יחד עם לטביים. מבין כל הקבוצות האתניות שגורשו, היהודים סבלו באופן פרופורציונלי יותר מכל קבוצה אחרת, וגורשו לתנאים קשים במיוחד. רשומות נשמרו על גירושם של 1,212 אזרחים לטביים יהודים (12.5% מאלה שגורשו למרחקים הרחוקים של ברית המועצות) אך מספרם האמיתי של היהודים הגורשים היה בהחלט גדול יותר, בסכום של 5,000 עד 6,000 במהלך הכיבוש הסובייטי הראשון.