כתוב המשך לפרק זה - לאחר ההפיכה הקומוניסטית של 1948 זנקל היה תחת מעקב מתמיד על ידי מנגנון ביטחון המדינה הקומוניסטי. הוא הצליח, עם זאת, לברוח עם אשתו למערב באוגוסט 1948. בשנים שלאחר מכן הוא הפך לראש תנועת הגלות הפוליטית בצ'כוסלובקיה. בין השנים 1949-1974 היה יו"ר המועצה של צ'כוסלובקיה החופשית, שבסיסה בוושינגטון. לאחר נפילת הקומוניזם
בשנת 1989, גופתו הועברה מארה"ב לבית הקברות וישהראד בפראג. באוקטובר 1991 הוענק לו, "in memoriam", את מסדר תומאס גאריג' מאסריק, מדרגה שנייה, על ידי הנשיא ואצ'לאב האבל.