התייחסו לקטע הבא ואז ענו על השאלה שאחריו באותה שפה כמו הקטע:  מעבר: עם מעבר המאה ה-16, ההומניזם המאוחר צעד לצד הקלביניזם כבית ספר דומיננטי של מחשבה; ודמויות כמו פול שדה, יאן גרוטר, מרטין אופיץ, ומתיאוס מריאן לימדו באוניברסיטה. היא משכה חוקרים מכל רחבי היבשת והתפתחה למרכז תרבותי ואקדמי. עם זאת, עם תחילת מלחמת שלושים השנים בשנת 1618, העושר האינטלקטואלי והפיסקלי של האוניברסיטה ירד. ב־1622 נגנב מקתדרלת האוניברסיטה הספרייה הפלטינית (ספריית האוניברסיטה) המפורסמת בעולם באותה עת ונלקחה לרומא. מאמצי השיקום לאחר מכן הובסו על ידי כוחותיו של המלך לואי ה-14, שהרס את היידלברג בשנת 1693 כמעט לחלוטין. כתוצאה מהמהפכה המאוחרת, האוניברסיטה איבדה את האופי הפרוטסטנטי שלה, והופנה על ידי הישועים. בשנת 1735 הוקמה האוניברסיטה העתיקה בכיכר האוניברסיטה, הידועה אז בשם Domus Wilhelmina. בזכות מאמציהם של הישועים הוקם סמינר הכנה, ה- Seminarium ad Carolum Borromæum, שתלמידיו נרשמו גם באוניברסיטה. לאחר הדיכוי של מסדר היזואיטים, רוב בתי הספר שהם ניהלו עברו לידי הקהילה הצרפתית של הלזרנים בשנת 1773. הם החלו להידרדר מאז, והאוניברסיטה עצמה המשיכה להפסיד יוקרה עד לשלטונו של הנבחר האחרון צ'ארלס תיאודור, הנבחר פלטיני, אשר הקים כיסאות חדשים לכל הפקולטות, ייסד מכונים מדעיים כגון האקדמיה הנבחרת למדעים, והעביר את בית הספר לכלכלה פוליטית מקייסרסלאוטרן להיידלברג, שם הוא היה משולב עם האוניברסיטה כפקולטה לכלכלה פוליטית. הוא גם ייסד אסטרונומיה בעיר השכנה של מאנהיים, שם ישועי כריסטיאן מאייר עבד כמנהל. בקשר עם יום השנה הרביעי למאה של האוניברסיטה, הנבחר אישר ספר חוקים משודרג שהוכרז לכמה פרופסורים להכין. העניינים הפיננסיים של...  שאלה: מה קרה במהלך מלחמת 30 השנים?
העושר האינטלקטואלי והפיסקלי של האוניברסיטה ירד