ב-2011 המוזיאון נסגר בשל חששות ביטחוניים בעקבות מלחמת האזרחים בלוב.
והמהומות שלאחר מכן. המוזיאון נשאר סגור החל משנת 2020. במהלך מלחמת 2011, המורדים נכנסו למוזיאון וכמה פריטים שהיו שייכים למואמר קדאפי נפגעו. החפצים היקרים ביותר נשמרו במקום אחר על ידי צוות המוזיאון. שאר הפריטים הקשורים לקדאפי הושבו במחסן על ידי הצוות.