בהיותה בת ארבע, החלה האניגן להופיע בפרסומות. בגיל 11 עברה להוליווד. היא התגוררה עם אמה והשתתפה בתיכון צפון הוליווד, בהצלחה עברה מבחנים לסוכנים תוך כדי ביקור אצל אביה בסנטה ברברה. לאחר הלימודים בתיכון צפון הוליווד, היא למדה באוניברסיטת קליפורניה, נורת'רידג', שם הייתה חברה באחוזה אלפא צ'י אומגה וקיבלה תואר בפסיכולוגיה. התפקיד הגדול הראשון של האניגן היה בסרט "אמא החורגת שלי היא חייזר", קומדיה מדע בדיוני שפורסמה בשנת 1988; אחד השחקנים שלה בסרט היה סת' גרין, אשר הצטרף אליה בהמשך בתפקיד הקבוע של באפי בתור החבר שלה על המסך. בשנת 1989, תפקידה הקבוע הראשון בסדרת טלוויזיה הגיע כאשר היא נבחרה לסדרת הסיטקום הקצרה של ABC "רוח חופשית".
11 - 11