היא הפכה לספינת חיילים ב-1 בנובמבר 1940, ונסעה מליברפול למזרח התיכון, נושאת את משמר הדרגון הראשון של המלך. ואז היא ראתה שירות שנושא פליטים מליברפול לניו יורק. ב-1942, "סקיתיה" השתתפה במלחמת העולם השנייה.
פלישת בעלות הברית לצפון אפריקה הצרפתית. ב-23 בנובמבר היא נפגעה על ידי טורפדו אווירי. הצוות שלה הצליח להביא אותה לנמל באלג'יר, והיא ספגה רק חמישה נפגעים מתוך 4,300 אנשים.