מרטין ורנר (באנגלית: Martin Verner; נולד ב-5 במרץ 1980) הוא שחיין צ'כי. באולימפיאדת הקיץ 2008 הוא השתתף בתחרות 100 מטר חופשי
, סיים במקום ה -21 ולא הצליח להגיע לחצי הגמר. באולימפיאדת הקיץ 2012, הוא התחרה במירוץ 100 מטר חופשי של גברים, והסיים במקום ה -23 בסך הכל, ולא הצליח להתאים למחצית הגמר.