ב-1995 יוגוביץ' נרכש מסמפדוריה על ידי יובנטוס, שהמאמן שלה באותה עת היה מרצ'לו ליפי. בעונה הראשונה שלו, יובנטוס סיים במקום השני בסרייה א. בגמר ליגת האלופות של 1996 הוא הופיע כמחליף לאנטוניו קונטה והשיג את העונש המכריע עבור יובנטוס נגד אייאקס, לאחר תיקו 1<unk>1 לאחר ההארכה. בראיון ל- "Goal.com" ב-2017, הוא הזכיר שהוא הרגיש רגוע לפני שקיבל את העונש שלו נגד שומר האג'קס אדווין ואן דר סאר. לאחר תפקידו בניצחון בליגת האלופות, שיחק יוגוביץ' עבור יובנטוס לעונה אחת נוספת, שבמהלכה הוא השתתף בגביע הבין-יבשתי 1996.
יובנטוס ניצחה את ריברפלייט ב-1:0. באותה עונה, יובנטוס זכתה בתואר הסרי א' ב-1996-1997, לאחר מכן יוגוביץ' עזב ללציו. בסך הכל, הוא שיחק 77 משחקים במועדון מבוסס טורינו, וביצע 10 שערים.