כתוב המשך לקטע זה - כאשר פרצה המלחמה עם צרפת בשנת 1809, פון הילר קיבל פיקוד על ארמייה VI קורפס כיסוי האגף השמאלי של הצבא האוסטרי העיקרי. כאשר הקיסר נפוליאון הראשון של צרפת נפל על האגף השמאלי האוסטרי ב-20 באפריל בקרב אבןסברג, הילר הגיע וקיבל את פיקודו על V, VI, ו-II Reserve Armeekorps. הובס באבנסברג וב-21 באפריל בקרב לנדשוט
, הוא הפך נפרד מהצבא הראשי. ב-22 באפריל, הארכידוכס צ'ארלס הובס בקרב אקמולה ונסוג לחוף הצפוני של הדנובה. בלי להבין שהוא היה לבד על הגדה הדרומית, הילר תקף את מרשל צרפת ז'אן-בפטיסט בסיארז וזכה בניצחון קל בקרב ניומארקט-סנקט וייט ב-24 באפריל. לבסוף הבין את הסיכויים נגדו, הוא נסוג בסדר טוב לכיוון לינץ מ-25 באפריל עד 3 במאי. בתאריך האחרון הוא נלחם בפעולה אכזרית עם חילו של אנדרה מסנה בקרב אבלסברג. תבוסה זו אילצה את פון הילר לסגת מעבר לדנובה במאוטרן.