לאחר שהגיע לחזית המלחמה באפריל 1943 כטייס בגדוד התעופה התקיפה ה-566 בדרגת סמל בכיר, הוא לא טס במשימת הקרב הראשונה שלו עד 12 ביולי. עם זאת, ברגע שהוא חווה את הטבלה שלו באש הוא החל במהירות לצבור יותר מלחמות, בסך הכל חמישה משימות ביום אחד ב -26 ביולי. למרות שנורה ונאלץ לבצע נחיתת חירום ב-31 בינואר 1944, הוא והקלע שלו הצליחו לחזור בבטחה ליחידה שלהם רק כמה ימים לאחר מכן. ב-6 באוגוסט 1944 הוא היה מועמד לתואר גיבור של ברית המועצות לאחר שסיים 105 טיסות על איל-2. מיכליק המשיך לעלות במהירות בשורות יחידתו, וקיבל קידום למפקד טייסת בנובמבר 1944. באותה שנה הוא התקבל למפלגה הקומוניסטית. בזמן שהיתה הטייסת תחת פיקודו, צוותיה ביצעו 309 טיסות, אך איבדו רק מטוס אחד משלהם. בנוסף לטיסות קרביות כמפקד טייסת, הוא לקח על עצמו את האחריות על אימון הטיסה, אימון שישה טייסים חדשים בשנת 1945. ב-27 במרץ 1945 הוא היה מועמד לכוכב זהב שני, אותו קיבל ביוני. עד סוף המלחמה הוא היה ידוע ב-188 טיסות קרב, בהן הוציא 35 טנקים, שני מחסני תחמושת, 8 סוללות ארטילריה נגד מטוסים, חמש קטרות קיטור, 19 רכבי רכבת, 114 משאיות, והוריד FW 190. במהלך המלחמה הוא נלחם בחזית המערבית, בריאנסק, לנינגרד ובחזית הלבנורוסית השלישית, השתתף בקרבות קורסק
, אורל, קרסנויה סלסו-רופשה, לנינגרד, נובגורוד, ויבורג, נרווה, טלין, פרוסיה המזרחית, קוניגסברג, וזמלאנד.