ב-1 בספטמבר 1939, ביום הראשון של מלחמת העולם השנייה, לופטוואפה של גרמניה הנאצית הפציצה את ז'נין הבלתי מוגנת. תשע ימים לאחר מכן, חיילים גרמנים צעדו לתוך העיר, שנקראה "דיטפורט" ונשלטה בתוך Landkreis Dietfurt (ווארטלנד). כל שמות הרחובות הוחלפו בשמות של מנהיגים נאציים או שמות שנשמעו גרמניים. לא היה בית ספר לפולנים; ילדים היו צריכים ללכת לרגל לגורה, כפר מזרחית לז'נין. 600 פולנים גורשו, עם 200 נלקחו לעבודה בכפייה או למחנות ריכוז נאציים. בנובמבר ודצמבר 1939, בני ערובה, בעיקר המורדים של 1919, נורו במקומות שונים ברחבי העיר. במהלך הכיבוש
, הגרמנים גם הקימו ופעילו כלא נאצי בעיר. לאחר המלחמה, ב-21 באוקטובר 1945, נערכה קבורה המונית של 62 קורבנות שנחפרו בגוסאווה. בכפר גורה (כיום חלק מז'נין), נערכה קבורה חגיגית של 100 אזרחים יהודים, שנהרגו במחנה הריכוז הסמוך מורצ'ין, ונחשף אנדרטה שנוצרה על ידי אומני ז'נין ב -11 בדצמבר 1987.