Konplete fraz sa a: Sou 13 Jiyè 2011, li te anonse ke Jonathan ta kite Santos pou antrene ak jeyan Serie A Inter Milan, pandan y ap tann finalizasyon transfè a. De jou pita, sou 15 Jiyè, li ofisyèlman te vin yon jwè Inter, siyen yon kontra kat ane. Jonathan te fè premye l'Inter sou 11 septanm 2011 nan semèn de nan
2011<unk>12 Seri A, jwe 90 minit yo plen nan yon 4<unk>3 pèdi ale Palermo. Twa jou pita Jonathan te fè premye li nan Lig Chanpyon yo, jwe tout match la sou Matchday 1 kont bò Tik Trabzonspor nan yon pèt 0-1 nan San Siro.