Konplete fraz sa a: Nan mwa Jiyè 1993, Atletis yo te fè echanj Henderson pou Toronto Blue Jays ki te gen pou jwe pou Steve Karsay ak José Herrera. Li te fè yon pèfòmans dezapwente pou Jays yo, frape sèlman.215 nan 44 jwèt, ki te pwobableman akòz lefèt ke li te kase yon zo nan men li byen bonè ak ekip la, apre yo te frape pa yon lanp, byenke li toujou kontribye 22 baz vòlè ak 37 kouri make. Sepandan, malè frape li yo te kontinye nan post-sezon an, bat.120 nan
Seri chanpyona Lig Ameriken an ak.227 nan Seri Mondyal la. Sepandan, Henderson te enplike nan jwèt final la nan Seri Mondyal la ane sa a nan yon sèl mòd pou ki li te pi li te ye, kòm li menm ak Pòl Molitor nòt sou Joe Carter's Seri-fini kouri lakay yo. Aprè li te genyen dezyèm World Series bag li ak Toronto, li te siyen kòm yon ajan gratis ak Oakland nan mwa desanm 1993.