Ekri yon kontinyasyon pou paragraf sa a - Nan mwa mas 1861, Ferguson te komisyone kòm yon kòmandan nan milis Karolin di Sid la, apre sa yo te nonmen Lyetnan ak aide-de-kan bay C.S. Lame Brigadye-Jeneral P. G. T. Beauregard. Li te youn nan ofisye yo ki te resevwa rannman fòmèl la nan US Army Majò Robert Anderson nan Fort Sumter, leve drapo a premye Eta Konfederasyon, ak afiche gad yo an premye nan Fort Sumter. Apre syèj la, li te voye yo prezante drapo a konfederasyon premye frape pa lènmi tire nan Kongrè a Pwovizwa nan Eta yo konfederasyon. Li te yon Lyetnan-Kolonèl ak aide-de-camp pou Jeneral Beauregard pandan batay Shiloh la
Li pa gen pwoblèm. Pandan batay Farmington an, li te nan 28yèm Règman Kavalye Misisipi a. Li te kòmande inite a pandan y ap defann Vicksburg, epi li te ede sispann atak ki te fèt pa US Majò-Jeneral William T. Sherman ak US Commodore David Porter.