Suurem osa saartest on osa Saaremaa vihmametsade ökoregioonist, mis hõlmab ka Bougainville'i ja Buka saari; need metsad on sattunud metsamajandusliku tegevuse alla. Santa Cruz'i saared on koos naabersaarkonna Vanuatuga osa Vanuatu vihmametsade ökoregioonist. Muldade kvaliteet ulatub äärmiselt rikkalikest vulkaanilistest (mõnel suuremal saarel on vulkaanid, millel on erinev aktiivsus) suhteliselt viljatule kalkkivile. Rohkem kui 230 sorti orkideed ja muud troopilised lilled valgustavad maastikku. Imetajad on saartel vähe, kuid ainult maapealsed imetajad ja väikesed nahkloomad. Linnud ja roomad on kõige aktiivsemad.
kaks