1601. aastal konfiskeeris kuninglik kambri Týn. 1608. aastal tõstis Rudolf II selle kuninglikuks linnaks, kuid 1621. aastal pärast Valge Mäe lahingut
, see tagastati Praha peapiiskopkonnale ja muutus taas orjapidamislinnaks. Kolmekümneaastase sõja ajal põletati linn korduvalt maha ja hävitati. Linn kaotas kaks kolmandikku majadest ja lossi. Pärast sõda jätkus langus ja aastal 1680 tabas linna katkuepideemia.