Filipiinid olid sissetungiva impeeriumi jaoks kõige verisem sõjatänav, kus vähemalt 498 600 Jaapani sõdurit hukkusid Filipiinide vastupanuliikumise ja Ameerika sõdurite ühendatud võitluses, suurema hulga ohvreid võrreldes teisejärgulise teatriga, kogu Hiinaga, mis põhjustas Jaapanile umbes 455 700 ohvrit. Jaapani okupatsioon Filipiinidel lõppes sõja lõppedes. Filipiinide vabastamise eelõhtul käisid liitlasväed ja Jaapani impeerium Leyte lahe lahingus suurima merelahingu ajaloos. Ameerika armee oli võitlenud Filipiinide kampaanias alates 1944. aasta oktoobrist, kui MacArthuri kuues Ameerika Ühendriikide armee maandus
Leyte'l. Järgnesid maandumised ka teistes osades ja liitlased koos Filipiinide Ühenduse vägedega tungisid Manilla poole. Kuid võitlused jätkusid kuni Jaapani ametliku alistumiseni 2. septembril 1945. Sõja lõpus kadus Filipiinidel umbes 10 000 USA sõdurit, rohkem kui üheski teises Vaikse ookeani või Euroopa teatri riigis. Filipiinid kannatasid suure inimkaotuse ja tohutu füüsilise hävituse all, eriti Manila lahingus. Arvatakse, et 1 miljon filipinalast oli tapetud, suur osa neist sõja viimastel kuudel, ja Manila oli ulatuslikult kahjustatud.