1172 aastal vallutasid Murcia Põhja-Aafrika Almohadid, viimane moslemite impeerium, kes valitses Lõuna-Hispaaniat, ja kui kristliku Reconquista väed võitsid, oli see 1223.-1243. aastal väikese moslemite emiraadi pealinn. Alcarazi lepinguga aastal 1243 tegi kristlik kuningas Ferdinand III Kastiilia Murciast protektoraadi, saades juurdepääsu Vahemerele, samal ajal kui Murcia oli kaitstud Granada ja Aragoni vastu. Kristlikest elanikest sai linnas enamus, kuna sisserändajad voolavad sisse peaaegu kõigist Ibeeria poolsaare osadest. Kristlikke sisserändajaid julgustati eesmärgiga luua lojaalne kristlik alus. Need meetmed viisid moslemite rahva ülestõusuni.
1264. aastal, mida kukutas Aragoni James I 1266. aastal, vallutades Murcia ja tõstes endaga Aragoni ja Kataloonia sisserändajad.