Kui Margaret, tema poeg ja naise tütar (Anne) olid valmis järgima Warwickit tagasi Inglismaale, olid lauad jälle pöördunud yorklaste kasuks ja krahv võitis ja tappis Barneti lahingus tagasi tulnud kuningas Edward IV.
14. aprillil 1471. Margaret oli sunnitud juhtima oma armeed Tewkesbury lahingus 4. mail 1471. aastal, kus Lancasteri väed purustati ja tema seitseteistkümneaastane poeg Edward of Westminster tapeti. Eduardi surma asjaolusid pole kunagi selgitatud; pole teada, kas ta sai surma tegelikus lahingus või hukati Clarence'i hertsogi poolt pärast lahingut. Eelmise kümne aasta jooksul oli Margaret saanud agressiivseks ja halastamatuks maine, kuid pärast Tewkesburys kaotust ja oma ainsa poja surma oli ta täiesti murtud. Pärast seda, kui William Stanley ta lahingu lõpus vangi võttis, vangistati Margaret kuningas Eduardi käsul. Ta saadeti esmalt Wallingfordi lossi ja seejärel Londoni torni, mis oli turvalisem. Heinrich VI vangistati ka Tewkesbury pärast Toweris ja ta suri seal 21. mai öösel; tema surma põhjus on teadmata, kuigi kahtlustatakse kuningapüüdmist. Aastal 1472 anti ta oma endise naise hoolde Alice Chaucer'i, Suffolki hertsoginna hoole alla, kus ta jäi kuni Louis XI lunastamiseni aastal 1475.