1860. aastal oli Young pardal sõitval külgkäigulistel aurufregatidel, mis tegutsesid Mehhiko lahe, Vahemere eskadrilli ja Ameerika Ühendriikide ida ranniku ääres. Ta oli "Susqehanna" pardal, kui Ameerika kodusõda 1861. aasta aprillis puhkes, ja osales Ameerika Konföderatsiooniriikide liidu blokaadis. Ta osales ka "Susquehannal"
Hatteras Inlet, Põhja-Carolina, 28. augustil 1861 ja Port Royal lahing Port Royal, Lõuna-Carolina, 7. novembril 1861. Novembrist 1861 kuni juunini 1862 oli ta sõjalaeva juhtiv ohvitser, kes osales Wilmingtoni, Põhja-Carolinas, blokaadis, ja juunist 1862 kuni novembrini 1862 oli ta külgkäigu aurufregati juhtiv ohvitser, kes oli blokaadi kohus Charlestonist, Lõuna-Carolinas, ja ta edutati 16. juulil 1862 leitnantkomandöriks.