2013. aasta detsembri alguses teatas Harper, et ta hääletab 2014. aasta referendumil Šotimaa iseseisvuse üle "absolutne ei"
, jätkates, et ta aitaks hea meelega Better Together kampaaniat ja et seal oli "oluline vähemus" rohelistest, kes olid iseseisvuse vastu.