San Cristóbal Acasaguastlán'i ajalugu on pärit maiade kultuurist; selle elanikud on seotud Copán'i ja Quiriguá kultuuridega. 9. ja 10. sajandil e.m.a asusid nahuad San Cristóbali Acasaguastlán'i ümbruses elama, alustades kultuurilist segamist, mis viis nende põlisrahvaste keele (Alaguilac) tekkimiseni. Hispaania vallutamise ajal
San Cristobali linn asutati, sundides põliselanikke oma linnast põgenema mägedes. Valluutamise ajal oli Acasaguastlán indiaanlaste jaoks püha ja püha koht. See ei olnud suur ehitus, vaid ainult kummid nagu Guaytánis. Hispaanlased kasutasid oma San Cristobali linna jaoks eelajaloolist Acasaguastlán'i provintsit; selle keskne väljak oli 1812. aasta ühe iseseisvusvastase mässu koht. Pärast Guatemala iseseisvumist Hispaaniast aastal 1821 kuulus San Cristóbal Acasaguastlán Zacapa departemangule 13. aprilli 1908. aasta dekreedi 683 alusel; 3. aprilli 1934. aasta seadusandliku dekreediga 1965 loodi uus El Progreso departemangu, mis hõlmas San Cristóbal Acasaguastlánit. Kaks parimat näidet 16. sajandi barokk-arhitektuurist võib leida San Agustín Acasaguastlánist ja San Cristóbal Acasaguastlánist El Progreso's.