Bonaga tegi oma debüüdi Panama eest 2009. aasta UNCAF Rahvaste karika poolfinaalis, astudes viimasel minutil asendajana Hondurase vastu 30. jaanuaril 2009 ja alates 1. maist 2015 on ta teeninud kokku 23 mängu, teenides 1 väravat. Ta esindas oma riiki kahel FIFA maailmameistrivõistlusel ja mängis 2011. aasta FIFA maailmameistrivõistlustel.
ja 2013. aasta CONCACAF Gold Cup. 10. jaanuaril 2013 tegi ta Guatemala vastu sõbralikus mängus 67. minutil värava.