Ministeerium loodi algselt kui "Imperiaalne ja Kuninglik Siseministeerium", mis oli Austria-Ungari impeeriumi siseministeerium. Sellele järgnes 1918. aastal esimese vabariigi "riikliku siseministeeriumi" ("Staatsamt des Innern"), mis hiljem nimetati ümber "föderaalseks siseministeeriumiks". Pärast Natsi-Saksamaa lagunemist 1945. aastal
Ministeerium taastati praeguses vormis.