- Teel Sydneys toimuvatele olümpiamängutele osales Wouda 2000. aasta Euroopa veemängude meistrivõistlustel.
Soomes Helsingis, kus ta võitis 4×200 m vabas stiilis koos Martijn Zuijdwegi, Mark van der Zijdeni ja Pieter van den Hoogenbandiga pronssimedali. Wouda võitis bronsimedaali 4×200 m vabas stiilis stafetis 2000. aasta suveolümpiamängudel Austraalias Sidneys koos Martijn Zuijdweg, Johan Kenkhuis ja Pieter van den Hoogenband. Individuaalselt lõpetas ta 200 meetri individuaalses medley's viiendana ja 100 meetri rinnasõidus 13. kohal. 4×100 m medlee meeskonnaga lõpetas ta neljandana, kuid jäi medalile Klaas-Erik Zweringi, Joris Keizeri ja Pieter van den Hoogenbandi kõrval. Pärast Sydney olümpiamänge loobus Wouda ujumisest. Kuus kuud hiljem kirjutas Hollandi ajalehe NRC Handelsblad ajakirjanik Mark Hoogstad raamatu, milles kirjeldas Hollandi ujumise ülestõusmist Wouda karjääri tõttu.