1861. aastal, Ameerika kodusõja puhkemisel, värvis Twitchell I kompanii, 4. Vermonti jalaväe. Pärast rügemendi saabumist Washingtoni, et täita valveülesandeid ja lõpetada väljaõpe lahingute ettevalmistamiseks, määrati Twitchell tema kompanii kirjutajaks. Teda edutati kopralliks, seersantiks ja esimeseks seersantiks. Ta osales 1862. aastal Yorktown'i piiramises ja sai Lee's Mill'i lahingus kolm korda haavata, kuid mitte ükski tõsine. Ta osales 4. Vermonti diviisil täiendavates lahingutes, sealhulgas Savage'i jaama lahingus.
ja Seitsme Päeva Lahingud.