1964 ja 1965 kogutud kogemused võimaldasid 7-liitrise Mk II-l domineerida järgmisel aastal. Veebruaris võitis GT40 taas Daytonas. See oli esimene aasta, mil Daytona võistlus toimus 24-tunnises formaadis ja Mk II lõpetas 1., 2. ja 3. kohal. 1966. aasta märtsis Sebringis võitsid GT40-d uuesti kõik kolm tippkohtumist, X-1 Roadster oli esimene, Mk II teine ja Mk I kolmas. Siis juunis, Le Mansi 24 tunni võidusõidus
, GT40 saavutas veel ühe 1<unk>2<unk>3 tulemuse.