Kaks laulu, mis olid kaasatud algsele albumile - traditsiooniline Liverpooli rahvaslaul "Maggie Mae" ja improvisatsiooniline lugu "Dig It" - jäeti välja, kuna need "oli heas vormis soundtrack albumi jaoks [...] kuid nad ei sobinud mugavalt otse albumi kontseptsiooniga", vastavalt albumi remixer Allan Rouse'ile. Lennoni "Don't Let Me Down" lisati jooksvale järjekorrale, kuigi "Naked" sisaldab katuse kontserdi kahest versioonist koosnevat redigeerimist
, mitte B-pool "Get Back" singlist. "I've Got a Feeling" esitleti ka oma kahe katuse kontserdi võtte uues kompositsioonis. "The Long and Winding Roadil" kasutasid "Naked" produtsendid viimase võtte, mis salvestati viis päeva pärast seda, kui Spector oli originaalplaadile valitud.