Kuigi San Francisco jäi esimese diviisi meeskonnaks ja sagedaseks võistlejaks ülejäänud 1960. aastatel, ei võitnud see kümne aasta jooksul veel ühtegi pennanti; tegelikult võitis meeskond ühe diviisi meistrivõistluse 1969. aastast kuni 1986. aastani (1971
), ja ei esinenud World Series uuesti kuni 1989. aastani. Giants lõpetas neljal järjestikusel hooajal (1965-68) teisel kohal. 1969. aastaks näitas meeskonnal vananemise ja languse märke. Samal ajal kaalus Feeney't kõrgemate ametikohtade saamiseks Major League Baseball'i hierarhias. Pärast seda, kui tema kandidaatlus pesapalli voliniku ametisse ei õnnestunud, sai Feeney 5. detsembril 1969 Warren Gilesi asemele National League'i presidendiks.