Kirjuta selle paragrahvi edasi - 17. septembril 2006 lasti Sgorbati maha oma lastehaigla juures veidi pärast 12:30 õhtul, kui ta lõpetas õpetamise ja läks üle tee, et minna õdede majutusse, kus kolm teist nunnat ootasid temaga lõunat. Tema valvur ja autojuht Mohamed Osman Mahamud (nelja lapse isa) tapeti samuti. Arvatakse, et rünnak oli vastuseks paavst Benedictus XVI vastuolulistele kommentaaridele, mis ta oli teinud oma Regensburgi loengus.
, kuigi seda pole kunagi kinnitatud ega tõestatud. Tema surm toimus vahetult pärast 15. septembri märkused, milles karmjooneline vaimulik Sheikh Abubakar Hassan Malin ütles oma mošees palvetajatele, et nad peavad jahtima ja tapma kõik need, kes solvasid prohvet Muhamedi. Sel ajal tapeti mitmeid humanitaar- ja kristlikke vabatahtlikke. Kaks relvastatud meest tulid taksodest ja kioskidest välja ja tulistasid teda selga kolm või neli korda pärast seda, kui esimene kuul tabas tema reie. Tema valvur kaitses teda ja ta lasti maha pärast seda, kui ta oli ründajatele tulistanud. Üks kuuli oli tunginud ta selga ja lõiganud arterit, mis põhjustas tõsise ja kohese verejooksu. Sgorbati viidi kiirelt SOS-haiglasse, kuid suri hiljem seal operatsioonitabelis. Tema viimased sõnad olid: "Ma andestan, ma andestan, ma andestan", mida ta sosistas õele Marzia Feurrale. Kell 15.00 saabus lennuk, et viia tema surnukeha Nairobisse, kus see saabus kell 21.00; tema surnukeha viidi Lee matusekodusse.