480 eKr ohverdas Pärsia kuningas Xerxes 1000 lehma Athena Iliase pühamus, marssides läbi Hellespontine piirkonna Kreeka poole. Pärast Pärsia lüüasaamist aastal 480/479, sai Ilion ja selle territoorium osa Mytilene'i mandrivaldkonnast ja jäi Mytilene'i kontrolli alla kuni ebaõnnestunud Mytilene'i ülestõusuni.
428 kohta 427. Ateena vabastas nii-öelda Aktaia linnad, sealhulgas Ilion, ja registreeris need kogukonnad Delia Liiga. Ateena mõju Hellespontis vähenes pärast oligarhilist riigipööret aastal 411, ja sel aastal järgis Sparta kindral Mindaros Kserksest, ohverdades samuti Athenale Ilias. Alates 410-399 oli Ilion kohalike Lampsacus'i dünastide (Zenis, tema naine Mania ja usurpator Meidias) mõjupiirkonnas, kes haldasid piirkonda Pärsia satrapi Pharnabazus'i nimel.