Hoolimata Portugali neutraalsusest okupeerisid 1941. aasta detsembris Portugali Timorit Austraalia ja Hollandi väed, kes ootasid Jaapani sissetungi. Salazar reageeris vägivaldselt. Ta protesteeris, öeldes, et liitlased olid rikkunud Portugali suveräänsust ja ohustanud Portugali neutraalsust. Ida-Aafrikast saadeti tugev Portugali garnison (umbes 800 meest), et võtta üle Ida-Timori kaitse, kuid see ei jõudnud õigel ajal; 20. veebruaril 1942 hakkasid jaapanlased maanduma vägesid.
Timoril.