Kirjuta selle lõigu jätkumine - Ameerika kodusõjas teenis Geddes liidu armees, värbudes reameesena 8. Iowa jalaväega. Ta edutati kapteniks ja seejärel kolonelleitnantiks ning pärast 1862. aasta veebruari vabatahtlike koloneliks. Ta osales lahingutes Shiloh's.
, kus ta sai haavatud ja vangistatud. Ta oli mõnda aega vangis Madisonis Georgias ja Libby vanglas Richmondis Virginias. Pärast vahetust võitles ta Vicksburgi ja Jacksoni lahingus. Oktoobris 1863 anti talle brigaadi juhtimine ja ta saadeti Texase Brownsville'i. Seejärel teenis ta föderaalse okupeeritud Memphise, Tennessee provostmarshalis, mille ta päästis konföderatsiooni ratsaväe poolt Nathan Bedford Forresti juhtimisel. Ta juhtis brigadi mobiilses kampaanias ja võitles eristusega Hispaania kindluse lahingus. 13. jaanuaril 1866 nimetas president Andrew Johnson Geddesi ametisse vabatahtlike brevet-brigadööri-generaali määramiseks alates 5. juunist 1865. Ja Ameerika Ühendriikide senat kinnitas ametisse nimetamise 12. märtsil 1866.