Stone võitles suurte kodusõja lahingute ajal Savage'i jaamas.
Antietam, Chancellorsville ja Gettysburg. Pärast raskelt haavatud võitlust Antietamis sai ta teise leitnandi ametikoha. Pärast Gettysburgi lahingus saadud kolmandat haava saadeti ta Filadelfiasse ametisse.