Kirjuta selle paragrahvi jätkamine - aastal 1365<unk>66 ja 1384<unk>85 oli linn varjupaigaks Konstanz'i piiskopile, kui ta Constanz'ist välja saadeti. Enne 1324. aastat ja ajavahemikul 1371/1386 pandi linn võõrastele omanikele laenu tagatiseks. Aastatel 1359-1403 oli lossi omanikud kohalikud elanikud. Aastal 1374 anti neile vabastus sõjakuludest. Piiskopliku võimu nõrgestas ka valitsuse üleminek Habsburgidest Badeni krahvkonnale aastal 1415. Tänu oma asukohale religioossel piiril oli Kaiserstuhl katoliiklike piirkondade jaoks oluline sillapea. Nii esimeses Villmergeni sõjas (1655-1656) kui Toggenburgi sõjas
(või Teine Villmergeni sõda), aastal 1712 okupeeris Zürich küla. Religioossete konfliktide ajal oli liiklus Kaiserstuhl'isse sunnitud selle asemel ületama Reini Zürichi kontrollitud aladel. Kuna linnal ei olnud õigust Reinis laevate liiklusele maksu kehtestada, maksis see maismaa liikluse kaotamine linna suurema osa tollimaksude tulust. Siiski jäi linn rikkaks viinamarjakasvatuse ja loomakasvatuse, krediidi ja panganduse ning välisteenistuse tõttu. Selle aja jooksul ehitatud majesteetlike majadega peegeldub jõukus. (Gasthaus zur Krone aastal 1550, St. Blaise kloostri haldussala aastal 1563 ja 1612, "Marschallhaus" aastal 1764). Hooned, mis võimaldasid Kaiserstuhlil toimida piirkondliku keskusena, olid Reini parempoolsel kaldal ja kadusid 1798. aastal Badeni kantoni loomisel. Pärast seda, kui prantslased silla 1799. aastal hävitasid, lõppes piiriülesed liiklused Kaiserstuhli kaudu peaaegu kaks aastakümmet.