Nakajima osales 80 Formula 1 Grand Prix's, debüteeris Brasiilia Grand Prix's
12. aprillil 1987 tõi Honda mootorid Lotuse meeskonnale. Ta oli 34-aastane oma debüütvõistlusel, muutes ta üheks Formula 1 vanimaks debüütantiks tänapäeva ajastul. Ta lõpetas kuuendana ja sai seega punkti, vaid oma teisel võistlusel, 1987. aasta San Marino Grand Prix'l. Oma debüütisaajal oli Nakajima tema meeskonnakaaslane Ayrton Senna kõrgemal, ja paljud kahtlesid Nakajima kohal F1-s, väites, et kui mitte Honda, siis ta ei oleks seal olnud.