Taffarel tegi debüüdi Brasiilias 7. juulil 1988 Austraalia Bicentenary Gold Cupis, mängides kõiki nelja mängu ja andes kaks väravat, kui tema meeskond võitis turniiri. Ta oli ka järgmisel aastal Copa América väravas.
, mille ka Brasiilia võitis (oma kümneaastase karjääri jooksul osales ta viiel viimati nimetatud turniiril, võitis tiitli teist korda 1997. aastal ja kogus 1991 ja 1995. aastal teise koha medaleid). 1988. aasta Sooli suveolümpiamängudel võitis ta hõbedamedaali, päästes kolm karistust Lääne-Saksamaa vastu turniiri poolfinaalis: üks regulaarsel ajal ja kaks Brasiilia edukat tulistamist. Ta oli ka Brasiilia meeskonna liige, kes osales 1990. aasta FIFA maailmameistrivõistlustel Itaalias, kus Brasiilia kukkus kaheksateistkümnendast raundist pärast 1:0 kaotust rivaalidele ja kaitsvatele meistritele Argentiinale, kus Taffarel andis kogu turniiril kokku ainult kaks väravat.