Anna Elfriede Stoeckeri hilisemate aastate kohta on vähe teada. Ta suri Ida-Berliinis 3. augustil 1966. On tõenäoline, et pärast seda, kui ta oma lapsed 1933. aastal Inglismaal suhteliselt ohutusse kohta toimetas, naasis ta Saksamaale ja elas vaikselt järjestikku Hitleri Saksamaal (1933-1945), Saksamaa Nõukogude okupatsiooni tsoonis (1845-1949) ja Walter Ulbrichi Nõukogude-sotsialistlikus Ida-Saksamaal (1949-1966). Tema abikaasa jäänuste tuhk oli välja kaevatud pärast
1945 ja paigutati Friedrichsfelde surnuaiale, sotsiaalvõimu kangelaste jäänustele, ja pärast Elfriede Stoeckeri surma paigutati tema jäänused lähedusse.