29. juulil 2015 tegi Sabonis debüüdi Leedu meeste rahvuskoondises Austraalia vastu mängus, teenides 4 punkti ja haarates 7 rebaundi. Sabonis oli noorim mängija, kes on kunagi mänginud rahvuskoondises, võites Jonas Valančiūnase mõne päeva võrra. Sabonis keskmiselt 6 punkti ja 5,9 reboundi ettevalmistusmängude faasis, ja oli meeskonna teine parim rebounder pärast Valančiūnas. Sabonis mängis Leedu eest EuroBasketil 2015. aastal, võites oma debüüt-aastal hõbemedaali. Ta oli ka 2016. aasta suveolümpiamängudel Leedu olümpiamängija.
, kus ta keskmiselt 5,5 punkti ja 4,5 reboundi.