Uganda tegi oma paraolümpiamängude debüüdi 1972. aasta suve paraolümpiamängudel Lääne-Saksamaal Heidelbergis. Pärast osalemist 1976. aasta Torontos toimunud paraolümpiamängudel, jäi nad Paraolümpiamängudest eemale kuni 1996. aasta Atlanta mängudeni.
, ja on sellest ajast alates osalenud kõigis suveparalümpiamängudes. Need Rio de Janeiro mängud olid riigi kaheksas osalemine suve paralümpiamängudel. Uganda ei võitnud oma esimest paraolümpiamedaali enne Rio de Janeiros toimunud võistlust. 2016. aasta Paraolümpiamängud toimusid 7.-18. septembril 2016. aastal, kus osales kokku 4 328 sportlast, kes esindasid 159 rahvuslikku paraolümpiakomiteed. Atleetik David Emong oli ainus võistleja, kes osales Ugandast Rio de Janeiros. Kolm teist sportlast, Christine Akullo, Emmanuel Vukoja ja Bashir Bwanga, ei saanud meeskonda, sest nad jäid oma viimaste kvalifikatsioonivõistluste vahele. Emong valiti avamisseremoonial rahvaste paraadi lipu kandjaks.