Kirjuta selle paragrahvi jätkamine - Prkačin oli Horvaatia U-22 noorte rahvuskoondise liige. Tema debüüt suurel turniiril Horvaatia seniorvõistkonnaga toimus 1997. aasta Eurobasketil. Pärast seda mängis ta Horvaatia eest järgmistes suuremas FIBA turniirides: EuroBasket 1999, EuroBasket 2001, EuroBasket 2003, EuroBasket 2005 ja EuroBasket 2007. Ta esindas Horvaatiat ka 2008. aasta suveolümpiamängudel.
ja 2009. aasta Eurobasket. Prkačin oli kaks korda Horvaatia meeskonna kapten.