O'Doherty 1608. aasta ülestõusu ajal taastas ta aktiivse teenistuse Iiri armees, pärast Derry põletamist.
- Jah. 1624. aastal valiti ta Derry linnapeaks. Ta oli Buckinghami hertsogi George Villiers'i tugev toetaja ja juhtis Iiri vägesid, kes teenisid tema alluvuses La Rochelle'i piiramises. Ta sai surma Pont du Feneau lahingus.