1863. aasta alguses viidi 6. Missouri rügement üle Grand Gulfi, Mississippisse, kus rügement aitas ehitada kindlustusi. Rügement osales 29. aprillil Grand Gulfi lahingus. Koos paljude teiste meestega 1. Missouri brigadist viidi 6. Missouri 1. mail Mississippis asuvasse Port Gibsoni, et takistada liidu maandumist. Port Gibsoni lahingus
1. mail toimunud lahingus kasutati 6. Missouri rügementi konföderatsioonide liini parema tiiva toetamiseks. Kui liidu väed ähvardasid lõhkuda konföderatsioonide taganemisteed, ründas 6. Missouri diviis vasturünnakut. Laev sõitis sügavale liidu liini, kuid oli sunnitud mõne kauguse tagasipöörduma, kui ta kohtus liidu tugevdustega. 6. Missouri diviis eraldati ülejäänud Konföderatsiooni väest, hakkas ammendust tühjaks saama ja oli sunnitud võitlusretreedima, et liituda Konföderatsiooni põhiliste jõududega, kui need taganesid.