Kirjuta selle lõigu jätkamine - Horvaatia sõja ajal (1991 <unk> 1995) kahjustati või hävitati palju kirikuid Horvaatias. Zagrebi, Karlovaci, Slavonia ja Dalmaatsia piiskopid ja preestrid ning kõige ustavamad eparhiaid said pagulasteks. Viimased kolm olid peaaegu täielikult hüljatud pärast serblaste lahkumist Horvaatiast 1995. aastal (operatsioon Torm). Dalmaatsia eparhia asus ka ajutiselt Kninisse pärast seda, kui loodi iseseisvalt kuulutatud Serbia Krajina Vabariik. Slavonia eparhia peakorter kolis Pakracist Daruvari. Pärast operatsiooni "Storm"
, kaks kloostrit olid eriti kahjustatud, Krupa klooster, mis ehitati 1317. aastal, ja Krka klooster, mis ehitati 1345. aastal.