Obando määrati 25. mail 1985 San Giovanni Evangelista a Spinaceto kardinaliks-preestriks, saades esimeseks Nicaragua kardinaliks. Ta osales 2005. aasta paavstlikus konklaabis
mis valis paavst Benedictus XVI. Obando oli Nikaragua piiskoppide konverentsi president 1999. aasta detsembrist kuni 2005. aasta novembrini.