Salmond oli üks Šotimaa iseseisvuse kõige tähtsamaid pooldajaid, kutsudes korduvalt üles korraldama referendumi. Salmond on teinud kampaaniat globaalse soojenemise vastu ja valitsuses pühendunud Šotimaa heitkoguste vähendamise ja taastuvenergia tootmise seadusandlusele. Päev pärast 2014. aasta iseseisvusreferendumit
, kus enamus Šotimaa valijad lükkasid tagasi iseseisvuse Ühendkuningriigist, Salmond teatas oma kavatsusest mitte kandideerida SNP juhina novembris toimuval SNP rahvuskonverentsil ja anda pärast seda tagasi esimese ministri ametist. Tema asendaja Nicola Sturgeon, ainuke kandidaat, kes kandideeris juhtivale valimisele, järgnes talle SNP juhina. Ta esitas 18. novembril oma tagasiastumise ja järgmisel päeval asus tema asemele Sturgeon.