Fabián esindas Mehhikot mitmetes noorte kategooriates, enne kui ta jõudis seniori meeskonnale. Ta oli 2011. aasta Copa América algses nimekirjas, kuid ta visati meeskonnast välja ja peatati kuue kuu jooksul koos kuue teise mängijaga, kuna ta rikkus distsiplinaarkodeid oma kontsentratsioonihotellis Quitos. 2012. aastal aitas Fabián Mehhiko U-23 rahvuskoondise võistlejana Mehhiko 2012. aasta suveolümpiamängudele kvalifitseeruda ja võita 2012. aasta Touloni turniir, kus ta oli parim värava tegija. Fabián oli osa Mehhiko meeskonnast, kes võitis 2012. aasta Londoni suveolümpiamängudel olümpiamedaali pärast Brasiiliat finaalis lüüa. Ta osales ka 2011. aasta
2013. aasta CONCACAFi kuldmeistrivõistlused, 2015. aasta Copa América, 2017. aasta FIFA Konföderatsioonide karikaturk, 2014. aasta ja 2018. aasta FIFA maailmameistrivõistlused.