Beckett tegi oma postseason debüüdi 2003. aasta National League (NL) Division Series'i avamängus, kus ta lubas vaid ühe jookse seitsmes inningis San Francisco Giants'i vastu, kuid võttis kaotuse, kui Jason Schmidt lõi täieliku mängu shutouti. Kuid Marlinid tulid tagasi, et võita seeria neljas mängus. Tema järgmine algus, 2003. aasta NL meistrivõistluste seeria esimene mäng Chicago Cubsi vastu, ei läinud hästi, sest ta lubas esimeses inningis neli jookset, neist kaks Moisés Alou kodujooksul ja kuus jookset oma inningis. Marlinid võitlesid vastu ja võitsid mängu lisatäitides. Cubsid võitsid järgmised kolm mängu ja vajasid ainult ühe võidu, et võita seeria, kui Beckett naasis viienda mänguga. Ta lubas vaid kolmel Cubsil jõuda baasi, kaks korda ja jalutuskäigu ajal, et oma meeskonda elus hoida. Marlins võitis ka kuuenda mängu, osaliselt tänu kurikuulsale Steve Bartmani intsidendile.
- Jah. Seitsmendas mängus, kahe päeva puhkusel, tuli Beckett välja bullpennist, et visata neli inningsit ja Marlins võitis 9:6 ja võitis National League'i meistrivõistluse.