Jaapani väed ("Kombineeritud Laevastik") koosnesid tegelikult kahest erinevast laevastikust, mis olid seotud kahe eraldi operatsiooniga, nimelt operatsioon AL
(Aleutiade jaoks) ja operatsioon MI (Midway jaoks). Allpool olevas loendis on näidatud kõik MI operatsioonile määratud laevad, kuid Midway lahingus osalesid tegelikult ainult Nagumo esimene laevukandjate ründamisüksus ja Kurita Midway toetusüksus.