Viimane Vietnami sõja etapp toimus Schlesingeri ametiajal. Kuigi 1973. aasta kevadel olid kõik USA sõjalised väed Lõuna-Vietnamist lahkunud, jätkasid Ameerika Ühendriigid sõjalist kohalolekut teistes Kagu-Aasia piirkondades. Mõned senaatorid kritiseerisid Schlesingerit ja küsisid teda teravalt 1973. aasta juunis pärast tema kinnitamist, kui ta ütles, et soovitab USA pommitamise jätkamist Põhja-Vietnamis ja Laoses, kui Põhja-Vietnam alustab suure rünnaku Lõuna-Vietnami vastu. Kuid kui Põhja-Vietnam alustas 1975. aasta kevadel rünnakut, ei suutnud Ameerika Ühendriigid eriti aidata Lõuna-Vietnamit, kes lagunes täielikult, kui Põhja-Vietnam
Saigon vallutati aprilli lõpus. Schlesinger teatas varahommikul, 29. aprillil 1975, Saigoni evakueerimisest viimase USA diplomaatilise, sõjaväe ja tsiviilpersonali helikopteriga.