1805. aastal ühines Venemaa Napoleoni vastase koalitsiooniga. Pärast austerlaste langust Ulmis oktoobris 1805 pälvis Bagration kiituse oma eduka kaitse eest Schöngraberni lahingus.
(1805. aasta novembris), mis võimaldas Vene vägede taganemisel ja ühinemisel peamise Vene armee Mihail Kutuzov. 1805. aasta detsembris langes Vene-Austria ühendarmee Austerlitzi lahingus, kus Bagration juhtis liitlaste paremat tiivut Jean Lannesi juhitud prantslaste vastu. Hiljem juhtis ta Vene vägesid Soome sõjas (1808-1809) Rootsi vastu ja teises sõjas Türgi vastu (1806-1812) Doonau ääres.