Juunis 1945 edutati Jones RNR-i kapteniks ja saadeti admiral Mountbatten'i juhtimisel Kagu-Aasiale. Ta määrati Madalmaade Ida-India jaoskonna meretranspordi ohvitseriks Javas Batavias. Sõda Aasias lõppes 1945. aasta augustis Jaapani kapituleerimisega.
Kuid nad pidid ikkagi tegelema sõdurite ja varustuse tagasisaatmisega, samuti tsiviil- ja sõjavangide laevandamisega Jaapani laagritest.