1653 Šveitsi talupoegade sõda oli mitmete kantonite maapiirkondade rahva mässu. Ülestõus purustati, kuid see tõi kaasa mitmeid reforme. 1656. aastal tekkisid uuesti pingeid protestantide ja katoliiklaste vahel, mis viis esimese Villmergeni sõja puhkemiseni. Uus konflikt 1712. aastal põhjustas teise Villmergeni sõja.
, mis pööras võimu tasakaalu protestantlike kantonite poolt. 1847. aastal taastuvad religioossed konfliktid, mille tulemuseks on Sonderbundi sõda, mis viib Šveitsi föderaalseks riigiks moodustumiseni.