Ta võitles üksusega Fort Henry, Fort Donelson, Corinth, Shiloh ja Hatcher's Run'is. Seejärel jäi ta haigeks tüfoidi palavikuga ja ta vabastati 1. augustil 1862. Ta naasis pärast taastumist Chicago Mercantile'i iseseisva patarei kergete suurtükivägedega, kus ta võitles Arkansas Postis, Port Gibsonis.
, Champion Hill, Suur Must Jõgi sild, Vicksburg, ja Mansfield. Mansfieldi lahingus vangistati brigaad ja Arnold võeti vangi. Ta oli 14 kuud Texases Camp Fordis.