Kui I-6 oli Yokosukas, algas Aleutide kampaania 3. ja 4. juunil 1942 Jaapani õhurünnakuga.
Dutch Harbour, Alaska, millele järgnesid kiiresti Aleutide saartel Attu 5. juunil ja Kiska 7. juunil 1942. 10. juunil 1942 määrati "I-1", "I-2", "I-3", "I-4", "I-5", "I-6" ja "I-7" Põhja-väele tööle Aleutide saartel ja 17. või 20. juunil 1942 läks "I-6" Aleutide vetesse, et alustada oma neljandat sõjapatrulli. Ta ühines patrulli "K" ridaga Unimak Pass'i piirkonnas. 7. juulil 1942 sai ta käsu minna Kiska piirkonda. Kui ülejäänud allveelaevade eskadril sai 20. juulil 1942 käsu naasta Jaapanisse, kästi tal jääda ja tegutseda Kiskast.