31. augustil 2012 võitis tema Atlético klubi UEFA Superkupi, võites Monaco Louis II staadionil Chelsea't 4<unk>1. Kohaliku liigas sai meeskond hooaja muljetavaldavast algusest, lõpetades esimese poolaja teisel kohal, ainult Barcelonast taga ja linna rivaali Real Madridist kõrgemal. Lõpuks juhtis Simeone meeskonda liigas kolmandale kohale, mis oli sel ajal Atlético parim tulemus 17 aasta jooksul. 17. mail 2013 võitis ta Copa del Rey
pärast seda, kui Atlético võitis oma rivaali Real Madridi 2-1 Santiago Bernabéu staadionil.