Kuigi Robert Baldwin oli mõõdukas reformator, ei kiidanud ta ülestõusu tugevalt heaks
1837-1838. aastal ja tema vaatepunktide kohaselt andis ta väidetavalt halva kaitse Peter Matthews'ile (rebeli), kes hukati oma rolli eest mässu. Baldwin tegutses koos John Rolphiga mässuliste ja kuberneri asetäitja vahel vahendajana, kandes 5. detsembril 1837 relvarahu lipu mässuliste laagrisse Toronto põhja pool, kuid ei suutnud ära hoida relvastatud kokkupõrget. Ta ja tema isa William soovitasid lord Durhamile Briti valitsusele vastutavat valitsust.