Pärast operatsiooni Barbarossa, Saksa sissetungi Nõukogude Liitu, algust 22. juunil 1941, juhtis Drozd lahingu miinipaigutusoperatsioonidel Irbe väinas ja Soome lahe. Ta juhtis kruiiseri liikumist Rii lahest Tallinnasse ning juhtis lahingu viimati nimetatud sadamas peamise mereväebaasi kaitsmisel ja selle evakueerimisel.
Kronstadti. Nõukogude Liidu Kommunistliku Partei Keskkomitee tunnustas Drozdit nende operatsioonide "vabatahtliku juhtimise" eest. 16. septembril tõsteti ta admirilli asetäitjaks ja määrati Balti laevastiku eskadrilli komandöriks. Sellel ametikohal juhtis ta Hanko mereväebaasi oktoobri evakueerimist ja juhtis eskadriini Leningradi kaitsmisel. 1942. aastal sai Drozd oma teise Punase Lipu ordeni. Ta kontrollis eskadrilli laevade remonti ja meeskonna võitluskoolitust. Ta hukkus 29. jaanuaril 1943, kui tema auto kukkus läbi jääd Kronstadti ja Leningradi vahel Soome lahe ääres pärast seda, kui Saksa pomm purustas jääd. Ta maeti Leningradi Aleksandr Nevski lavra kommunistlikule kalmistule.