30. märtsil 2004 mängis Chhetri oma esimese mängu India U-20 meeskonna eest 2004. aasta SAF mängudel Pakistan U-23 meeskonna üle 1: 0 võidu.
Pakistanis. 3. aprillil 2004 tegi Chhetri kahe India U-20 meeskonna eest Bhutani U-23 meeskonna vastu 4-1 võidu. 12. juunil 2005 tegi Sunil oma esimese värava India jalgpallimeeskonna eest Pakistanis.