Ta on läbinud vasektomia protseduuri. 2009. aasta filmi "12 ringi" reklaamides teatas Cena oma kihlusest Elizabeth Huberdeauga. Nad abiellusid 11. juulil 2009. aastal. 1. mail 2012. aastal esitas Cena abielulahutuse, mis lõppes 18. juulil. Samal aastal hakkas ta kihluma kaasvõitleja Nikki Bellaga. Nad hakkasid kohtuma, kui Cena tegi talle 2. aprillil 2017 WrestleMania 33-l ettepaneku, kuid nende suhe lõppes 2018. aasta aprillil. Nad pidid abielluma 5. mail 2018. aastal.
11. juuli 2009