1862. aastal määrati patarei kindral A.P. Hilli kergete suurtükivägede diviisile ja võitles Seitsme Päeva lahingus. Sellel lahingus tulistati kaks hobust kapten McIntoshi alt ühe päevaga. Seejärel korraldati patareid ümber kindral Stonewall Jacksoni kuulsa teise korpuse juhtimisel. Patarei võitles kindral Jacksoniga Cedar Mountain'i lahingus, Teises Manassas, Chantilly
Harpers Ferry, Sharpsburg ja Fredericksburg. 1863. aastal osales patarei Chancellorsville'i lahingus ja Gettysburgi lahingus. 1864. aastal ei olnud patarei piisavalt mehi ja hobuseid, et tõhusalt lahingus tegutseda. Juunis 1864 vahetas patarei teenistust Charlestoni sadamas teenindava Charles Batteryga. 1864. aastal teenis Pee Dee kerge suurtükivägi Charlestoni sadama ümbruses, kuni neid kasutati Shermani merele marssimise aeglustamiseks. 1865. aastal jätkas Pee Dee kerge suurtükivägi Konföderatsiooni vägede osana kindral Johnstoni juhtimisel. 26. aprillil 1865 andis kindral Johnston oma väed alla. Pee Dee kerge suurtükiväe lipp ei alistunud kunagi. Selle asemel oli see ümbritsetud patarei juhataja, reamees R.C. Nettlesi keha ümber, kes naasis Lõuna-Carolina. Lahingu lipp jäi Darlingtoni piirkonna Pee Dee kerge suurtükiväe liikmete kätte kuni 1905. aastani, kui elanud veteranid selle Lõuna-Carolina seadusandjale üle andsid. Lipp on hiljuti säilitatud ja on tänapäeval Lõuna-Carolina konföderatsiooni reliikide ruumis ja Columbia sõjalises muuseumis Lõuna-Carolinas.