Kolm aastat hiljem 1159. aastal panid Yoshitomo ja Fujiwara no Nobuyori Go-Shirakawa koduaresti ja tapsid tema teenistuja, õpetlane Fujiwara no Michinori, mida nimetatakse Heiji mässuks. Lõpuks Taira no Kiyomori, toetades Go-Shirakawa, alistas Yoshitomo'd. Kioto'st põgenedes oli Yoshitomo sunnitud tapma oma poja Tomonaga. Hiljem reedeti Yoshitomo ja tapeti tema vannis. Kolm tema poega, Yoritomo, Minamoto no Yoshitsune ja Minamoto no Noriyori, jäeti hiljem Kiyomori poolt säästetud ja pagendatud.
puidust mõõgad