See reformis oma doktriine ja valitsust, tuginedes John Calvin'i põhimõtetele, millega Knox oli kokku puutunud, kui ta elas Šveitsis Genfis. 1560. aastal tühistas paavstliku jurisdiktsiooni ja kiitis heaks skottide konfessioon, kuid ei aktsepteerinud Knoxi esimese distsipliini raamatus sätestatud palju põhimõtteid, mille autor väitis muu hulgas, et paljud tolleaegses Šotimaa kirikus purustasid Roomaga, muu hulgas John Knoxi juhitud protestantliku reformi protsessis. See reformis oma doktriine ja valitsust, tuginedes John Calvin'i põhimõtetele, millega Knox oli kokku puutunud, kui ta elas Šveitsis Genfis. 1560. aastal, mõned aadlikud, linnapidajad ja burgessid, samuti mitmed kiriku mehed, väitsid kuninganna vastu olles, et nad on Šoti parlament, kaotasid paavstliku jurisdiktsiooni ja kiitsid heaks skottide konfessioon, kuid ei aktsepteerinud Knoxi esimese distsipliini raamatus sätestatud põhimõtteid, mille autor väitis muu hulgas, et kõik vana kiriku varad
1560 aasta