Pärast kahte hooaega Coyotes'iga vahetati Boynton 2008. aasta NHL Entry Draft'is
koos Keith Ballardiga ja Florida Panthers'i teise ringi valik Olli Jokineni eest 20. juunil 2008. 2008-09 hooaja jooksul sai Boynton oma väravast 21 punkti 68 mängus Panthers. 27. veebruaril 2009 saadeti Boynton Panthers'i teekonnast koju ja jäi kolmest mängust distsiplinaarsetel põhjustel vahele. Hiljem selgus, et see oli pärast tüli treener Peter DeBoeriga.