29. jaanuaril 1944 sai Boettiger Liitlaste sõjaväevalitsuses teenimise eest Legion of Merit'i. Tema kasupoeg Curtis Roosevelt märkis oma memuaarides, et Boettiger oli alguses oma sõjaväeteenistuses õnnetu, talle ei antud enne Sitsiilia sissetungi Põhja-Aafrikas väärt ülesandeid.
Arvas, et sõjavägi püüab teda perest tingitud probleemidest eemal hoida. Boettiger palus 1944. aastal üleviimist USA-sse, kus ta jätkas tsiviilisiku ametikohta.