Mortaigne juhtis suure mässu, mis halvas Rootsi sõjaväe, nõudes viivitamatut makset. 1641. aasta juulis kutsuti Mortaigne ja Adam von Pfuhl Stockholmi mässuliste esindajateks. Mortaigne edutati brigadigeneraaliks ja sai maad Pommeranias, samas kui ülejäänud armee sai makstud 486 200 taleri, mis tasusid krooni võlad. 1642. aasta jooksul osales Mortaigne Breitenfeldi teises lahingus ja sai hiljem Brieg'i lähedal toimunud lahingus raskelt vigastada. 1643. aastal rüüstasid Mortaigne'i väed üle Moravia. 12. veebruaril 1645 püüdis keisri patrull ta kinni Borna lähedal, kui ta kandis kaasas olulisi dokumente. Ta vabastati lunaraha eest, hiljem juhtis ta Rootsi keskkonda Jankau lahingus.
- Jah. 1646. aastal naasis ta Rootsi kuninganna Kristina heakskiiduga Hesse-Kassel'i krahvkonnale, saades kindralleitnandi auastme. Ta juhtis Hesse-Kassel'i vägesid Hessi sõjas. 10. juulil 1647 purustas kahurilöögi tema vasakut jalga, vigastades teda raskelt Rheinfels'i lossi piiramisel.