Bahrein on üldiselt tasane ja kuiv saaripaik Pärsia lahe piirkonnas. Riik koosneb madalast kõrbemaalt, mis tõuseb pehmelt madalale keskmisele kaljule, mille kõrgeim punkt on 134 m Suitsumägi (Jabal ad Dukhan). Bahreini kogupindala oli 665 km2 (257 sq mi), kuid tänu maa taaskasutamisele suurenes see 765 km2 (295 sq mi), mis on veidi suurem kui Hamburg või Isle of Man. Sageli kirjeldatakse seda kui 33 saare saaripaika, ulatuslikud maa taaskasutamise projektid on seda muutnud; 2008. aasta augustis suurenes saarte ja saaregruppide arv 84. Bahreini ei piirdu maa osakaalusega teise riigiga, kuid tal on 161 km (100 km) kalaveed. Riik väidab ka, et 22 km (12 km) Araabia territoriaalmerge ja 44 km (24 km) Araabia merge (24 km) on Bahreini suurima piirkonnas. Muharraini saar on Bahreini suurim looduslik maavarud, kuid see on vaid 2.2% Muharraini saarest.
Põllumaa