1958 liitus Alam teadlasena Pakistani Aatomienergia Komisjoniga ja ta määrati 1970. aastal liituda Nilore'is asuva riikliku laboratooriumi, Tuumateaduse ja -tehnoloogia Instituudiga (PINSTECH). Sõja ajal Indiaga
1971. aastal hakkas Alam huvituma arvutamisest ja matemaatikast, kirjutades lühidalt arvutiprogrammi, töötades samal ajal loogika ja matemaatikaga seotud probleemidega. Alam oli oluline tuuma- ja tehnoloogiainstituudi arvutiteaduse osakonna rajamisel enne füüsikaosakonna liitumist.