1580 aastal, aastal 1580. aasta dünastiate kriisi ajal, võttis Guarda piiskop D. João poolda Portugali iseseisvuse ja seadis vastu Filipiinide valitsuse. Piiskop seisab siis vastu Alcántara lahingu tulemusele.
ja jätkas António, Cratoni priori poolt, vastupidiselt kõigile teistele Portugali piiskoppidele. 18. märtsil 1582 mõistis paavst hukka Guarda piiskopi D. João "liigsete tegude" ning ta suri 1592. aastal Hispaania (Portugali) kuninga Filippi II valitsuse ajal.