Järgmine suur muutus rakustruktuuris toimus siis, kui bakterid olid neelatud eukarüootsete rakkude poolt koostöös, mida kutsuti endosümbioosiks. Küüstunud bakterid ja peremeesrakku läbisid seejärel ko-evolutsiooni, kus bakterid arenesid kas mittokondriteks või vesinikkosomideks. Veel üks süüvimine tsüanobakteriaalaste organismide poolt viis kloroplaaste moodustamiseni vetikate ja taimede hulgas. Üksikuliige eukarüootide, prokarüootide ja prokarüootide ajalugu ilmnes ligikaudu 610 miljonit aastat tagasi, kui need multikliige organismid hakkasid ilmuma mitmeliige ookeanide vabasse atmosfääri, kus tekkisid mitmesugused tsüanobakteriaalased organismid, sealhulgas mikroorganismid.
1,62,7 miljardit aastat tagasi