Kohe pärast pensionile jäämist, olles esinenud Hispaania teisel tasemel enam kui 300 mängus, kolis Garitano treeneriks, teenides assistendina hiljuti langenud Eibaris. Pärast reservide juhtimist määrati ta 2012.-2013. aasta esemeeskondade juhiks, mis hõlmas ka kõrvaldamist
Athletic Bilbao <unk> eelmisel aastal finalistid <unk> Copa del Rey'st ja lõpetas edutamise.