Antibiootikumide valik sõltub esialgu nakatunud isiku omadustest, nagu vanus, aluseks olev tervis ja infektsiooni tekkimise asukoht. Antibiootikumide kasutamine on seotud ka kõrvaltoimetega nagu iiveldus, kõhulahtisus, pearinglus, moonutused või peavalu. Suurbritannias soovitatakse ravi enne amoksitsilliini kultiveerimise tulemusi kogukonna poolt tekitatud pneumoonia puhul esimesena, koos tsükliini või klorithromyliiniga alternatiivina. Põhja-Ameerikas, kus kogukonna poolt tekitatud pneumoonia puhul on antibiootikumide "atüüpiline" kasutamine sagedasem, võib siiski põhjustada antibiootikumide kasutamisega seotud resistentsete bakterite sugude arengut.
kolmanda ja neljanda põlvkonna tsefalosporiinid, karbapenemid, fluorokinoloonid, aminoglükoosiidid ja vankomütsiin