2016. aasta hooaeg oli Malmö FF 105. hooaeg, 81. hooaeg Allsvenskanis ja 16. hooaeg järjest liigas. Nad võistlesid Allsvenskanis.
2015. ja 2016. aasta Svenska Cupen, kus nad lõpetasid teisena, ning 2016. ja 2017. aasta Svenska Cupen, kus nad kukkusid teise vooru. Hooaeg algas 20. veebruaril Svenska Cupeni rühmade etapiga, 2. aprillil algas liigasündmus ja 6. novembril lõppes hooaeg viimase liigasündmusega.