See asub San Francisco poolsaarel, Santa Clara orgu (Silicon Valley) loodeosas, umbes 60 kilomeetrit San Franciscost ja umbes 30 kilomeetrit San Jose'st. 2008. aastal jäi 60% sellest maast väljaarendamata. Stanfordi peamine ülikoolilinnak hõlmab loenduse määratud kohta inkorporeerimata Santa Clara maakonnas, kuigi mõned ülikoolimaad (näiteks Stanford Shopping Center ja Stanford Research Park) asuvad Palo Alto linna piires. Kampus hõlmab ka palju maad inkorporeerimata San Mateo maakonnas (sh SLAC National Accelerator Laboratory ja Jasper Biological Reserve), samuti asub linna piires.
20 miili