2013/14 FC Bayern Müncheni hooaeg oli 115. hooaeg klubi ajaloos ja 49. järjestikune hooaeg Saksa jalgpalli tippliigas, Bundesligas, alates nende edutamisest Regionalliga Südist 1965. aastal. Bayern osales sel hooajal DFB-Pokal, DFL-Supercup, UEFA Meistrite Liigas, UEFA Supercup
, ja FIFA klubi maailmameistrivõistlused.