16. juulil 1862 edutati ta leitnant-komandöriks ja juhtis Idalaheri blokaadi eskadriini kruvipommikut. Üle viidud Põhja-Atlandi eskadrilli aurukaitselaevale, võitles Chandler oma laevaga Fort Fisheri pommitamisel ja languses.
ja Wilmingtoni vallutamine 1865. aasta alguses, saades 25. juulil 1866. aastal komandöriastme.