Lõuna-Sudaani kliima sarnaneb ekvatoriaal- või troopilisele kliimale, mida iseloomustab kõrge niiskuse ja suure sademete koguse vihmane hooaeg, millele järgneb kuivem hooaeg. Keskmine temperatuur on alati kõrge, juuli on kõige külmem kuu, mille keskmine temperatuur jääb vahemikku 20-30 °C (68-86 °F) ja märts on kõige soojem kuu, mille keskmine temperatuur ulatub 23-37 °C (73-98 °F). Kõige rohkem sadet on näha mai ja oktoobri vahel, kuid vihmaperiood võib alata aprillist ja kesta kuni novembrini. Keskmiselt on mai kõige niiskem kuu. Hooaeg "mõmutab Lääne-Euroopa piirkonna aastane nihkumine" ja suundumine lõunapoolsete ja lõunapoolsete tuulde suunas veidi madalamate temperatuurid, kõrgemat niiskust ja rohkem pilvete katvust.
iseloomustab kõrge niiskuse ja suure sademete kogusega vihmahooaeg, millele järgneb kuivema hooaeg