Hunt sündis 19. veebruaril 1943 Liverpooli paleograafia õppejõuna Richard William Huntis ja puidukaupmehe tütre Kit Rowlandis. Pärast mõlema vanema surma sai Hunt teada, et tema isa töötas Bush House'is, siis BBC World Service raadio peakorteris, tõenäoliselt luure, kuigi ei ole teada, mida ta tegelikult tegi. 1945. aastal sai Richard Bodleian'i raamatukogus Lääne käsikirjade valvuriks ja pere kolis Oxfordi. Kaheksa-aastasena võeti Hunt vastu Dragon'i kooli, kus ta esmakordselt arendas huvi bioloogia vastu tänu oma saksa õpetajale Gerd Sommerhoff'ile. Kui ta oli neljateistkümnes, kolis ta Magdalen'i kolledžisse, kus teaduse auhinnad kannavad nüüd tema nime, muutudes veelgi huvitatud teadusest ja võimaldades tal õppida selliseid teemasid nagu keemia ja loomatervis, kuigi ei ole teada, mida ta tegelikult tegi.
Lohe Kool