Pärast Leedu Nõukogude Sotsialistliku Vabariigi moodustumist 1940. aasta juulis vallandati Gens tööst. Ta ei suutnud saada tööluba ega saanud lubada tal Kaunas edasi elada. Ta läks elama oma venna Solomon'iga Vilniusse ja kuigi Gens oli Nõukogude Liidu töölaagritesse saadetavate isikute nimekirjas, õnnestus tal kindlustada endal vanal sõjaväelasele kolleegi, kolonel Juozas Ūsase kaudu registreerimata töö Vilniuse tervishoiuosakonnas. Gens ei olnud ametlikul palgal, mis tähendas, et haigla poliitilist ametnikku ei olnud vaja tema töölevõtmisest teavitada. 1941. aasta juunis, kui tuhandeid Leedu eliiti Siberisse saadeti,
, Gens jäi peidus ja ei olnud deporteeritud.