2006 võitis Déby kolmandat ametiaega valimistel, mida opositsioon boikoteeris. Etniline vägivald Ida-Tšaadis on kasvanud; ÜRO pagulaste ülemvolinik on hoiatanud, et sarnane genotsiid nagu Darfuris võib veel toimuda Tšaadis. 2006. ja 2008. aastal
Mässuliste väed püüdsid võita pealinna jõuga, kuid ebaõnnestusid mõlemal korral. 15. jaanuaril 2010 allkirjastati Tšadi ja Sudaani vahelise harmoonia taastamise leping, mis tähistas viieaastase sõja lõppu. Suhete parandamine viis Tšadi mässuliste kodumaale naasmiseni Sudaanist, kahe riigi piiri avamiseni pärast seitsme aasta pikka sulgemist ja ühiste jõudude paigutamiseni piiri kindlustamiseks. 2013. aasta mais tõrjusid Tšaadi julgeolekujõud kuue kuu jooksul ettevalmistatud riigipöörde presidendi Idriss Déby vastu.