Täitke järgmine lause: 1861. aasta juunis sai O'Neal kapteniks ja juhtis kolme sõdurikompaniid. Richmondisse jõudmisel määrati ta 9. Alabama jalaväe rügemendi majoriks ja autunnis edutati ta kolonellileitnantiks. 1862. aasta märtsis määrati ta 26. Alabama jalaväe polkovnikuks ja juhtis seda rügementi poolsaare kampaania ajal. Seitsme Pini lahingus tapeti tema hobune tema all ja ta sai raskelt haavata kuulipeenest. Ta sai suure kiituse oma esinemise eest Chancellorsville'i lahingus. 1863. aastal juhtis ta brigadi kindralmajor Robert E. Rodes'i diviisist ja juhtis seda Gettysburgi lahingus, Manassas Gap'i lahingus ja
Kaevanduse lahing. 1864. aasta alguses saadeti tema rügement tagasi Alabamasse, et värvata oma ammendatud ridadesse, kuid ta saadeti kiiresti Daltoni, Georgiasse, kus O'Neal võttis üle komandör-generaal James Cantey brigaadi Tennessee armee. O'Neal juhtis seda brigaadi Atlanta kampaania ülejäänud osa. Pärast seda, kui leitnant-generaal John Bell Hood sai Tennessee armee juhtimise, vabastati O'Neal ja ta teenis sõja lõpuni. Ta nimetati 6. juunil 1863 brigadigeneraliks, kuid seda ametikohta hoidis kinni kindral Robert E. Lee ja edutamine tühistati Konföderatsiooni presidendi Jefferson Davise poolt.