Pärast seda, kui jakobid saavutasid märkimisväärse edu 1745. aasta ülestõusu varajases staadiumis, saadeti Royal Écossais novembris Šotimaale; laev, mis vedas MacDonnelli, peeti kinni ja ta ühines oma isaga Johniga Londoni torni. Tema noorem vend Aeneas koostas klanni ja võitles Falkirki lahingus.
1746. aasta jaanuaris, kuid tapeti kogemata pärast lahingut.