21 detsembril 1801, kui Fanny oli seitsmeaastane, abiellus Godwin Mary Jane Clairmont'iga, naabriga, kellel oli kaks last: kolmeaastane Claire ja kuueaastane Charles. Ta ei olnud kunagi abielus olnud ja otsis nagu Godwin finantsstabiilsust. Kuigi Clairmont oli hästi haritud ja hästi reisinud, põlasid teda enamik Godwini sõpradest, leides teda vulgaarseks ja ebaausaks. Nad olid hämmastunud, et Godwin võis asendada Mary Wollstonecraft'i temaga. Fanny ja tema poolõde Mary ei meeldinud oma kasuemale ja kaebasid, et ta eelistas oma lapsi neile õpetada. 28. märtsil 1803 sündis William, kellele William oli sündinud.
vulgaarne ja ebaaus