O'Malley nimetati Saint Thomas'i piiskopkonna piiskopiks 30. mail 1984 paavst Johannes Paulus II poolt. Ta sai piiskopliku pühitsemise järgmisel 2. augustil piiskop Edward John Harperi poolt, peapiiskop James Hickey ja piiskop Eugene Marino teenides koospühitsetajatena.
Peapiiskop