Ferrara alustas oma karjääri 1980. aastal kodulinna Napoli noorteorganisatsioonis. Ta lõpetas "primavera" noorte meeskonna 1984. aastal ja hakkas teenima esimese meeskonna kutsed sel hooajal. Ta mängis oma esimesel täisajal klubis 14 mängu. Järgmisel hooajal sai Ferrara osa algusest XI-st ja peagi hakkas ta teenima üleskutseid Itaalia rahvuskoondisse, moodustades 1990. aasta FIFA maailmameistrivõistluste meeskonna. Ta tegi ka ühe Napoli värava, kui nad võitsid 1989. aasta UEFA karika finaali. Lisaks UEFA karikavõistlusele võitis ta Napoli meeskonnaga ka kaks Serie A tiitlit (1986-1987).
1989 ja 1990), 1987 Coppa Italia finaal ja 1990 Supercoppa Italiana, viimati tema tulevase meeskonna, Juventus.