Khan nõudis avalikult Pakistani vabandust Bangladeshi rahva ees 1971. aastal toime pandud julmuste eest.
Ta nimetas 1971. aasta operatsiooni "vigaks" ja võrdles seda tänase kohtlemisega pahtunite suhtes terrorismivastases sõjas. Kuid ta kritiseeris korduvalt vangide kasuks toimuvaid sõjakuritegude kohtuprotsesse Bangladeshis. Khanit pilgitakse sageli "Talibani Khanina" tema rahuliku seisukoha tõttu seoses sõjaga Põhja-Lääne-Pakistani. Ta usub läbirääkimistesse Talibaniga ja Pakistanise Armee väljaviimist FATAst. Ta on USA droonide rünnakute vastu ja plaanib Pakistanit USA juhitud terrorismivastasest sõjast eemaldada. Khan on ka vastu peaaegu kõikidele sõjalistele operatsioonidele, sealhulgas Lal Masjidi piiramisele.