Täida järgmine lause: 31. augustil 2010 sõlmis ta lepingu Itaalia Serie A meeskonnaga Bolognaga 2,1 miljoni euro eest (sealhulgas 5% solidaarsusmaks noorteklubidele). Sellel päeval ei olnud tasude maksmine kavandatud, kuid 31. detsembril 2010 ja 30. juunil 2011 oli kavandatud kaks võrdset osamakset. Bolognas on ta teinud koostööd teiste Uruguay rahvusvaheliste mängijatega, Henry Damián Giménez, Gastón Ramírez ja Miguel Britos, enne kui ta lahkus meeskonnast, et liituda S.S.C. Napoli. Pérez esimesel hooajal
Serie A, Bologna saavutas 16. koha ja lõpetas kuus punkti kaugusel langemisest, kinnitades neljandat järjestikust hooaega Itaalia tippliigas. Ta tegi kampaania ajal ka kolm assistit, mis on meeskonna suurimast assistist koos Riccardo Meggioriniga.