Tema vanaisa William J. Comey oli ohvitser ja hiljem Yonkers'i politseiosakonna volinik. Perekond kolis 1970. aastate alguses New Jerseysse Allendale'i. Tema isa töötas korporatiivse kinnisvara valdkonnas ja tema ema oli arvuti konsultant ja koduperenaine. Comey on Iirimaa päritolu. Ta käis Põhja-Highlandi regionaalses keskkoolis Allendales; 1977. aastal olid tema ja tema vend ohvrid kurjategija "Ramsey vägistaja" poolt tehtud sissetungil. Comey lõpetas Williami ja Mary kolledži 1982. aastal keemia ja religiooni alal.
Juris Doctor (JD)