Kirjuta selle paragrahvi jätkamine - 13. aprillil 1796 saadeti Willot "Rhin-et-Moselle'i armeesse". Samal aastal 25. juulil võttis ta üle 8. sõjaväediviisi juhtimise. See oli Marseilles, kus ta väitis, et on erapooletu, kuid õnnestus solvata jakobinide parteid. Napoleon Bonaparte mõjutas teda tema eemaldamisel. Sel ajal liitus ta rojalistide fraktsiooniga. Ilmselgelt olid tema poliitilised kalduvused hästi teada, sest Pierre Augereau väitis, et Willot oli Marseilles peaaegu saboteerinud Arcole'i lahingu.
Itaalia sõjaväe tugevdamine. Willot valiti viiekümne nõukogu liikmeks 11. aprillil 1797. Ta valiti Bouches-du-Rhône'ist 102 häälega 203st. Ta sai nõukogu sekretäriks ja hiljem inspektoriks.