Kirjuta selle paragrahvi jätkamine - Nikephoros sündis 1002. aastal Michael Botaneiates'ile ja tema naisele, Botaneiates'i perekonna liikmetele, tuntud sõjaväeperekonnale Anatolia teemal. Vastavalt Attaleiates, Nikephoross vanaisa Nikephoros ja isa Michael mõlemad teenisid komandörid Basileuse II ajal tema kampaaniad Gruusia ja tema vallutus Bulgaaria
Attaleiates on ainus allikas, mis annab selle teabe. Attaleiates väidab ka, et Botaniati perekond oli seotud Bütsantsi keisri Nicephorus II Phocas ja Phocas perekonnaga. Seda kasutas peaaegu kindlasti Nikephoros, et lisada legitiimsust oma hilisemale valitsemisele, ja seda kinnitab Psellos, kes kutsub Nikephoros III "Phocas" oma reprodutseerimises Bütsantsi keiser Michael VII Doukas'i kirja talle. Nikeforos abiellus teadmata kuupäevaga naisega Vevdene, kuid hiljem abiellus ta Alania Mariaga, Mihael VII endise naisega. Tundub, et tal oli Vevdene'iga vähemalt üks laps, sest Anna Komnene mainis tema lapselapset "Alexiadis". Nikephorossi elust enne 1053. aastat on vähe teada, välja arvatud see, et ta teenis keisri Konstantinus IX Monomachose all 1048-1053 Pecheneegide ülestõusu ajal.