Klubi asutas 4. veebruaril 1899 Fußballverein Werder 16 kutseõppe keskkooliõpilase rühma poolt, kes olid võitnud auhinna spordiseadmete eest. Õpilased võtsid klubi nime saksa sõnast "jõe poolsaar", mis kirjeldas jõekaart, kus nad mängisid oma esimesi jalgpallimänguid. Bremeni eelkäija, tuntud kui SV Werder, mängis oma esimese mängu 10. septembril 1899 ASC 1898 Bremeni vastu, tulles ära 1<unk>0 võiduga. 1900. aastal esindas FV Bremen Saksa jalgpalliliidu (BDF) asutamisel Leipzigis.
Fußballverein Werder