Perrin õppis École Normale Supérieure'is Pariisis. Ta sai kooli assistendiks ajavahemikul 1894-97, kui ta alustas katoodkiirte ja röntgenkiirte uurimist. Tal anti doktorikraadi (PhD) 1897. Samal aastal määrati ta füüsikalise keemia õppejõuks Pariisi Sorbonne'is. Ta sai ülikooli professoriteks 1910. aastal, hoides seda ametikohta kuni Prantsusmaa saksa okupatsioonile Teise maailmasõja ajal.
Lille, Prantsusmaa