Mikrobioloogiline hindamine on näidustatud ka raske kopsupõletikku, alkoholismi, aspleeniat, immunosupressiooni, HIV-nakkuse ja alkoholi kuritarvitamise korral. Kuigi positiivne vere kultuur ja pleuraalvedeliku kultuur määravad lõplikult kindlaks diagnoosiga seotud mikroorganismide tüübi, tuleb positiivset sputumkultuuri tõlgendada hoolikalt hingamisteede koloniseerimise võimaluse suhtes. Teiste spetsiifiliste organismide testimine võib soovitada rahvatervise põhjustel puhangute ajal.
Legionella ja Streptococcus antigeenid