Lountzis oli 2014. aasta FIBA Euroopa U-16 meistrivõistlustel Kreeka U-16 rahvusmeeskondade kapten. Ta mängis ka Kreeka noorte rahvuskoondises 2015. aasta FIBA U-19 maailmameistrivõistlustel.
, 2015. aasta FIBA Euroopa U-18 meistrivõistlustel, kus ta võitis kuldmedali, ja 2016. aasta FIBA Euroopa U-20 meistrivõistlustel 2. divisjonis B, kus ta võitis pronssmedali. Ta mängis ka 2017. aasta FIBA 20aastaste Euroopa meistrivõistlustel, kus võitis kuldmedali.