1887. aastal sai Vasconcelos teoloogilise teaduskonna professoriks. Sellel ametikohal õpetas ta erinevaid kursusi, sealhulgas dogmaatilist teoloogiat ja üldist isagoogiat ning arheoloogiat, hermeneutika ja heuristika. Vasconcelos oli alates 1897. aastast ülikooli arhiivide korraldaja. Ta mängis olulist rolli Coimbra ülikooli kirjandusfakulteedi loomisel ja sai selle esimeseks dekaaniks 1911. aastal, pärast seda, kui teoloogiafakulteet oli üliõpilaste puudumise tõttu suletud. Mitme aasta jooksul oli ta Ülikooli kabeli direktor, kelle kohta ta kirjutas raamatu, kasutades oma positsiooni, et kaitsta palju kabeli religioosseid objekte Portugali rahutuste ajal pärast 5. oktoobri 1910. aasta revolutsiooni.
- Jah. Ta kirjutas erinevatele ajakirjadele ja ajalehtedele, eriti "Correio de Coimbra", piiskopkonna ajalehele, ja "O Instituto", mille toimetajaliikkonna liikmeks ta oli. Uurijana oli ta tuntud oma täpsuse ja detailide kinnisidee poolest, omadused, mida ta edasi andis oma õpilastele. Tema uurimistöö piirdus peamiselt Coimbra ja selle ülikooliga, arendades tõhusalt Portugali kohaliku ajaloo kontseptsiooni, kuid ta kirjutas ka biograafiad, mis on kõige paremini tuntud Portugali sõduri ja luuletaja Brás Garcia de Mascarenhasi ja Hispaania filosoofi Francisco Suárezi kohta. Ta oli tuntud ka oma kahest köidust tööst "Evolutsioon Elizabeth of Aragon'i kuldi kohta".