Kirjuta selle lõigu jätkamine - Leedu kaotas iseseisvuse ja muutus järk-järgult sotsialistlikuks Nõukogude vabariigiks. Samal ajal muutus Leedu armee järk-järgult Punase Armee üksusteks. Sõjaväeakadeemia töö lõpetati, kui mehed kutsuti tagasi oma üksustesse, kuid Raštikisele ei lubatud tagasi astuda. Ta määrati 29. püssikorpusesse ja määrati Leedu sõjaväe likvideerimise eest vastutava komisjoni aseesimehe ametisse. Ta vabastati aktiivsest teenistusest alles 20. detsembril. 13. veebruaril 1941, kartes NKVD poolt arreteerimist kui "rahva vaenlase", jättis Raštikis oma naise ja kolme noore tütre Kaunas ja lahkus Saksamaale. See oli viimane kord, kui ta nägi oma tütreid, kes olid Siberis deporteeritud.
Juunis. Ta ületas piiri 19. märtsi öösel ja sakslased võtsid ta hästi vastu. Mitmete leedulaste abiga asus ta Berliini. Seal ühines ta Kazys Škirpaga Leedu aktivistide frondi (LAF) organiseerimises. Eelkõige redigeeris ta LAFi põhikirja ja töötas välja plaanid Leedu vabastamiseks.