Fletcher jõudis Manusele 9. oktoobril 1944 Humboldti lahest, et valmistada ette Leyte sissetungi, milleks ta 12. oktoobril sõitis läbivaatustranspordi. Ta kattis neid, kui nad saatsid oma paadid kaldale 20. oktoobril ja järgmisel päeval lahkus Uus-Guineasse, puhastades seega Leyte lahe enne suurt lahingut.
selle kontroll purunes. Ta naasis 23. novembril Leyte'i koos transpordiga, mis vedas tugevdusi, ja järgmisel kuul jätkas ta Filipiinide vabastamise esimese etapi toetamist, saates konvoisid, tulistades Ormoci lahe ja Mindoro prelandimiseelseid pommitusi ning tulistades Jaapani lennukeid mitmes rünnakus.