Skorzeny veetis 1945. aasta jaanuari ja veebruari korrapäraste vägede juhtimisel peajuhina, osaledes Saksa Ida-Preisi ja Pommerna provintside kaitses ning Schwedti sillapeade kaitses. 17. märtsil sai ta käsu saboteerida viimast puutumata silda üle Reini Remagenis.
Pärast seda, kui liitlased selle vallutasid, lagunes sild samal päeval, ja mereväe purustamisüksus, kes oli selle asemel valmis, ründas ebaõnnestunult lähedal asuvat liitlaste pontonilist silda Krippi ja Linzi vahel. Hitler andis talle ühe Saksamaa kõrgeima sõjaväe autasuse, härra Rüütli Risti.