Niobiumi sisaldavad ühendid on harva enamikul inimestel, kuid mõned neist on toksilised ja neid tuleb ravida ettevaatlikult. Lühiajaline ja pikaajaline kokkupuude niobiumiga ja niobiumkloriidiga, kahe vees lahustuva kemikaaliga, on katsetatud rottidel. Rottidel, keda ravitakse ühekordse niobiumpentakloriidi või niobiumkloriidi süstimisega, on levinud surmav annus suukaudse manustamise korral (vahemikus 10 mg/kg ja 100 mg/kg).
ei ole teada bioloogilist rolli