Neill tõsteti Béxar'i piiramises osalemise ajal kolonellileitnantiks, ja 10 päeva hiljem andis Houston talle linna Texase garnisoni juhtimise. Jaanuaris olid elanikud hakanud Santa Anna jõudude lähenemise ees evakueeruma. Neill palus Houstonile vägede, varude ja relvade täiendamist. Matamorose ekspeditsiooniga ühinenud teksaslaste lahkumine oli jätnud Neillile vaid umbes 100 meest. Sel hetkel nägi Houston Béxarit sõjaliseks probleemiks ja ei tahtnud, et Santa Anna edenev armee saaks kontrolli ülejäänud sõdurite või suurtükiväe üle. Ta saatis Bowie juhistega, et tüürimees lahkuks, kaitsjad loobuksid Alamo missioonist.
ja hävitada. 19. jaanuaril saabudes ja pärast Neilliga peetud arutelusid otsustas Bowie, et missioon on õige koht, kus peatada Mehhiko armee. Ta jäi ja hakkas aitama Neillil ette valmistada tulevat rünnakut. Kolonelleitnant William B. Travis saabus 3. veebruaril abiväega. Kui Neillile anti 11. veebruaril pereasjadega tegelemiseks puhkus, võttis Travis missiooni üle ja kolm päeva hiljem nõustusid ta ja Bowie ühiseks juhtimiseks. Santa Anna ületas Rio Grande'i 16. veebruaril ja Mehhiko sõjaväe rünnak Alamole algas 23. veebruaril. Kapten Juan Seguín lahkus missioonist 25. veebruaril, kandes kaasa kirja Travisilt Fanninile Goliadis, paludes rohkem abi. Santa Anna tegi amnestia pakkumise Tejanosele kindluse sees; võitlemata ellujäänu Enrique Esparza ütles, et enamik Tejanosest lahkus, kui Bowie soovitas neil pakkumist võtta. Vastuseks Travis'i 24. veebruari kirjale Texase rahvale moodustasid 32 vabatahtlikku miliisi Gonzales Ranging Company of Mounted Volunteers ja saabusid Alamosse 29. veebruaril.