1944. aasta aprillis andis ta 2. soomustatud diviisi juhtimise üle kindralmajor Edward H. Brooks'ile. Ta määrati Kolmanda Armee peasekretäriks, teenides taas kindralleitnant George Pattoni alluvuses. Gaffey teenis selles ametis Lääne-Euroopa kampaanias
, alates ajast, kui kolmas armee maandus Prantsusmaal 1944. aasta juulis ja mängis olulist rolli operatsioonis Cobra ja Falaise lõhe lahingus, millele järgnesid liitlaste edasiminek Pariisist Reini ja Metzi lahingus. 1944. aasta detsembris asendas ta 4. soomustatud diviisi komandörina kindralmajor John Shirley Woodi, kes mängis olulist rolli Bulge'i lahingus, aidates murda Bastogne'i piiramist. Ta jäi diviisi juhiks kuni 1945. aasta märtsini, Euroopa sõja lõpuni, kui ta sai XXIII korpuse komandöriks. Ta loobus XXIII korpuse juhtimisest septembris, kui sõda lõppes Jaapani alistumise tõttu.