CBSA loodi 12. detsembril 2003. aastal nõukogu korraldusega, mis ühendas Kanada tolli (praeguse kadunud Kanada tolli- ja tulumaksuagentuurist) Kanada kodakondsuse ja sisserände osakonna (CIC) ja Kanada toiduainete inspekteerimise agentuuri (CFIA) piiri- ja täitevametnikega.
12. detsember 2003