Kiriku katus sai 1939. aastal Varssavi õhurünnakus tugevalt kahjustatud
Varssavi ülestõusu ajal, kuid varsti parandati. 1949. aastal õõnestati WZ-i raja kaevamisel seina ja seda tuli kiiresti tugevdada. Kõikide elementide restaureerimine viidi läbi 1940.-1970. aastatel arhitektide juhtimisel.