2012/13 Atlético Madridi hooaeg oli klubi ajaloos 82. hooaeg. Atlético võistles La Ligas ja Copa del Rey's.
, ja Euroopa Liigas, kui kaitsvad meistrid. Nad elimineeriti 32. voorus Rubin Kazani poolt. Nad võitsid Copa del Rey pärast võidu Real Madridiga 2-1 pikendusajal.