- Teise maailmasõja ajal oli linn Saksa okupatsioonis
5. septembrist 1939 kuni 22. jaanuarini 1945 kuulus see ala Reichsgau Warthelandi hulka. Poola elanikkonnale tehti mitmesuguseid kuritegusid, sealhulgas mõrvad, deportatsioonid natside koonduslaagritesse ja väljasaatmised. Margonini elanikud olid nende 41 poolalase hulgas, kes tapeti 7. novembril 1939 lähedal asuvas Morzewo külas. 10.-12. detsembril 1939 tõmbasid sakslased paljud Poola elanikud Saksamaa okupeeritud Kesk-Poola Varssavi piirkonda. Sakslased hoidsid linnas natside vanglat ja sunnitöölaagrit juutidele. Poola maa-alune vastupanuliikumine oli Margoninis aktiivne ja paljud selle liikmed surid koonduslaagrites pärast seda, kui sakslased avastasid nende tegevuse. Pärast Teist maailmasõda läks see ala Poolale tagasi.