Bonaparte oli Lucien Bonaparte ja Alexandrine de Bleschampi poeg ja keiser Napoleon I vennapoeg. Ta sündis Pariisis, kasvas üles Itaalias. 29. juunil 1822 abiellus ta oma nõo Zénaïde'iga Brüsselis. Peagi pärast abielu lahkusid paar Filadelfiasse, et elada Zénaïde'i isaga, Joseph Bonaparte'iga. Enne Itaaliast lahkumist oli Carlo juba avastanud uue torm-petrelli proove.
Brüsseli