Jagodnik oli pikaajaline Sloveenia rahvuskoondise liige, kes tegi oma debüüdi EuroBasket 1997. Ta mängis veel viiel Euroopa meistrivõistlusel (1999, 2001, 2007).
, 2009 ja 2011), samuti 2010. aasta FIBA maailmameistrivõistlustel.