"Musashi", mis sai käsu 1942. aasta keskpaigast, muudeti lipplaevadeks ja veetis ülejäänud aasta täiendamisel. Laev viidi 1943. aasta alguses üle Truki ja sõitis sel aastal mitmel korral koos laevastikuga Ameerika vägede edutute otsingutega. 1944. aastal kasutati seda mitmel korral vägede ja varustuse üleviimiseks Jaapani ja erinevate okupeeritud saarte vahel. 1944. aasta alguses torpeeris Ameerika allveelaev "Musashi" ja oli sunnitud naasma Jaapanisse remondiks, mille käigus merevägi suurendas oma õhutõrje relvastust. Ta osales juunis Filipiinide mere lahingus, kuid ei puutunud kokku Ameerika pinnasjõududega. Leyte lahingu ajal
"Musashi" uppus 24. oktoobril 1944. aastal 19 torpeedi ja 17 pommi rünnakuga. Üle poole meeskonnast päästeti. 2015. aasta märtsis leidis ta romu Microsoft'i kaasasutaja Paul Alleni poolt töötanud teadlaste meeskonna poolt.