Kirik suleti koos ülejäänud kalmistuga 1923. aastal ja mõnda aega oli see monumentide ja hauakivide ladustamiseks mõeldud laohoone, mis toodi teistelt kalmistustest, mida lammutati. Pärast nekropooli muuseumi rajamist 1932. aastal remonditi kiriku interjöör tugevalt. Ikonostaas demonteeriti ning seinad ja laed värvitati ümber. Enamik ikooneid eemaldati, kuid paljud ajaloolised mälestusmärgid jäid alles. Lavra Dukhovskaja kiriku lammutamisega aastal 1937 viidi mitmed monumendid üle muuseumi ning järgnevate aastate jooksul viidi üle ja mateti Püha Laatsaruse kirikus mitmete kuulsaid ajalooliste isikute jäänused, sealhulgas Gruusia vürst Ioane, Viktor Kochubey ja Mihail Kutuzovi naine Ekaterina Ilyinichna Kutuzova. Teised mälestusmärgid toodi Feodorovskaia Lavra kirikust, Smolenski Armeenia kirikust ja Tsarskoye Selo katoliku kirikust. Krahvi jäänused, Decembristi äi.
Prints Sergei Petrovich Trubetskoy maeti kirikusse, kuid tema monumendi ei paigaldatud kunagi.