Albayzíni ülestõusu juhid põgenesid Alpujarra mägedesse. Mägede elanikud, kes olid peaaegu täielikult moslemid, olid ainult vastu võtnud kristliku valitsuse kõhklematult. Nad tõusid kiiresti mässu vastu, mida nad pidasid Granada lepingu tingimuste rikkumiseks, ja kuna nad kartsid, et kannatavad samade sunniviisiliste pöördumiste all nagu Albayzíni elanikud. 1500. aasta veebruariks mobiliseeriti mässu allamiseks 80 000 kristlikku sõdurit.
Mässulisi juhiti sageli hästi ja nad kasutasid mägist maastikku gerillasõjas