San Andreas Fault põhjustas maavärinad 1906. ja 1989. aastal. Väikesed maavärinad esinevad regulaarselt. Suurte maavärinate oht mängib linna infrastruktuuri arengus suurt rolli. Linn ehitas abiveevärinase ja on korduvalt uuendanud oma ehituskoodid, mis nõuavad vanemate hoonete ja kõrgemate inseneristandardite uuendamist. Kuid on veel tuhandeid väiksemad hooned, mis jäävad maavärina kahjustuste suhtes haavatavaks. USGS on välja andnud California maavärina prognoosi mudelid, mis ennustavad maavärina tekkimist Californias. San Francisco rannikujoon on kasvanud üle oma looduslike piiride.
Lahest välja praetud materjal ja Yerba Buena tunneli kaevandamisel saadud materjal