Kirjuta selle lõigu jätkamine - Kuid Lima ei olnud ohtudest vaba. 20. oktoobril
ja 2. detsembril 1687, purustasid tugevad maavärinad suurema osa linnast ja selle ümbrusest. Katastroofi järgnenud haiguste puhangute ja toidupuuduse tõttu vähenes elanikkond 1692. aastaks alla 40 000-ni. Teiseks ohuks olid Vaikse ookeani piraadid ja piraadid. Hollandi mereekspeditsioon Jacques l'Hermite'i juhtimisel ründas Callao sadamat 1624. aastal, kuid viisekuningas Diego Fernández de Córdoba tõrjus nad tagasi. 1680. aastatel kasvasid Inglise piraadid Vaikse ookeani vetes, kuni Lima kaupmehed nad 1690. aastal hävitasid. Et ennetusabinõuna ehitas varakuningas Melchor de Navarra y Rocafull 1684 ja 1687 vahel Lima linna müürid.