Kovačić sai 31. jaanuaril 2013. aastal Inter Milani üleandmisega nõusoleku. Tehingu väärtus oli kokku 15 miljonit eurot, kusjuures 11 miljonit maksti kohe ja 4 miljonit eurot, kui Inter kvalifitseerub UEFA Meistrite Liigile.
Inter Milan