Scott abiellus 1938. aastal Katherine Nina Grant Smithiga. Ta teenis Teises maailmasõjas ja sai 1939. aasta septembris Londoni Yeomanry 4. krahvkonna teiseks leitnantiks. Yeomanry saadeti 1941. aasta alguses Lähis-Idasse ja sealt viidi ta üle Lääne-Desertis juunis 1942, kus Scott nägi tegevust Briti kaitselinnas Maabus er Rigel'is ja sai haavata, kui tema tanki tabas vaenlase tuli. 1942. aasta keskpaigaks sai ta leitnandi auastme ja 1942. aasta augustis pälvis ta sõjaväekriisi. Ta mainiti dispetšerides detsembris 1942 ja võttis vastu komandör C Squadron Yeomanry veebruaris 1943, mil ta pidas ajutise auastme kapten. 1943. aasta aprillis osales Scott Wadi Akariti lahingus.
, kus tema teod, mis juhtisid tanke üle miinivälja, nägid teda kaunistamas oma sõjaväekruustiga. Põhja-Aafrika kampaania hilisematel etappidel olid Scotti juhitud väed esimesed, kes Tunisi vallutamise ajal sisenesid.