Esimene ametlik ajalooline mainimine Schliengenist oli aastal 820. Varem kuulus see Basili vürstliku piiskopkonnale. 1796. aastal toimus Schliengenis lahing Jean Victor Marie Moreau juhitud Prantsuse armee ja koalitsiooni vahel.
Armeed, mida juhtis Austria pealihertsog Karl. Pärast sekulariseerimist, mis oli Saksamaa 1803. aasta mediatisatsiooni () tulemus, sai Schliengen Badeni suurhertsogiriigi osaks. Raudtee jõudis Schliengenisse esimest korda 15. juunil 1847, kui Müllheimi raudtee valmis sai. Schliengen oli traditsiooniliselt osa Lörachist, kuid on alates 1973. aastast olnud osa Lörrachist.