Kirjuta selle paragrahvi jätkamine - Infante suri 1468. aasta suvel ja tema asemele astus troonile pretendentina tema õde Isabella. Carrillo oli tema peamine nõunik ja koos Pedro de Peralta (Pedro de Peralta y Ezpeleta) mängis ta suurt rolli tema abielu korraldamisel Ferdinand II Aragoni oktoobris 1469. Ent kui pärast Henry IV surma 1474. aasta detsembris võimule tulid katoliiklikud monarhid, sattusid nad kohe Carrillo vastu. Carrillo ei aktsepteerinud nende autoritaarset kohtlemist tema vastu ega ka tema vaenlase kardinal Pedro González de Mendoza tõusu kuningriigi kantsleriks. See viis ta kokkupõrke Mendoza perekonnaga, lahing, mille ta kaotas Kastiilia pärilussõjas.
mis järgnes (1475<unk>1479). Oma poliitikat täielikult muutes liitus Carrillo Portugali kuninga juhitud laagriga, kes toetas tema vennatütre printsess Joanna la Beltraneja nõudmist Kastiilia troonile Isabella I nõudmise vastu.