Päevad hiljem, vaidlustega ümbritsetud, müüdi Real Madridi idool Fernando Redondo, kes oli avalikult toetanud Pérez'i vastast Lorenzo Sanzit, Itaalia hiiglane Milan'ile. 2000. aasta suvel allkirjastas Real Madrid Claude Makélélé, Albert Celades, Flávio Conceição, César Sánchez, Pedro Munitis ja Santiago Solari, kuigi peale Makélélé ja Conceição olid ülejäänud allkirjastatud enne Pérez'i valimist. Ootused olid kõrged, kuna Los Blancos alustas 2000-01 hooaega võimalusega võita viis trofeed. Klubi kukkus aga esimesel katsel, kaotades 2000. aasta UEFA Superkupi.
1<unk>2 võrra 2000. aasta UEFA karikavõitja Galatasaray vastu. Hiljem jättis Fernando Morientes vigastuse tõttu Real Madridi ilma keskmängija, kuid juht Vicente del Bosque improviseeris, kasutades noorte meeskonna lõpetaja Guti rolli, kus Real Madrid võitis ja tegi hea alguse nii oma kodumaise kui ka Euroopa kampaaniale. Siiski kaotati nad Camp Nou's oma rivaali Barcelona vastu 2:0 ja hiljem elimineeriti nad Copa del Rey'st tagasihoidliku Toledo poolt, samuti kaotasid nad Intercontinental Cup'i finaalis Boca Juniors'i poolt, mida juhtisid Martín Palermo ja Juan Román Riquelme.