Die belangrikste prestasie van Arzú se presidentskap was die ondertekening van 'n vredesooreenkoms met die guerrilla-groep Guatemalan National Revolutionary Unity, wat Guatemala se 36 jaar lange burgeroorlog beëindig het.
Ek weet. Die onderhandelinge het sedert 1990 voortgeduur, en Arzú het hulle 'n noodsaaklike nuwe impuls gegee toe hy op 26 Februarie 1996 die URNG in Mexiko ontmoet het. Op 20 Maart is' n skietstilstand ingestel, en verskeie vredesooreenkomste is gedurende die jaar onderteken. Op 12 Desember is 'n ooreenkoms onderteken wat die URNG wettig gemaak het. Op 18 Desember het die Kongres 'n wet goedgekeur wat 'n gedeeltelike amnestie aan die vegters verleen het, voordat die finale ooreenkoms vir 'n stewige en blywende vrede op 29 Desember onderteken is.