Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - Die historikus Nick Cullather het geskryf dat die CIA, deur Árbenz omver te werp, uiteindelik sy eie aanvanklike doelwit van 'n stabiele Guatemalaanse regering ondermyn het. Die geskiedskrywer Stephen Streeter het gesê dat hoewel die VSA sekere strategiese doelwitte bereik het deur die "buigbare" Castillo Armas as president te installeer, dit ten koste van Guatemala se demokratiese instellings gedoen het. Hy sê verder dat, hoewel Castillo Armas waarskynlik die menseregteskendings wat hy gepleeg het, sou gepleeg het, selfs sonder 'n Amerikaanse teenwoordigheid, die Amerikaanse Departement van Buitelandse Sake beslis die proses gehelp en bevorder het. Die terugslag van die progressiewe beleid van die vorige burgerlike regerings het gelei tot 'n reeks linkse opstande op die platteland wat in 1960 begin het. Dit het die Guatemalaanse burgeroorlog begin
tussen die VSA-gesteunde militêre regering van Guatemala en linkse opstandelinge, wat dikwels 'n aansienlike aanhang onder die burgers gehad het. Die konflik, wat tussen 1960 en 1996 geduur het, het die dood van 200 000 burgerlikes tot gevolg gehad. Hoewel misdade teen burgerlikes deur albei kante gepleeg is, is 93 persent van sulke gruweldade deur die Amerikaanse-gesteunde weermag gepleeg. Hierdie oortredings het 'n volksmoord veldtog teen die inheemse Maya-bevolking gedurende die 1980's ingesluit. Geskiedkundiges het die geweld van die burgeroorlog toegeskryf aan die staatsgreep van 1954, en die "anti-kommunistiese paranoia" wat dit gegenereer het.