Sy vader, Kolonel Zalnur Ali Ahmed, was die eerste inheemse Assamese persoon en die eerste inheemse persoon uit Noord-Oos-Indië wat 'n M.D. (Dokter van Geneeskunde) -graad gehad het. Sy moeder, Sahibzadi Ruqaiyya Sultan, was 'n dogter van die Nawab van Loharu. Ahmed se oupa, Khaliluddin Ali Ahmed, was van Kacharighat naby Golaghat, Assam, en kom uit 'n bekende inheemse Assamese Moslem-familie. Hy is getroud met 'n inheemse Assamese Moslem-meisie met die naam Begamida van Assam.
Fakhruddin Ali Ahmed