Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - 'n Reeks Jakobitiese opstande het ook in Skotland plaasgevind, waar Viscount Dundee Highland-magte opgewek het en op 27 Julie 1689 'n oorwinning behaal het in die Slag van Killiecrankie
, maar hy het in die geveg gesterf en 'n maand later het die Skotse Kameroniese magte die opstand in die Slag van Dunkeld onderdruk. Willem het aan Skotse stamme wat aan die opstand deelgeneem het, 'n pardon aangebied, mits hulle binne 'n bepaalde tyd lojaliteit onderteken het, en sy regering in Skotland het 'n vertraging gestraf met die Slagting van Glencoe van 1692, wat berug geword het in Jakobitiese propaganda, aangesien Willem die bevele onderteken het. Willem het voor die openbare mening buig en diegene wat verantwoordelik was vir die slagting ontslaan, hoewel hulle steeds in sy guns gebly het. Volgens die geskiedskrywer John Dalberg-Acton het "een 'n kolonel geword, 'n ander 'n ridder, 'n derde 'n eweknie en 'n vierde 'n graaf".