Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - In c. In 800 is Abd al-Malik ook as tutor oor Harun se seun al-Qasim geplaas. Sy prominensie en invloed in die leër het daartoe gelei dat Harun hom nie vertrou het nie en in 803 is hy gearresteer en in die tronk gegooi. Die werklike rede bly onduidelik, hoewel die meeste bronne saamstem dat sy eie seun, Abd ar-Rahman, die Kalief in kennis gestel het dat hy na bewering van plan was om hom omver te werp. Abd al-Malik het in die tronk gebly tot Harun se dood ses jaar later, toe die Kalief al-Amin (r. 809<unk>813) hom vrygelaat het. Al-Amin se opvolging is betwis
deur sy ouer halfbroer al-Ma'mun, en daar was onrus in Sirië. Abd al-Malik het steeds aansienlike invloed oor die grens troepe gehad, en daarom is hy as goewerneur van Sirië en Opper Mesopotamië aangestel en is hy die taak gegee om hierdie streke vir al-Amin te beveilig en troepe op te rig om al-Ma'mun te konfronteer. Kort nadat hy sy setel in Raqqa bereik het, het Abd al-Malik egter siek geword en gesterf. Sy graf is 'n paar jaar later deur die oorwinnaar al-Ma'mun gesloop, na bewering omdat Abd al-Malik gesweer het om nooit al-Ma'mun se bewind te aanvaar nie.