Skryf'n voortsetting vir hierdie paragraaf - Op die Wêreld Cross Country Kampioenskappe
Op 20 Maart 2011 het Flanagan haar 12de plek van die jaar voorheen verbeter tot derde plek, met 'n tyd van 25:10. Sy het die Amerikaanse span tot 'n bronsmedalje gelei. Flanagan was die eerste nie-Afrika-gebore medaljewenner in die gebeurtenis sedert 2004. Sy het in Junie 2011 by die VSA-kampioenskappe in die 10.000 m deelgeneem en met 'n tyd van 30:59.57 gewen, wat haar gekwalifiseer het vir die 10.000 m by die Wêreldkampioenskappe.