Laveran het die Bréant-prys (Prix Bréant) van die Franse Akademie van Wetenskappe in 1889 ontvang en die Edward Jenner-medalje van die Royal Society of Medicine in 1902 vir sy ontdekking van die malariaparasiet. Hy het die Nobelprys vir Fisiologie of Geneeskunde in 1907 ontvang. Hy het die helfte van die prys gegee vir die stigting van die Laboratorium vir Tropiese Geneeskunde by die Pasteur Instituut. In 1908 het hy die Société de pathologie exotique gestig, waaroor hy 12 jaar lank voorsitter was. Hy is in 1893 tot lid van die Franse Akademie van Wetenskappe verkies, en is in 1912 bevelvoerder van die Nasionale Orde van die Legion of Honour toegeken. Hy was in 1915 op sy 70ste verjaardag ere-direkteur van die Pasteur Instituut. Hy is in 1920 tot president van die Franse Akademie van Geneeskunde verkies.
Nobelprys vir Fisiologie of Geneeskunde