Voltooi die volgende sin: Gedurende die Tweede Wêreldoorlog was die dorp onder
Duitse besetting van 5 September 1939 tot 22 Januarie 1945, die gebied is deel van die Reichsgau Wartheland gemaak. Die Poolse bevolking is onderworpe aan verskeie misdade, insluitend moorde, deportasies na Nazi-konsentrasiekampe en uitwerping. Inwoners van Margonin was onder 41 Pole wat op 7 November 1939 in die nabygeleë dorpie Morzewo vermoor is. Op 10-12 Desember 1939 het die Duitsers baie Poolse inwoners na die Warskou-distrik van die Algemene Regering in die Duitse besette sentrale Pole verban. Die Duitsers het 'n Nazi-gevangenis en 'n dwangarbeidskamp vir Jode in die dorp bedryf. Die Poolse ondergrondse weerstandsbeweging was aktief in Margonin, en baie van sy lede het in konsentrasiekampe gesterf nadat die Duitsers hul bedrywighede ontdek het. Ná die Tweede Wêreldoorlog het die gebied weer aan Pole behoort.