Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - Rebane het as 'n offisier in die Estse leër gedien totdat Sowjet-troepe die land in 1940 beset het. Die Sowjets het die meeste van die Estse weermag ontbind en geabsorbeer en die hele Estse opperbevel gearresteer en tereggestel. Baie junior beamptes, soos Rebane, is ontslaan weens hul gebrek aan "politieke betroubaarheid" en was onderhewig aan deportasie. Rebane het 'n rukkie in die konstruksie gewerk, toe het hy in die woude gevlug toe die Sowjets massa-deportasies begin het
in 1941 gebore is. Hy het in Mei 1941 'n anti-Sowjet Bosbroeders-eenheid in Virumaa (Noord-Estland) gestig en gelei.