Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - In die nasleep van die Nigeriese staatsgreep van 1966
Aghanya is op 18 Januarie 1966 in hegtenis geneem en saam met luitenant-kolonel Victor Banjo daarvan beskuldig dat hy beplan het om die militêre staatshoof, generaal-majoor Johnson Aguiyi-Ironsi, dood te maak. Aghanya is sonder verhoor in Kirikiri se maksimum sekuriteitsgevangenis aangehou saam met ander wat na bewering by die staatsgreep betrokke was. Hy is later na Enugu en daarna na Abakaliki-gevangenisse oorgeplaas. Agterna gesien, het diegene wat aktief betrokke was by die beplanning en uitvoering van die staatsgreep, soos majoor Adewale Ademoyega, in hul memoires getuig van die onskuld van beide Aghanya en Banjo. Na die Nigeriese teen-staatsgreep van 1966 waarin Aguyi Ironsi vermoor is, is Aghanya in Maart 1967 op bevel van die destydse goewerneur van die Oostelike Streek, Kolonel (later Generaal) Odumegwu Ojukwu, uit die tronk vrygelaat, in stryd met die bevele van die nuwe staatshoof Kolonel (later Generaal) Yakubu Gowon. In reaksie hierop het Gowon aangekondig dat Aghanya en ander vrygelaat sal word.