Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - Tauxe se navorsingsbelange sluit in bakteriële enteriese siektes, epidemiologie en patogenese van aansteeklike siektes, epidemiologiese en kliniese gevolge van bakteriële genetiese uitruil, antimikrobiese gebruik en weerstand teen antimikrobiese middels, en die onderrig van epidemiologiese metodes. Hy het deelgeneem aan of toesig gehou oor talle binnelandse en oorsese epidemiologiese ondersoeke oor die hele wêreld, veral die 1984 Rajneeshee bioterroriste aanval
, die Salmonellose-uitbraak in die Verenigde State in 2008, die cholera-uitbraak in Haïti in 2010-2013, die vestiging van Pulsenet en die Ebola-virus-epidemie in Wes-Afrika.