Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - Die opvolgingskrisis van 1580 het 'n periode van sestig jaar van dubbele monargie in Portugal en Spanje onder die Spaanse Habsburgers begin. Dit word die "Filippynse Dominion" ("Domínio Filipino") genoem, aangesien al drie Spaanse konings gedurende daardie tydperk Philip ("Filipe") genoem is. In 1589 was Lissabon die teiken van 'n inval deur die Engelse vloot
gelei deur Francis Drake, terwyl koningin Elizabeth 'n Portugese aanspraakmaker in Antonio, Prior van Crato, ondersteun het, maar ondersteuning vir Crato ontbreek en die ekspedisie was 'n mislukking. Die Portugese Restorasieroorlog, wat begin het met 'n staatsgreep wat deur die adel en bourgeoisie in Lissabon georganiseer is en op 1 Desember 1640 uitgevoer is, het die Portugese onafhanklikheid herstel. Die tydperk van 1640 tot 1668 is gekenmerk deur periodieke skermutselinge tussen Portugal en Spanje, asook kort episodes van ernstiger oorlogvoering totdat die Verdrag van Lissabon in 1668 onderteken is.