Soebekhotep was die seun van die 'god se vader' Haankhef en van die 'koning se moeder' Kemi. Sy oupa was die soldaat van die stad se regiment Nehy. Sy ouma was Senebtysy genoem. Soebekhotep het moontlik verskeie vrouens gehad, waarvan slegs een met sekerheid bekend is, die "koning se vrou" Tjan. Verskeie kinders is bekend. Dit is Amenhotep en Nebetiunet, albei met Tjan as moeder. Daar is nog drie koningsseuns: Sobekhotep Miu, Sobekhotep Djadja en Haankhef Iykhernofret. Hul moeder word nie in bestaande bronne aangeteken nie. Vraag: Hoeveel ander koningsseuns is daar?
drie