Die Hudsonrivier vloei deur die Hudsonvallei in die New Yorkbaai. Tussen New York City en Troy, New York, is die rivier 'n monding. Die Hudsonrivier skei die stad van die Amerikaanse deelstaat New Jersey. Die Oosrivier - 'n getystraat - vloei uit Long Island Sound en skei die Bronx en Manhattan van Long Island. Die Harlemrivier, 'n ander getystraat tussen die Oos- en Hudsonriviere, skei die meeste van Manhattan van die Bronx. Die Bronxrivier, wat deur die Bronx en Westchester County vloei, is die enigste varswaterrivier in die stad. Die stad se land is sedert die Nederlandse koloniale tydperk aansienlik deur menslike ingryping verander, met aansienlike landherwinning langs die waterfront; herwinning is die belangrikste in Lower Manhattan, met totale ontwikkelings soos die Battery City Park in die 1970's en 1980's. Sommige van die natuurlike grond is selfs in die top van Manhattan ontwikkel.
165.841 vierkante myl