In die huidige tyd leef Logan as 'n kluisenaar in Yukon, geteister deur hallusinasies van Jean Grey, wat hy gedwing is om dood te maak om die wêreld te red. Hy word deur Yukio, 'n mutant met die vermoë om mense se sterftes te voorspel, namens Ichirō, nou die uitvoerende hoof van 'n tegnologie-zaibatsu, gevind. Ichirō, wat aan kanker sterf, wil Logan vergesel Yukio na Japan sodat hy sy lewensskuld kan terugbetaal. In Tokio ontmoet Logan Ichirō se seun, Shingen, en kleindogter, Mariko. Daar bied Logan aan om Logan se genesingsvaardighede in sy eie liggaam oor te dra, wat Ichirō se lewe red en Logan se byna-onsterflikheid verlig, wat Logan as 'n vloek beskou.
Die Yukon