Voltooi die volgende sin: Op 23 Augustus 2015 het Bonaventura sy seisoen debuut gemaak toe Milaan 2-0 teen Fiorentina verloor het. In die volgende wedstryd teen Empoli het Bonaventura in die 55ste minuut as plaasvervanger vir Suso op die veld gekom en 15 minute later daarin geslaag om Luiz Adriano se wendoelwit te help met 'n hoekskop. Op 19 September het Bonaventura die eerste doel van Carlos Bacca gehelp en direk van 'n vryskop aangeteken in 'n oorwinning van 3<unk>2 oor Palermo. Hy het ook nog 'n assist en 'n doel in Milaan se volgende wedstryd, die 2<unk>3 oorwinning oor Udinese, gekry. Hy het weer eens gehelp met die doelwitte van Carlos Bacca en Philippe Mexès teen Lazio in die 3-1 buitelandse oorwinning op 1 November. Hy het voortgegaan om goed te presteer onder die span se afrigter Siniša Mihajlović en het gedurende die seisoen 'n fundamentele speler vir sy span geword. Nadat hy 'n 0-0-trekking teen sy voormalige span Atalanta gemis het deur middel van skorsing, het hy die openingsdoel aangeteken in 'n 4-1 nederlaag van Sampdoria op 28 November. Hy het weer in sy volgende wedstryd op 1 Desember, 'n 3-1 Coppa Italia-nederlaag van Crotone, deur middel van 'n briljante 20-yard vryskop, aangeteken. Op 20 Desember het hy Carlos Bacca se doel gehelp en 'n laat doel aangeteken toe Milaan Frosinone 4-2 verslaan het. Op 17 Januarie 2016 het hy nog 'n assist vir Carlos Bacca gelewer toe die Rossoneri Fiorentina 2-0 verslaan het. Hy het die seisoen afgesluit met 7 doele en 8 assists in alle kompetisies, terwyl Milaan 7de geëindig het in
Serie A, en verloor in die Coppa Italia-eindstryd teen Juventus, na 'n 1<unk>0 nederlaag in die ekstra tyd.