Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - Op 20 Januarie 2007, na die afdwinging van president Maaouya Ould Sid'Ahmed Taya in die militêre "staatsgreep" van Augustus 2005
Boulkheir het sy kandidatuur in die presidensiële verkiesing van Maart 2007 aangekondig. In die verkiesing, wat op 11 Maart gehou is, het hy die vierde plek behaal met 9,79% van die stemme. Op 19 Maart het hy Sidi Ould Cheikh Abdallahi vir die tweede ronde gesteun, ondanks die feit dat hy deel was van die Koalisie van die Magte vir Demokratiese Verandering saam met die ander tweede ronde kandidaat, Ahmed Ould Daddah. Abdallahi het die verkiesing gewen, en op 26 April 2007 is Boulkheir as president van die Nasionale Vergadering verkies, met 91 stemme van die 93 afgevaardigdes wat teenwoordig was.