Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - Na die moord op die derde kalief Uthman in 656 deur provinsiale rebelle het die kalifaat in burgeroorlog verval
soos Mu'awiya ibn Abi Sufyan, 'n familielid van Uthman en die goewerneur van Sirië, die legitimiteit van die nuwe kalief Ali betwis het. Die besluitlose stryd tussen die twee by Siffin het in Julie 657 tot 'n arbitrasiekonsensus gelei. Sommige van Ali se soldate het die leër verlaat omdat hulle beweer het dat menslike arbitrasie ongeldig is, aangesien God se bevel duidelik was dat die rebelle (in hierdie geval Mu'awiya) geveg en oorwin moes word. Hulle is Kharijites genoem ná hierdie afsondering. Hulle het later teen Ali geveg in die Slag van Nahrawan in Julie 658 en is deur die Kalief verslaan. Na Ali se moord in 661 deur 'n Kharijite, het Mu'awiya die enigste heerser geword en die Umayyad Kalifaat gevestig. Tydens sy bewind het die Kharijiete in die suidelike Irakese stad Basra floreer. Hulle is erg onderdruk deur die Irakse goewerneur Ziyad ibn Abih en later Ubayd Allah ibn Ziyad, en het omstreeks 680 na Arabië gevlug.