Cruise is getroud met die aktrise Mimi Rogers op 9 Mei 1987. Hulle het op 4 Februarie 1990 geskei. Rogers het Cruise aan die Kerk van Scientology voorgestel. Hy het sy tweede vrou, die aktrise Nicole Kidman, op die stel van hul film Days of Thunder (1990). Die egpaar is op 24 Desember 1990 getroud. Cruise en Kidman het twee kinders aangeneem, Isabella Jane (gebore 1992) en Connor Antony (gebore 1995). In Februarie 2001 het Cruise aansoek gedoen om egskeiding van Kidman terwyl sy onbewustelik swanger was. Die swangerskap het in 'n miskraam geëindig.
Februarie 2001