Die San Andreas-fout het die aardbewings in 1906 en 1989 veroorsaak. Klein aardbewings kom gereeld voor. Die bedreiging van groot aardbewings speel 'n groot rol in die stad se infrastruktuurontwikkeling. Die stad het 'n hulpwatervoorsieningstelsel gebou en het herhaaldelik sy boukodes opgegradeer, wat retrofits vir ouer geboue en hoër ingenieursstandaarde vir nuwe konstruksie vereis. Daar is egter nog duisende kleiner geboue wat kwesbaar is vir aardbewingsskade.
materiaal wat uit die baai gedraag is, asook materiaal wat voortspruit uit die uitgrawing van die Yerba Buena-tonnel