Voltooi die volgende sin: Jefferson was huiwerig om by enige soort internasionale konflik betrokke te raak, maar hy het geglo dat geweld die Barbary-state die beste sou afskrik om verdere huldeblyk te eis. Hy het die Amerikaanse vloot in die Middellandse See beveel om teen die Barbary Pirates te verdedig, wat die
Eerste Barbary Oorlog. Die aanvanklike pogings van die administrasie was grotendeels ondoeltreffend, en in 1803 is die fregat deur Tripoli gevang. In Februarie 1804 het luitenant Stephen Decatur 'n suksesvolle aanval op die hawe van Tripoli gelei wat die "Philadelphia" verbrand het, wat van Decatur 'n nasionale held gemaak het. Jefferson en die jong Amerikaanse vloot het Tunis en Algiers gedwing om hul alliansie met Tripoli te verbreek wat hulle uiteindelik uit die oorlog geskuif het. Jefferson het ook vyf afsonderlike vlootbombardemente van Tripoli bestel, wat die vrede in die Middellandse See vir 'n rukkie herstel het, hoewel Jefferson voortgegaan het om die oorblywende Barbary-state tot aan die einde van sy presidentskap te betaal.