Fischer is gebore in Höchst op Main, nou 'n stadsdeel van Frankfurt. Sy ouers was Dr. Eugen Fischer, direkteur van die firma Kalle & Co, Wiesbaden, en Privatdozent aan die Tegniese Hoërskool, Stuttgart, en Anna Herdegen. Hy het 'n primêre skool in Stuttgart bygewoon, en later na die "Humanistisches Gymnasium" in Wiesbaden, matrikulering in 1899. Hy het chemie en medisyne, eers aan die Universiteit van Lausanne en dan by Marburg, gestudeer. Hy het in 1904 gegradueer, en in 1908 het hy vir sy M.D. gekwalifiseer. Vraag: Eugene fischers se seun het watter twee universiteite bygewoon?
Universiteit van Lausanne en dan by Marburg