Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - In 1985 het swak gesondheid (veral ernstige artritis in sy rug) veroorsaak dat Kubelík van voltydse direksie afgetree het, maar die val van Kommunisme
in sy geboorteland het daartoe gelei dat hy in 1990 'n uitnodiging aanvaar het om terug te keer om die Tsjeggiese Filharmoniese Orkes te dirigeer by die fees wat hy gestig het, die Praagse Lentefees. Hy het Smetana se "Má Vlast" live saam met die Tsjeggiese Filharmoniese Orkes vir Supraphon opgeneem, sy vyfde opname van die stuk. Hy het ook die Mozart "Praag" Simfonie en Dvořák se "Nuwe Wêreld" Simfonie by die fees opgeneem. Tydens die repetisie van die "Nuwe Wêreld", het hy vir die Tsjeggiese Filharmoniese Orkes gesê: "Dit is vir my 'n vreugde om dit te hoor. Ek wou nog altyd hê dit moet so klink, maar ek het dit nooit by enige ander orkes in die wêreld gevind nie. Daardie agtste [noot] is wonderlik!"