Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - Toe Umar in 644 deur die Perse vermoor is, het die verkiesing van Uthman as opvolger toenemende teenstand ondervind. In 656 is Uthman ook doodgemaak, en Ali het die posisie van kalief aanvaar. Dit het gelei tot die eerste burgeroorlog
(die "Eerste Fitna") oor wie die kalief moet wees. Die Kharijites was een van die belangrikste aanspraakmakers in die oorlog. Hulle meen dat die sondes van die kaliefs hulle buite die Islam geplaas het en hulle gevra het om hulle as afvalliges dood te maak. In teenstelling met die latere Soenniete en Sjiïete vereis 'n kalief slegs vroomheid en hoef nie 'n afstammeling van Mohammed, sy familie of sy stam te wees nie. Die Kharijiete het Ali in 661 vermoor. Om verdere gevegte te vermy, het die nuwe kalief, Hasan ibn Ali, 'n vredesverdrag onderteken, wat sy troon aan Mu'awiyah oorgegee het, wat die Umayyad-dinastie begin het, in ruil daarvoor dat hy nie sy eie opvolger noem nie. Hierdie geskille oor godsdienstige en politieke leierskap sou tot 'n skeuring in die Moslemgemeenskap lei. Die meerderheid het die legitimiteit van die eerste vier leiers aanvaar en het as Sunnis bekend geword. 'n Minderheid het nie saamgestem nie en het geglo dat slegs Ali en sommige van sy afstammelinge moet regeer; hulle het bekend geword as die Sji'ite. Die Kharijiete het nie hulle kalief benoem nie, aangesien aspirante maklik van sonde beskuldig en as afvalliges beskou is. Mu'awiyah het sy seun, Yazid I, as opvolger aangestel en na Mu'awiyah se dood in 680 het die "tweede burgeroorlog" uitgebreek, waar Husayn ibn Ali in die Slag van Karbala dood is, 'n belangrike gebeurtenis in Sjiïtiese Islam. Soennitiese Islam en Sjiïtiese Islam verskil in sommige opsigte.