Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - In laat 1587 in Parys, is hy in 'n bordeel in hegtenis geneem, nadat hy in die bed gevind is met 'n vrou en 'n manlike bediende van die graaf van Essex. Hy is aanvanklik in die Biskop se gevangenis geplaas, maar sy ontvoerders het dit oorweeg om hom terug te stuur na Walsingham. Uiteindelik is hy na die Bastille oorgeplaas om op die verhoor te wag. 'n Rekord van sy ondervraging toon dat hy probeer het om Morgan en Paget in 'n dubbele handel te betrek. In Augustus 1589 is hy voor die hof gebring en tot twintig jaar gevangenisstraf gevonnis omdat hy teen die belange van die Katolieke Kerk opgetree het. Op daardie stadium was Parys onder die beheer van die Katolieke Liga, wat teen die Franse koning in opstand gekom het. Terwyl hy in die tronk was, het sy gesondheid agteruitgegaan. By die Slag van Ivry
in Maart 1590 is die leër van die Bond vernietig, en die Koning het na Parys opgeruk, vasbeslote om die hoofstad tot onderwerping te verhonger. Die beleg het tot Augustus geduur en het 'n hongersnood veroorsaak. Gifford het 'n paar maande later, in November 1590, gesterf.