Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - Hy het sy eerste antivirusprogram in 1988 geskryf, twee jaar nadat die eerste rekenaarvirus verskyn het. Hy het sake begin met sy vriend Eduard Kučera aan die einde van die kommunistiese regime in 1989
, toe hy Alwil gestig het. In die vroeë 1990's is die maatskappy herdoop na Avast Software, gebaseer op sy bekendste produk, Avast Antivirus. Dit het spoedig intense mededinging ondervind, veral van Symantec, wat 'n aggressiewe prysbeleid gebruik het in 'n poging om die mark te lei. In reaksie hierop het Baudiš en Kucera 'n radikale verdedigingstrategie gevolg deur hul produk gratis aan te bied. As gevolg hiervan het Avast uiteindelik die grootste antivirusfirma ter wêreld geword.