Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - Gedurende die 2019-20 seisoen het Flick Bayern suksesvol gelei om die Bundesliga, DFB-Pokal en UEFA Champions League te wen, en sodoende die kontinentale driekoppie vir die tweede keer in die klub se geskiedenis voltooi. Hy is daarna deur die sporttydskrif "kicker" as Duitse sokkerbestuurder van die jaar aangewys, en het ook die UEFA-menslike afrigter van die jaar-toekenning gewen. Die volgende seisoen het hy Bayern gelei om die 2020 UEFA Superbeker te wen.
teen Sevilla. Hy het Bayern ook gelei om sy eerste sesvoudige trofee te wen nadat hulle die Wêreldbeker vir klubs in Februarie 2021 gewen het deur die Mexikaanse span Tigres te verslaan.