Die 2013-14 FC Bayern München seisoen was die 115ste seisoen in die klub se geskiedenis en die 49ste agtereenvolgende seisoen in die topvlug van die Duitse sokker, die Bundesliga, sedert hul bevordering van die Regionalliga Süd in 1965. Bayern het deelgeneem aan hierdie seisoen se uitgawes van die DFB-Pokal, DFL-Supercup, UEFA Champions League, UEFA Super Cup
, en die FIFA-wêreldkampioenskap.