Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - Onmiddellik na die besetting het die Sowjet-owerhede die Sowjetisering van Litaue begin. Alle grond is genasionaliseer. Om steun vir die nuwe regime onder die armer boere te kry, is groot plase aan klein grondeienaars uitgedeel. Maar ter voorbereiding van die uiteindelike kollektivisering is landboubelasting dramaties verhoog in 'n poging om alle boere bankrot te maak. Die nasionalisering van banke, groter ondernemings en vaste eiendom het ontwrigtings in die produksie tot gevolg gehad wat groot tekorte aan goedere veroorsaak het. Die Litause litas is kunsmatig onderwaardeer en teen die lente van 1941 onttrek. Die lewenstandaard het skerp gedaal. Alle godsdiens-, kulturele en politieke organisasies is verban, en net die Kommunistiese Party van Litaue en sy jeugtak het oorgebly. Na raming is 12 000 "vyande van die volk" in hegtenis geneem. Tydens die Junie-deportasie
veldtog van 1941 is ongeveer 12,600 mense (meestal voormalige militêre offisiere, polisiebeamptes, politieke figure, intelligentsia en hul gesinne) na Gulags in Siberië gedeporteer onder die beleid van die uitskakeling van nasionale elites. Baie gedeporteerdes het weens die onmenslike toestande omgekom; 3 600 is gevange geneem en meer as 1 000 is doodgemaak.