Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - In 1580, gedurende die dinastiese krisis van 1580, het die biskop van Guarda, D. João, vir die onafhanklikheid van Portugal gestaan en teen Filippynse heerskappy gekant. Die biskop het toe die uitslag van die Slag van Alcântara weerstaan
en het voortgegaan om aan die kant van António, prior van Crato, te staan, in teenstelling met al die ander Portugese biskoppe. Op 18 Maart 1582 het die Pous die "oortredings" van D. João, biskop van Guarda, veroordeel, en hy het in 1592 onder die heerskappy van Filippus II van Spanje (Filippus I van Portugal) gesterf.