In 1687 het die Engelse Oos-Indiese Kompanjie sy hoofkwartier van Surat na Bombay oorgeplaas. Die stad het uiteindelik die hoofkwartier van die Bombay-presidentskap geword. Na die oordrag is Bombay weer aan die hoof van al die maatskappy se instellings in Indië geplaas. Teen die einde van die 17de eeu het die eilande weer onder Portugees Yakut Khan in 1689 gely. Die aanval op die eilande is in Oktober 1672 deur Rickloffe van Goen, die Moslem Koli-admiraal van die Mughal-ryk, die goewerneur-generaal van Nederlandse Indië op 20 Februarie 1673 en Siddi Admiraal Sambal op 10 Oktober 1673 aangeval.
die hoofkwartier van die Bombay Presidensie