Voltooi die volgende sin: Diokno is in Manila gebore, die eerste van ses kinders van Jose Manuel "Chel" Diokno, 'n prokureur en die stigting dekan van die De La Salle Universiteit (DLSU) Kollege van die Reg, en Divina Aromin, 'n skrywer. Hy is vernoem na sy oupa, die oorlede Filippynse senator en vryheidsvegter, Jose W. Diokno, die vader van menseregte en stigter van die Free Legal Assistance Group (FLAG), wat ses maande voor sy geboorte oorlede is. Pepe se oupagrootjie is generaal Ananías Diokno, leier van die Visaya-magte tydens die 1896 Revolusie en
oorlog teen die Verenigde State.