Khan het in die openbaar 'n Pakistanse verskoning aan die Bangladesj-volk geëis vir die gruweldade wat in 1971 gepleeg is.
, het hy die 1971 operasie 'n "fout" genoem en dit vergelyk met vandag se behandeling van Pashtuns in die oorlog teen terreur. Hy het egter herhaaldelik die oorlogsmisdaadproewe in Bangladesj ten gunste van die veroordeeldes gekritiseer. Khan word dikwels as "Taliban Khan" bespot as gevolg van sy pasifistiese houding ten opsigte van die oorlog in Noordwes-Pakistan. Hy glo in onderhandelinge met die Taliban en die onttrekking van die Pakistanse weermag uit die Federally Administered Tribal Areas (FATA). Hy is teen Amerikaanse drone-aanvalle en beplan om Pakistan te onttrek van die Amerikaanse-geleide oorlog teen terreur. Khan is ook gekant teen byna alle militêre operasies, insluitend die beleg van Lal Masjid.