Fassbender is 'n vervalde Katoliek, maar hy gaan nog steeds kerk toe om kerse aan te steek. Hy is 'n ondersteuner van die Liverpool-sokkerklub. In 2010 het Fassbender se destydse eks-vriendin, Sunawin Andrews, 'n afskeidingsbevel teen hom ingedien in die Los Angeles County Superior Court, met die bewering dat hy "my oor 'n stoel gegooi het wat my neus gebreek het" in 2009, en dat hy haar ook langs sy motor gesleep het, haar enkel en knie beseer het, asook veroorsaak het dat sy 'n ovariale ontploffing gehad het.
Die lig tussen oseane