Skryf 'n voortsetting vir hierdie paragraaf - Potheinos, het geoordeel dat hierdie ooreenkoms Cleopatra in werklikheid bevoordeel het bo Ptolemeus XIII en dat laasgenoemde se leër van 20.000, insluitende die Gabiniani, heel waarskynlik Caesar se leër van 4.000 troepe wat nie ondersteun is nie, kon verslaan. Hy het besluit om Achillas hulle troepe na Aleksandrië te laat lei om beide Caesar en Cleopatra aan te val. Die gevolglike beleg van die paleis
met Caesar en Cleopatra vasgevang binne duur in die volgende jaar van 47 vC. Dit het Caesar se verbranding van skepe in die hawe ingesluit wat brande versprei het en moontlik 'n deel van die Biblioteek van Aleksandrië afgebrand het. Caesar het dit reggekry om Potheinos tereg te stel nadat hy 'n sluipmoordpoging teen hom beplan het. Arsinoe IV het met Achillas saamgespan en koningin verklaar is. Kort daarna het sy haar tutor Ganymedes Achillas laat doodmaak en sy posisie as bevelvoerder van haar leër oorgeneem. Ganymedes het toe Caesar mislei om sy voormalige gevangene Ptolemeus XIII as onderhandelaar aan te vra, net om hom by die leër van Arsinoe IV te laat aansluit. Met sy gedetailleerde kennis van die paleis het Ganimedes seewater deur waterpype in die reservoirs gepomp, maar Kleopatra en Caesar het dit teëgestaan deur putte met vars water te laat bou.