کتاب سیری در سیره ائمه اطهار علیهم السلام یکی از موضوعاتی که در این کتاب استاد مطهری به آن پرداخته شده است مقایسه روش سیدالشهداء با سایر ائمه اطهار می باشد در نظر بسیاری از مردم این طور است که روش امام حسین ع با سایر ائمه اطهار مثل روش امام حسن ع و امام سجاد ع و امام باقر ع و امام صادق ع و سایر ائمه و حتی روش امیرالمومنین ع متفاوت و مختلف است و مثل این است که مکتب امام حسین ع مخصوص به خود اوست و هیچ یک از ائمه دیگر تابع این مکتب و این روش نبوده اند و از روش و مکتب دیگری پیروی می نموده اند و این خود به خود عقده کور و اشکالی در دل ها تولید می کند به علاوه ما باید بدانیم که در عمل چه نوع رفتار کنیم باید تابع آن مکتب باشیم یا تابع این مکتبکتاب حاضر مشتمل بر یک مقدمه و هشت فصل است و موضوع همه ی آن ها در اطراف سیره ی ائمه اطهار علیهم السلام خصوصاً از نظر چگونگی برخورد با مسئله خلافت و حکومت می باشدمقدمه کتاب مطلبی است به قلم متفکر شهید استاد مرتضی مطهری که از میان دست نویس های ایشان انتخاب شده و فصول کتاب سخنرانی ها و بحث های ارزشمند ایشان است که در زمان ها و مکان های مختلف ایراد شده است1مقایسه روش امام حسین با سایر ائمه2مشکلات علی علیه السلام3صلح امام حسن علیه السلام 14صلح امام حسن علیه السلام 25سخنی پیرامون امام زین العابدین علیه السلام6امام صادق علیه السلام و مسئله خلافت17 امام صادق علیه السلام و مسئله خلافت28موجبات شهادت امام موسی کاظم علیه السلام9مسئله ولایتعهد امام رضا علیه السلام110مسئله ولایتعهد امام رضا علیه السلام211سخنی درباره امام حسن عسکری علیه السلام12مهدی موعود