Assassin creed Brotherhood این عنوان در یک داستان خیالی از وقایع دنیای واقعی تنظیم شده است و پیروی از جنگ چند صد ساله میان Assassins  که با اراده آزاد برای صلح می جنگند  و Templars  که همان را می خواهند اما از طریق کنترل می خواهند  داستان کادربندی در قرن بیست و یکم اتفاق می افتد و شخصیت اصلی سریال دزموند مایلز در آن حضور دارد که با کمک دستگاهی معروف به Animus خاطرات جد آدمکش خود  Ezio Auditore da Firenze را زنده می کند تا راهی برای جلوگیری از آخرالزمان ۲۰۱۲ پیدا کند   داستان اصلی بلافاصله پس از Assassins Creed II اتفاق می افتد  و Ezio را در قرن ۱۶th رم دنبال می کند که او سعی دارد دستور Assassin را بازگرداند  و دشمنان خود را از بین ببر