کتاب شب های طاعون سال 1901 در بیست و نهمین ولایت امپراتوری رو به زوال عثمانی جزیره مینگر طاعون شایع میشود پادشاه عبدالحمید برای جلوگیری از شیوع طاعون از مینگر به اروپا سربازرس بهداشت و سلامت بونکوفسکی پاشا و پس از او دکتر نوری جوان ولی با تجربه را که به تازگی با برادرزاده پادشاه پاکیزه سلطان ازدواج کرده به جزیره می فرستد پاکیزه سلطان دختر پادشاه قبلی مراد پنجم است و کل زندگی اش را در کاخ زندانی بوده؛ به همراه پدر و خواهران و برادر و زنان حرمسرا و حالا برای اولین بار از کاخ بیرون می آید و به همراه همسرش به مینگر می رود در جزیره سرگرد جوان و میهن پرستی به نام کامیل که عاشق دختری به نام زینب می شود با والی جزیره سامی پاشا و دکتر نوری هم پیمان می شود برای مبارزه با طاعون سنت های غلط خانقاههای عصیانگر تندروهای مذهبی و آنانی که قدرت علم و ضرورت قرنطینه را باور ندارند شبهای طاعون حکایت عشق و دلدادگی کوشش و مبارزه امیدواری و ناامیدی میهن پرستی و تلاش برای زنده ماندن در تاریک ترین روزهای مینگر است