Nil Üniversitesi’nin, Türkiye’de Fethullahçı yapılanmayla ilişkili olduğu gerekçesiyle kapatılan Melikşah ve Turgut Özal Üniversiteleriyle geçmiş yıllarda ikili anlaşmalar yaptığına dair haberler mevcut. Polis Akademisi tarafından 2018 yayımlanan “Uluslararası Bir Tehdit Olarak FETÖ” isimli bir raporda da Nil Üniversitesinden FETÖ’nün Nijerya’daki eğitim kurumlarından biri olarak söz edilmiş. Dönemin Başbakan Yardımcısı Bülent Arınç ise 2011 yılında Nil Üniversitesi’ne bir ziyaretdüzenlemiş.
Ni   l Ün iversitesi’nin, Türkiy e  ’de Fe t hullahçı yapılanm ayla ilişk ili o ld uğ u ge rekçesiy  le kapatıl an Melikşa  h v   e T  ur gut Ö  zal Üniversiteleriyl e ge  çmiş yıllar  da ik i  li an l aşma lar yapt ı ğ ına dai r habe rler m  e vcut. Po li  s A kademisi tara fından 20 18 yayım lana n “Uluslarar as ı B  i r Tehd  i t O larA k F   ETÖ” isi mli bi   r r aporda d a Ni   l Ün  iversites inden FETÖ’n   ün Ni je rya’daki eğit im kurumla rınd an bi ri ola rak sö z edilmiş . D önem in Baş b ak an Ya  rdıMcıs ı Bül   ent Ar ı nç i s  e 20 1 1 y ılınd a N  iL Üniv ersites i’ne b  ir ziy aret düzenl emiş.