Bağırsaklarımızdaki kişisel mikropların yediklerimizden çıkardığımız enerji miktarını etkilediğini de biliyoruz (ör. belli sebzelerin içindeki hücre duvarlarını yıkarak). Atwater sisteminde yiyecekleri pişirme şekliniz bir kenara; ne yiyecek pişirmek hesaba katılıyor, ne de farklı besin tipleri arasındaki biyoyararlanım farklılıkları… Yalnızca, bir besinde ne kadar yağ, protein veya karbonhidrat olduğuna bakılıyor.
Baırsaklarım 
ı zd aki k işi sel mik  ro pların yed iklerimizden çıkar dığı  mız e n e rji mi ktar ın ı etkiledi  ği ni d e bili y oruz ( ör. be ll i seb z e lerin i ç ind eki h ü  cre duv arl arını yıka rak). Atwa t er siste mind e yiyecekler i pişir me şekl iiz b ir kena ra; n  e y iy  ecek pi şirme  k he sa ba katıl ıyor, n   e d e fa  rklı b esin ti  pler i aras ında ki bi yoyararlanım far klı lıkları… Ya lnızca, b i r b e si nde n  e k  adar ya ğ, p rot ein v  eya karbon h idra t ol duğ u na bakıl ıyo r.