Entre las 6:45 y las 7:40, Atta y Omari, junto con Satam al Suqami, Wail al Shehri y Waleed al Shehri, se registraron y embarcaron en el vuelo 11 de American Airlines con destino a Los Ángeles.
Atta y Omari se sentaron junto a la ventanilla mientras que los otros se sentaron en los pasillos.