Umgeben wird Verdun-sur-Garonne von den Nachbargemeinden Monbéqui im Norden, Bessens im Nordosten, Dieupentale im Osten, Grisolles im Südosten, Aucamville im Süden, Savenès im Südwesten, Bouillac im Westen und Mas-Grenier im Nordwesten.