 Kọ ìparí fún ìpínrọ yìí - Fitzpatrick ló rọpò Fenwick gẹgẹ bí Bíṣọọbù kẹta ti Boston lẹyìn ikú Fenwick ní August 11, 1846. Àwọn ọmọ ìjọ rẹ gba ọmọ ìlú Boston yìí tọyàyàtọyàyà, ó sì di ẹni tí gbogbo ènìyàn mọ sí Bíṣọọbù John. Ó bẹrẹ sí ṣèbẹwò sí gbogbo diocese rẹ lọdún 1847, èyí tó wá kan àwọn ìpínlẹ Massachusetts, Vermont, New Hampshire, àti Maine. Lẹyìn tí Ìyàn Ńlá ti Ireland bẹrẹ : , Fitzpatrick rọ awọn Katoliki lati ṣe alabapin si igbiyanju iranlọwọ ni Ilu Ireland, ni sisọ, Aifẹ ati aibikita, ni ayeye bi eleyi, ko le ṣe iyatọ lati ọdaràn!; nigbamii o fi  20,000 ranṣẹ si Archbishop William Crolly. 