 Kọ itẹsiwaju fun paragirafi yii - Kroos jẹ ọmọ ẹgbẹ pataki ti ẹgbẹ Bayern ti o ṣẹgun treble lakoko akoko 2012  13. Gẹgẹbi ọmọ ẹgbẹ ti o ni ilọsiwaju julọ ti agbedemeji ti o ni Schweinsteiger ati Javi Martínez, Kroos gba awọn ibi-afẹde mẹta ni awọn ẹgbẹ mẹrin Bundesliga mẹrin. Ó tún gba góòlù àkọkọ rẹ nínú ìdíje Champions League nínú ìfẹsẹwọnsẹ ìpele àkókọ ti Bayern lòdì sí Valencia. Lẹyìn tí Kroos farapa nínú ìdíje Champions League quarter-final tí wọn bá Juventus ṣe, kò lè ṣiṣẹ fún ìyókù sáà náà, ó sì pàdánù àṣeyọrí Bayern nínú ìdíje 2013 UEFA Champions League Final. : , 2013 DFB-Pokal Final ati awọn ere meje ti o kẹhin ti akoko Bundesliga. 