 Kọ itẹsiwaju fun paragirafi yii - Morientes ṣe daradara pupọ ni ipolongo 199899, o gba awọn ibi-afẹde 19 ni liigi ati 25 ni awọn ifarahan 38 lapapọ. O tẹsiwaju lati ṣe afihan bọọlu afẹsẹgba ti o ga julọ ni ọdun 19992000, ti o ni awọn akoko 19 ati ipari bi oludije ti o ga julọ ti Real ni ọdun kan nibiti o tun ṣe iranlọwọ fun akọle Champions League keji ti ẹgbẹ olu ilu ni ọdun mẹta, ti o gba ni ikuna 30 ti Valencia CF ni ipari gbogbo Ilu Sipeeni : ó ṣe tán. Ni akoko ti o tẹle, o gba akọkọ ti awọn akọle liigi meji pẹlu ẹgbẹ naa o si gba awọn ibi-afẹde mẹwa ni apapọ, pẹlu mẹrin ninu awọn ifarahan mẹjọ ni Champions League ni idaji ipari ti o jade si awọn aṣeyọri FC Bayern Munich  o padanu awọn ọsẹ to kẹhin nitori ipalara. 