 Kọ itẹsiwaju fun paragirafi yii - Lakoko ibẹrẹ akoko Awọn atunṣe, igbega ti awọn ẹgbẹ oloselu Islam ti yori si idibo Abdurrahman Wahid, oludari ti NU, gẹgẹbi Alakoso kẹrin ti Indonesia, ati ipinnu Amien Rais, oludari ti Muhammadiyah, gẹgẹbi alaga ti Apejọ Igbimọ Awọn eniyan. Àkókò yìí ni ìparun ètò àwùjọ, ìbàjẹ ètò ìṣàkóso àárín gbọngàn, àti ìdìbò àwọn agbófinró wáyé fúngbà díẹ. Wọn fa awọn rogbodiyan iwa-ipa ninu eyiti awọn ẹgbẹ Islam ti kopa, pẹlu ipinya ti Aceh : níbi tí wọn ti ń fẹràn ẹsìn Ìsìláàmù tí kì í ṣe ẹsìn ìbílẹ, tí wọn sì ń fẹràn àwọn ẹsìn míì, àti ìjà tó ń wáyé láàárín àwọn Mùsùlùmí àtàwọn Kristẹni ní Maluku àti Poso. Pẹlu isubu ti iṣeto, MUI bẹrẹ lati yọ ara wọn kuro ni ijọba ati gbiyanju lati lo ipa ti o gbooro si awujọ ilu Islam ti Indonesia. Èyí ló mú kí wọn ṣe àtẹjáde kan tó ń fa awuyewuye lọdún 2005 tí ó ń dá àwọn èrò ti ẹtọ ọmọnìyàn, ẹtọ ọmọnìyàn àti ọpọlọpọlọpọlọpọlọpọlọpọlọpọ lẹbi, tí àwọn ọmọwé tó ń tẹsíwájú sì wá bẹrẹ sí bẹrẹ sí bẹrù rẹ. Àmọ, àyípadà òṣèlú láti ìjọba aláṣẹ sí ìjọba tiwa-n-tiwa lọ pẹlẹpẹlẹ nítorí ìfọkànsí ìfọwọsowọpọ látọdọ àwọn ẹgbẹ òsèlú bíi NU àti Muhammadiyah. Èyí mú kí àwùjọ ará ìlú Mùsùlùmí jẹ apá pàtàkì nínú ìyípadà sí ìjọba tiwa-n-tiwa ní Indonesia. 