 Kọ ìlọsíwájú fún ìpínrọ yìí - Lẹyìn ìkọlù àwọn ará Jámánì ní 1941 : , Merzhanov ni ipa ninu awọn iṣẹ aabo ni ati ni ayika Moscow, o si duro ni ilu naa nigbati Ile-ẹkọ giga ti Architecture lọ si Chimkent. Ní August 1942, wọn mú Merzhanov, ìyàwó rẹ àtàwọn alábàákẹgbẹ rẹ. Ní ọjọ 27 oṣù kejì ọdún 1944, wọn dá ẹjọ fún un ní ọdún mẹwàá ní àgọ ìṣẹniníṣẹẹ nítorí àwọn ìgbòkègbodò tó lòdì sí ìjọba Soviet. Ìdájọ náà fi hàn pé àwọn èèyàn ti mú àwọn ẹrí tí wọn fi kan Merzhanov jáde ní ọdún 1938, wọn sì pa àwọn ẹlẹrìí méjèèjì lọdún kan náà. Merzhanov ni orire to lati firanṣẹ si awọn ibudó Komsomolsk nibiti awọn alaṣẹ ilu, ti o ṣe ifowosowopo pẹlu rẹ bi ọjọgbọn ọfẹ ni awọn ọdun 1930, yọ ọ kuro ni awọn ile-ogun. Ọdún márùn-ún tó tẹ lé e ló fi ṣe olórí ilé ìkọlé kan tí wọn ń pè ní sharashka. Ilé tí Merzhanov kọ ní Komsomolsk jẹ ti ọnà Stalinist tí wọn gbà kọ ilé náà ní ọdún 1930. Ní àkókò yìí, ìyàwó rẹ kú nínú àgọ náà, wọn sì mú ọmọ rẹ, Boris Merzhanov 19291983, ní 1948. 