 Pari gbolohun ti o tẹle: Rooney dun ni 2008 UEFA Super Cup nibi ti United ti padanu si Zenit Saint Petersburg ati pe ko le ṣe ipa. Ní ọjọ kẹrin oṣù kẹwàá ọdún 2008, nígbà tí wọn ṣẹgun Blackburn, Rooney di ọdọmọdé tí ó kópa nínú 200 nínú ìdíje Premier League. Ní ọjọ kejìdínlógún oṣù kejìlá, Rooney gba góòlù méjì nínú 53 semi-final victory over Japanese club Gamba Osaka in the : FIFA Club World Cup, àti, lẹyìn tí ó gba góòlù tí ó jẹ kí United borí LDU Quito 10 nínú ìdíje náà ní Yokohama, ó gba àmì ẹyẹ Golden Ball gẹgẹ bí agbábọọlù tó dára jùlọ nínú ìdíje náà. Ní ọjọ kẹrìnlélógún oṣù kíní lẹyìn tí ó gba àmì ẹyẹ fún ìṣẹjú márùnléláàádọta nínú ìṣẹjú kan tí wọn fi ṣẹgun Wigan, Rooney bọ lọwọ ìṣẹjú kẹjọ. Ní ọjọ 25 oṣù Kẹrin ọdún 2009, Rooney gba góòlù rẹ kẹyìn nínú ìdíje náà nígbà tó ń bá Tottenham jà; United gba góòlù márùn-ún ní ìdajì kejì láti bọ láti 20 sí ìsàlẹ kí wọn sì gba 52; Rooney gba góòlù méjì, ó dá méjì sílẹ, ó sì ṣe ìrànwọ tí ó mú kí wọn gba góòlù àkọkọ fún United. Ní ọjọ 27 oṣù karùn-ún, Rooney bá ikọ Barcelona nínú ìdíje Champions League 2009 tí wọn ṣe ní ìlú Romu, tí United sì pàdánù 2 sí 0. Rooney pari akoko naa pẹlu awọn ibi-afẹde 20 ni gbogbo awọn idije. Lẹẹkan síi, ó tún gba góòlù méjìlá nínú ìdíje náà. 