 Kọkọ parí gbólóhùn yìí: Ọdún 1579 ni Ọba kan tó jẹ ọmọ ilẹ Poland, ìyẹn Stephen Báthory, dá yunifásítì náà sílẹ, orúkọ rẹ ni Jesuit Academy College of Vilnius. O jẹ ile-ẹkọ giga kẹta ti atijọ julọ lẹhin Ile-ẹkọ giga ti Cracow ati Albertina ni Polandii-Lithuania Commonwealth. Nitori awọn ikuna ti awọn Kọkànlá Oṣù Uprising 18301831, awọn ile-ẹkọ giga ti a ti pa ati ki o daduro awọn oniwe-iṣẹ titi 1919. Ni awọn lẹhin ti Ogun Agbaye akọkọ, awọn ile-ẹkọ giga ri kuna igbiyanju lati tun bẹrẹ rẹ nipasẹ agbegbe Polish Society of Friends of Science ni Wilno 1915 ati Kọkànlá Oṣù 1918, Lithuania Oṣù Kejìlá 1918 ati awọn ọmọ ogun Soviet ti o wọle Oṣù Kẹta 1919. O nipari tun bẹrẹ awọn iṣẹ bi Stefan Batory University ni Poland Oṣu Kẹjọ 1919, akoko kan ti o tẹle nipasẹ miiran : Ijọba Soviet ni ọdun 1920, ati kere ju ọdun meji ti Orilẹ-ede Lithuania Central, ti a darapọ mọ Polandii ni ọdun 1922. 