 Pari gbolohun ti o tẹle: Ijọba Alberto Fujimori 19902000 rii pe Awọn ọmọ ogun pada si protagonism ni aaye gbangba, ṣugbọn agbara iṣelu rẹ ti o pọ si mu ki diẹ ninu awọn ọran ti ibajẹ. Ogun abẹle naa pari fun apakan pupọ julọ lẹhin igbekun ni ọdun 1992 ti Abimael Guzmán, oludari ẹgbẹ apanilaya Shining Path, ṣugbọn ogun aala kukuru pẹlu Ecuador bẹrẹ ni ọdun 1995. Lákòókò yìí, àwọn obìnrin wọpọ sí inú Ẹṣọ Ogun gẹgẹ bí àwọn tí wọn ń pè ní ọmọ ogun ní ọdún 1993 àti gẹgẹ bí àwọn òṣìṣẹ ní ọdún 1997. Awọn ọmọ ogun ologun ni ipa pataki ninu isẹ Chavín de Huantar eyiti o fi opin si awọn : Ìṣòro jíjí tí wọn fi àwọn èèyàn ṣe òǹdè ní iléeṣẹ aṣojú ìjọba Japan. Lọdún 1999, ìyẹn ọdún kan lẹyìn tí orílẹ-èdè Ecuador fọwọ sí àdéhùn àlàáfíà pẹlú orílẹ-èdè náà, wọn fòfin de iṣẹ ológun tí wọn ń pè ní iṣẹ àṣesìnlú, wọn sì fi iṣẹ ológun tí kò gba owó oṣù rọpò rẹ fún àwọn ọkùnrin àti obìnrin. 