 Pari gbolohun ti o tẹle: Mkhitaryan ṣe ifilọlẹ akọkọ rẹ ni aṣeyọri 2  0 ni ere iṣaaju-akoko kan lodi si Wigan Athletic ni 15 Keje 2016. Ní ọjọ 7 oṣù kẹjọ ọdún 2016, ó ṣe eré ìdárayá rẹ àkọkọ gẹgẹ bíi olùdíje tí ó wọlé síbi eré ìdárayá náà nígbà tí wọn fi 2 sí 1 ṣẹgun Leicester City nínú ìdíje FA Cup. : 2016 FA Community Shield. Àwọn ojúewé wọnyí jápọ: Ó di ọmọ orílẹ-èdè Armenia àkọkọ tó kópa nínú ìdíje Premier League ní 14 August 2016 nígbà tí ó wọlé gẹgẹ bí olùdíje fún Juan Mata ní ìṣẹjú 75 nínú ìfẹsẹwọnsẹ 31 tí wọn fi ṣẹgun Bournemouth. Ó ṣe ìfilọlẹ àkọkọ rẹ fún Manchester United nínú ìdíje Manchester Derby ní 10 September 2016, ṣùgbọn wọn rọpò rẹ ní ìlàjì eré. 