 Pari gbolohun yii: Ni ọjọ kẹrin oṣu Keje ọdun 2013, Aubameyang darapọ mọ 201213 Champions League finalists Borussia Dortmund lori adehun ọdun marun. O ṣe agbelebu rẹ fun ẹgbẹ tuntun rẹ ni ọjọ 27 Oṣu Keje ọdun 2013 lodi si Bayern Munich ni : DFL-Supercup, ó rọpò Jakub Błaszczykowski fún ìṣẹjú 18 tó kẹyìn nínú ìṣẹgun 4 sí 2 tí Dortmund gba, ó ṣe ìrànwọ fún góòlù tí Dortmund gba, tí Marco Reus gbá. Ní ọjọ 10 oṣù Kẹjọ, Aubameyang ṣe eré àkọkọ rẹ ní Bundesliga, ó sì gba hat-trick kan lòdì sí FC Augsburg, títí kan góòlù kan láti ibọn àkọkọ rẹ nínú ìdíje náà. Ni ilana naa, Aubameyang tun di ẹrọ orin Gabonese akọkọ lati han ni Bundesliga. Ní ọjọ 27 oṣù kọkànlá, ó gba góòlù àkọkọ rẹ nínú ìdíje Champions League nínú ìṣẹgun 3 sí 1 tí wọn fi ṣẹgun Napoli nínú ipele ẹgbẹ ìdíje 2013 sí 2014. Lẹyìn náà, ó gba àbùkù kan lòdì sí 1860 Munich èyí tí ó gbé Dortmund lọ sí ìgbésẹ kejì ti 2013-14 DFB-Pokal, tí ó parí ọdún náà pẹlú góòlù mẹtàlá nínú ìdíje àti góòlù mẹrìndínlógún nínú gbogbo ìdíje. 