 Kọkọ parí gbólóhùn yìí: Nígbà tí Ogun Abẹlé bẹrẹ, Kelly wọ ẹgbẹ ọmọ ogun Union, ó sì wọṣẹ ológun gẹgẹ bí ọgágun nínú Ẹgbẹ E ti Ẹgbẹ Ọmọ Ogun 69th New York Infantry ní Ogun Àkọkọ ti Bull Run. Ó ṣe kápítán fún ìgbà díẹ nínú Ẹgbẹ Ọmọ Ogun Àgbáyé Kẹrìndínlógún. Ní ọjọ kẹrìnlá oṣù kẹsàn-án ọdún 1861, wọn pè é ní ọmọ-ọgá àgbà fún ẹgbẹ ọmọ-ogun ọmọ-ogun ọmọ-ogun 88 ti New York, ó sì ja nínú àwọn ogun ńlá ti Ẹgbẹ ọmọ-ogun Irish ní ọdún 1862. Ó pàṣẹ fún ẹgbẹ ọmọ-ogun náà ní : Ogun tí wọn jà ní Antietam. Nigba ti o wa ni Harpers Ferry lẹhin Ikọja Maryland, o ni igbega si ọgagun ni Oṣu Kẹwa Ọjọ 20, Ọdun 1862. Ó darí àwọn ọmọ ogun náà nínú àwọn ìkọlù tí ó ṣekú pani níwájú Maryes Heights nínú Ogun Fredericksburg. Kelly jẹ olori olori ti Irish Brigade ni opin ọdun 1862. 