 Pari gbolohun yii: Ní ọjọ 8 oṣù Kejìlá ọdún 2016, Mkhitaryan gba góòlù àkọkọ rẹ fún ẹgbẹ náà, níbi tí wọn ti ń bá Zorya Luhansk jà, nínú ìfẹsẹwọnsẹ ẹgbẹ Manchester United tó kẹyìn nínú ìdíje Europa League. Ní ọjọ mẹta lẹyìn náà, nínú ìdíje tí United tún ṣe, Mkhitaryan gba góòlù àkọkọ rẹ nínú ìdíje Premier League àti góòlù àkọkọ rẹ ní Old Trafford nínú ìṣẹgun tí Tottenham Hotspur gba lọwọ wọn, tí wọn fi 10; ṣùgbọn, ó fi eré náà sílẹ ní ìdajì kejì lẹyìn tí ó fara pa nínú ìbàdí rẹ nígbà tí Danny Rose gba bọọlù. O pada lati inu ipalara yii ni awọn ere meji nigbamii, ti o n bọ kuro ni ibusun lati ṣe agbekalẹ ibi-afẹde kẹta ti United lodi si Sunderland, ikọlu ti o ṣe apejuwe bi o ti jẹ ibi-afẹde ti o dara julọ ti o ti ṣe. Ó gba góòlù nínú : 2017 Europa League final láti ran Manchester United lọwọ láti ṣẹgun Ajax 20, ó sì di ọmọ Armenia àkọkọ tó gba ife ẹyẹ ńlá kan ní Yúróòpù. 