الكثيرون معرفة من كان سكانها الأصليون ولكن دون جدوى. على ما يبدو كان هـؤلاء الكنعانيون. وقد ذكرت البلدة في التلمود إذ أنه بعد خراب هيكل سليمان في القدس (عام 70 للميلاد) تم نقل مجلس السنهدرين اليهودي إلى يبنة ثم هوشع وبعدها إلى شفاعمر ثم صفورية فصفد. يؤكد البحث التاريخي وجود السنهدرين، أي المجلس اليهودي الأعلى، في شفاعمر حوالي سنة 150 للميلاد. كذلك وقعت في ضواحي المدينة حوادث هامة في أيام ثورة اليهود على الرومان في نهاية القرن الأولى وبداية القرن الثاني للميلاد، وقد وجدت مغاور وقبور تعود حسب علماء الاثار إلى ذلك العهد. بعد ذلك سكنها على ما يبدو السكان المسيحيون إذ يؤكد ذلك وجود كنيسة من القرن الرابع الملادي في البلدة. ليست هنالك مصادر تاريخية تشرح وضع البلدة بين الفتوحات الإسلامية والحملات الصليبية، وقد زارها الرحالة عبد الغني النابلسي سنة 1792 وبات فيها ليلة ونظم في أهلها بيت شعر يصف فيه كرمهم وحسن ضيافتهم وما كانوا عليه من وفرة عيشة فقال: «زرنا بلدة شفاعمر المعمرة وهي بالخير مغمورة، وقضينا ليلتنا فيها عند شيخ الدالتية». وبعد وصول الصليبيين إلى البلاد انضم الدروز إلى البلدة.
الْكَثِيرُونَ مَعْرِفَةً مَنْ كَانَ سُكَّانُهَا الْأَصْلِيُّونَ وَلَكِنْ دُونَ جَدْوَى. عَلَى مَا يَبْدُو كَانَ هَـؤُلَاءِ الْكَنْعَانِيُّونَ. وَقَدْ ذُكِرَتِ الْبَلْدَةُ فِي التَّلْمُودِ إِذْ أَنَّهُ بَعْدَ خَرَابِ هَيْكَلِ سُلَيْمَانَ فِي الْقُدْسِ (عَامَ 70 لِلْمِيلَادِ) تَمَّ نَقْلُ مَجْلِسِ السَّنْهَدْرِينِ الْيَهُودِيِّ إِلَى يَبْنَةَ ثُمَّ هُوشَعَ وَبَعْدَهَا إِلَى شَفَاعْمَرَ ثُمَّ صَفُّورِيَةً فَصَفَدَ. يُؤَكِّدُ الْبَحْثُ التَّارِيخِيُّ وُجُودَ السَّنْهَدْرِينَ، أَيْ الْمَجْلِسِ الْيَهُودِيِّ الْأَعْلَى، فِي شَفَاعْمَرَ حَوَالَيَ سَنَةَ 150 لِلْمِيلَادِ. كَذَٰلِكَ وَقَعَتْ فِي ضَوَاحِي الْمَدِينَةِ حَوَادِثُ هَامَّةٌ فِي أَيَّامِ ثَوْرَةِ الْيَهُودِ عَلَى الرُّومَانِ فِي نِهَايَةِ الْقَرْنِ الأُولَىٰ وَبِدَايَةِ الْقَرْنِ الثَّانِي لِلْمِيلَادِ، وَقَدْ وُجِدَتْ مَغَاوِرُ وَقُبُورٌ تَعُودُ حَسَبَ عُلَمَاءِ الْآثَارِ إِلَى ذَٰلِكَ الْعَهْدِ. بَعْدَ ذَٰلِكَ سَكَنَهَا عَلَى مَا يَبْدُو السُّكَّانُ الْمَسِيحِيُّونَ إِذْ يُؤَكِّدُ ذَٰلِكَ وُجُودُ كَنِيسَةٍ مِّنَ الْقَرْنِ الرَّابِعِ الْمِلَادِيِّ فِي الْبَلْدَةِ. لَيْسَتْ هُنَالِكَ مَصَادِرُ تَارِيخِيَّةٌ تَشْرَحُ وَضْعَ الْبَلْدَةِ بَيْنَ الْفَتُوحَاتِ الْإِسْلَامِيَّةِ وَالْحَمَلَاتِ الصَّلِيبِيَّةِ، وَقَدْ زَارَهَا الرَّحَّالَةُ عَبْدُ الْغَنِيِّ النَّابُلْسِيُّ سَنَةَ 1792 وَبَاتَ فِيهَا لَيْلَةً وَنَظَمَ فِي أَهْلِهَا بَيْتَ شِعْرٍ يَصِفُ فِيهِ كَرَمَهُمْ وَحُسْنَ ضِيَافَتِهِمْ وَمَا كَانُوا عَلَيْهِ مِّنْ وَفْرَةِ عَيْشَةٍ فَقَالَ: «زَرْنَا بَلْدَةَ شَفَاعْمَرَ الْمُعَمَّرَةَ وَهِيَ بِالْخَيْرِ مَغْمُورَةٌ، وَقَضَيْنَا لَيْلَتَنَا فِيهَا عِندَ شَيْخِ الدَّالَتِيَّةِ». وَبَعْدَ وَصُولِ الصَّلِيبِيِّينَ إِلَى الْبِلَادِ انْضَمَّ الدُّرُوزُ إِلَى الْبَلْدَةِ.